Cluster ID: MEP19

Size 8
Phase 2
Pfam domain ID Unknown
Exon block sizes in the Microexon-tag 50,8,50
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq GYRKCWMAYCGTGAWCCTCGWTTTMGRTCYMRWAYKCRWGAYRRTGAAGGRTCTCAAGGTAARYCTGARGTRTCWRCYRTTGTTTATAAAGYTGGTGARTGCATGCAA
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP19 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_5:2730454-2730461:-MEP19A. thaliana527304542730461-8
Gm_10:40983726-40983733:-MEP19G. max104098372640983733-8
Gm_16:36758916-36758923:+MEP19G. max163675891636758923+8
Gm_20:45057409-45057416:+MEP19G. max204505740945057416+8
Gm_9:38053568-38053575:+MEP19G. max93805356838053575+8
Ha_11:83289457-83289464:+MEP19H. annuus118328945783289464+8
Os_7:17280489-17280496:+MEP19O. sativa71728048917280496+8
Pp_8:2974751-2974758:+MEP19P. patens829747512974758+8
Ps_NC_039360.1:48489515-48489522:+MEP19P. somniferumNC_039360.14848951548489522+8
Ps_NC_039365.1:38724011-38724018:+MEP19P. somniferumNC_039365.13872401138724018+8
Zm_2:216691490-216691497:-MEP19Z. mays2216691490216691497-8
Zm_4:75671004-75671011:+MEP19Z. mays47567100475671011+8
Hv_3H:75163835-75163842:+MEP19H. vulgare3H7516383575163842+8
Pt_18:15330087-15330094:+MEP19P. trichocarpa181533008715330094+8
Pt_18:15412976-15412983:+MEP19P. trichocarpa181541297615412983+8
Pt_4:15705196-15705203:+MEP19P. trichocarpa41570519615705203+8
Pt_scaffold_25:353981-353988:+MEP19P. trichocarpascaffold_25353981353988+8
Sb_1:80660754-80660761:-MEP19S. bicolor18066075480660761-8
Sb_7:50952246-50952253:+MEP19S. bicolor75095224650952253+8
Sl_5:66532072-66532079:-MEP19S. lycopersicum56653207266532079-8
Ta_3A:102682950-102682957:+MEP19T. aestivum3A102682950102682957+8
Ta_3B:136481779-136481786:+MEP19T. aestivum3B136481779136481786+8
Ta_3D:86354335-86354342:+MEP19T. aestivum3D8635433586354342+8
Nicotiana_tabacum_NW_015910019.1:57292-57299:+MEP19Nicotiana tabacumNW_015910019.15729257299+8
Nicotiana_tabacum_NW_015933631.1:9803-9810:+MEP19Nicotiana tabacumNW_015933631.198039810+8
Triticum_dicoccoides_NC_041384.1:100333791-100333798:+MEP19Triticum dicoccoidesNC_041384.1100333791100333798+8
Triticum_dicoccoides_NC_041385.1:149531485-149531492:+MEP19Triticum dicoccoidesNC_041385.1149531485149531492+8
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017933456.1:9368-9375:-MEP19Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017933456.193689375-8
Nicotiana_sylvestris_NW_009359664.1:21336-21343:-MEP19Nicotiana sylvestrisNW_009359664.12133621343-8
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008939419.1:35135-35142:-MEP19Nicotiana tomentosiformisNW_008939419.13513535142-8
Camellia_sinensis_NW_021025403.1:119975-119982:-MEP19Camellia sinensisNW_021025403.1119975119982-8
Nicotiana_attenuata_NW_017670573.1:490331-490338:-MEP19Nicotiana attenuataNW_017670573.1490331490338-8
Capsicum_annuum_NC_029988.1:229701101-229701108:-MEP19Capsicum annuumNC_029988.1229701101229701108-8
Colocasia_esculenta_CM024764.1:72857791-72857798:+MEP19Colocasia esculentaCM024764.17285779172857798+8
Helianthus_annuus_NC_035443.2:133475329-133475336:-MEP19Helianthus annuusNC_035443.2133475329133475336-8
Papaver_somniferum_NC_039360.1:48489515-48489522:+MEP19Papaver somniferumNC_039360.14848951548489522+8
Papaver_somniferum_NC_039365.1:38724011-38724018:+MEP19Papaver somniferumNC_039365.13872401138724018+8
Arachis_hypogaea_NC_037622.1:88307654-88307661:+MEP19Arachis hypogaeaNC_037622.18830765488307661+8
Arachis_hypogaea_NC_037632.1:155694266-155694273:+MEP19Arachis hypogaeaNC_037632.1155694266155694273+8
Arachis_hypogaea_NC_037626.1:81181783-81181790:-MEP19Arachis hypogaeaNC_037626.18118178381181790-8
Arachis_hypogaea_NC_037636.1:107818008-107818015:-MEP19Arachis hypogaeaNC_037636.1107818008107818015-8
Gossypium_hirsutum_NC_030096.1:15940848-15940855:+MEP19Gossypium hirsutumNC_030096.11594084815940855+8
Gossypium_hirsutum_NC_030098.1:46573343-46573350:-MEP19Gossypium hirsutumNC_030098.14657334346573350-8
Hevea_brasiliensis_NW_018746078.1:931631-931638:+MEP19Hevea brasiliensisNW_018746078.1931631931638+8
Liriodendron_chinense_PVNU02000868.1:279458-279465:+MEP19Liriodendron chinensePVNU02000868.1279458279465+8
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036238.1:10008883-10008890:+MEP19Olea europaea var.  sylvestrisNC_036238.11000888310008890+8
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036253.1:18819694-18819701:+MEP19Olea europaea var.  sylvestrisNC_036253.11881969418819701+8
Persea_americana_SDSS01000087.1:345744-345751:-MEP19Persea americanaSDSS01000087.1345744345751-8
Zea_mays_NC_050099.1:75875258-75875265:+MEP19Zea maysNC_050099.17587525875875265+8
Zea_mays_NC_050097.1:216670880-216670887:-MEP19Zea maysNC_050097.1216670880216670887-8
Gossypium_arboreum_NC_030665.1:17219200-17219207:+MEP19Gossypium arboreumNC_030665.11721920017219207+8
Hibiscus_syriacus_NW_024061947.1:10709812-10709819:+MEP19Hibiscus syriacusNW_024061947.11070981210709819+8
Hibiscus_syriacus_NW_024063539.1:6268026-6268033:+MEP19Hibiscus syriacusNW_024063539.162680266268033+8
Hibiscus_syriacus_NW_024063078.1:3768230-3768237:-MEP19Hibiscus syriacusNW_024063078.137682303768237-8
Prosopis_alba_NW_021634275.1:10203-10210:-MEP19Prosopis albaNW_021634275.11020310210-8
Prosopis_alba_NW_021635746.1:74449-74456:-MEP19Prosopis albaNW_021635746.17444974456-8
Quercus_suber_NW_019826381.1:1285932-1285939:-MEP19Quercus suberNW_019826381.112859321285939-8
Arachis_duranensis_NC_029776.2:82634270-82634277:+MEP19Arachis duranensisNC_029776.28263427082634277+8
Arachis_duranensis_NC_029780.2:82365269-82365276:-MEP19Arachis duranensisNC_029780.28236526982365276-8
Arachis_ipaensis_NC_029789.2:144747719-144747726:+MEP19Arachis ipaensisNC_029789.2144747719144747726+8
Arachis_ipaensis_NC_029793.2:99281838-99281845:-MEP19Arachis ipaensisNC_029793.29928183899281845-8
Asparagus_officinalis_NC_033803.1:30189818-30189825:+MEP19Asparagus officinalisNC_033803.13018981830189825+8
Coffea_arabica_NC_039910.1:34702726-34702733:-MEP19Coffea arabicaNC_039910.13470272634702733-8
Coffea_arabica_NC_039910.1:34771659-34771666:-MEP19Coffea arabicaNC_039910.13477165934771666-8
Coffea_arabica_NC_039911.1:29858401-29858408:-MEP19Coffea arabicaNC_039911.12985840129858408-8
Coffea_arabica_NC_039911.1:29905576-29905583:-MEP19Coffea arabicaNC_039911.12990557629905583-8
Coffea_eugenioides_NC_040041.1:33769095-33769102:-MEP19Coffea eugenioidesNC_040041.13376909533769102-8
Coffea_eugenioides_NC_040041.1:33823510-33823517:-MEP19Coffea eugenioidesNC_040041.13382351033823517-8
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NW_020200612.1:164356-164363:+MEP19Cynara cardunculus var.  scolymusNW_020200612.1164356164363+8
Dendrobium_catenatum_NW_021501429.1:30784-30791:+MEP19Dendrobium catenatumNW_021501429.13078430791+8
Glycine_soja_NC_041021.1:48109756-48109763:+MEP19Glycine sojaNC_041021.14810975648109763+8
Glycine_soja_NC_041011.1:42557117-42557124:-MEP19Glycine sojaNC_041011.14255711742557124-8
Actinidia_rufa_BJWL01000005.1:758785-758792:-MEP19Actinidia rufaBJWL01000005.1758785758792-8
Benincasa_hispida_NC_052358.1:43783014-43783021:+MEP19Benincasa hispidaNC_052358.14378301443783021+8
Cajanus_cajan_NW_017984335.1:16268-16275:+MEP19Cajanus cajanNW_017984335.11626816275+8
Cannabis_sativa_NC_044375.1:96126397-96126404:+MEP19Cannabis sativaNC_044375.19612639796126404+8
Cicer_arietinum_NC_021163.1:3742955-3742962:+MEP19Cicer arietinumNC_021163.137429553742962+8
Cicer_arietinum_NC_021167.1:10287325-10287332:+MEP19Cicer arietinumNC_021167.11028732510287332+8
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000009.1:38109271-38109278:-MEP19Cinnamomum micranthumQPKB01000009.13810927138109278-8
Coffea_canephora_HG974434.1:19250982-19250989:-MEP19Coffea canephoraHG974434.11925098219250989-8
Coffea_canephora_HG974434.1:19309648-19309655:-MEP19Coffea canephoraHG974434.11930964819309655-8
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052486.1:18328508-18328515:+MEP19Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052486.11832850818328515+8
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052479.1:30628123-30628130:-MEP19Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052479.13062812330628130-8
Durio_zibethinus_NW_019167860.1:1875158-1875165:-MEP19Durio zibethinusNW_019167860.118751581875165-8
Durio_zibethinus_NW_019167993.1:12960476-12960483:-MEP19Durio zibethinusNW_019167993.11296047612960483-8
Eucalyptus_grandis_NC_052620.1:842670-842677:+MEP19Eucalyptus grandisNC_052620.1842670842677+8
Glycine_max_NC_038256.1:45057409-45057416:+MEP19Glycine maxNC_038256.14505740945057416+8
Glycine_max_NC_038246.1:40983726-40983733:-MEP19Glycine maxNC_038246.14098372640983733-8
Gossypium_raimondii_NC_026930.1:14452949-14452956:-MEP19Gossypium raimondiiNC_026930.11445294914452956-8
Lupinus_angustifolius_NC_032012.1:21352166-21352173:+MEP19Lupinus angustifoliusNC_032012.12135216621352173+8
Lupinus_angustifolius_NC_032016.1:3370549-3370556:+MEP19Lupinus angustifoliusNC_032016.133705493370556+8
Lupinus_angustifolius_NC_032028.1:6808258-6808265:-MEP19Lupinus angustifoliusNC_032028.168082586808265-8
Piper_nigrum_Pn5:10344963-10344970:-MEP19Piper nigrumPn51034496310344970-8
Piper_nigrum_Pn7:10165077-10165084:-MEP19Piper nigrumPn71016507710165084-8
Piper_nigrum_Pn7:10374185-10374192:-MEP19Piper nigrumPn71037418510374192-8
Piper_nigrum_Pn7:10450841-10450848:-MEP19Piper nigrumPn71045084110450848-8
Pistacia_vera_NW_022196523.1:592040-592047:+MEP19Pistacia veraNW_022196523.1592040592047+8
Populus_euphratica_NW_011500568.1:103283-103290:+MEP19Populus euphraticaNW_011500568.1103283103290+8
Populus_euphratica_NW_011501464.1:13424-13431:+MEP19Populus euphraticaNW_011501464.11342413431+8
Populus_euphratica_NW_011501638.1:2941-2948:+MEP19Populus euphraticaNW_011501638.129412948+8
Quercus_lobata_NC_044913.1:37586485-37586492:-MEP19Quercus lobataNC_044913.13758648537586492-8
Solanum_lycopersicum_NC_015442.3:66532072-66532079:-MEP19Solanum lycopersicumNC_015442.36653207266532079-8
Solanum_pennellii_NC_028641.1:77782348-77782355:-MEP19Solanum pennelliiNC_028641.17778234877782355-8
Solanum_tuberosum_NW_006238999.1:250633-250640:+MEP19Solanum tuberosumNW_006238999.1250633250640+8
Syzygium_oleosum_NW_022076640.1:333295-333302:+MEP19Syzygium oleosumNW_022076640.1333295333302+8
Abrus_precatorius_NW_020874417.1:26476564-26476571:-MEP19Abrus precatoriusNW_020874417.12647656426476571-8
Ananas_comosus_NC_033631.1:10257598-10257605:-MEP19Ananas comosusNC_033631.11025759810257605-8
Ananas_comosus_NC_033636.1:8471713-8471720:-MEP19Ananas comosusNC_033636.184717138471720-8
Carica_papaya_NW_019014554.1:666420-666427:+MEP19Carica papayaNW_019014554.1666420666427+8
Ceratophyllum_demersum_1:39267907-39267914:-MEP19Ceratophyllum demersum13926790739267914-8
Citrus_sinensis_NC_023046.1:22853993-22854000:+MEP19Citrus sinensisNC_023046.12285399322854000+8
Cucumis_melo_NW_007546326.1:202725-202732:-MEP19Cucumis meloNW_007546326.1202725202732-8
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030383.1:9409036-9409043:+MEP19Daucus carota subsp.  sativusNC_030383.194090369409043+8
Erythranthe_guttata_NW_012192934.1:7947-7954:+MEP19Erythranthe guttataNW_012192934.179477954+8
Jatropha_curcas_NW_023590567.1:2060378-2060385:+MEP19Jatropha curcasNW_023590567.120603782060385+8
Juglans_regia_NC_049906.1:38522829-38522836:+MEP19Juglans regiaNC_049906.13852282938522836+8
Juglans_regia_NC_049915.1:20347070-20347077:-MEP19Juglans regiaNC_049915.12034707020347077-8
Macleaya_cordata_MVGT01001726.1:239434-239441:+MEP19Macleaya cordataMVGT01001726.1239434239441+8
Malus_domestica_NC_041803.1:10445133-10445140:-MEP19Malus domesticaNC_041803.11044513310445140-8
Manihot_esculenta_NC_035173.1:27980225-27980232:+MEP19Manihot esculentaNC_035173.12798022527980232+8
Medicago_truncatula_NC_053042.1:38265858-38265865:+MEP19Medicago truncatulaNC_053042.13826585838265865+8
Medicago_truncatula_NC_053047.1:31933904-31933911:+MEP19Medicago truncatulaNC_053047.13193390431933911+8
Morus_notabilis_NW_010361025.1:37075-37082:-MEP19Morus notabilisNW_010361025.13707537082-8
Panicum_hallii_NC_038045.1:48507833-48507840:+MEP19Panicum halliiNC_038045.14850783348507840+8
Phaseolus_vulgaris_NC_023753.1:15551042-15551049:+MEP19Phaseolus vulgarisNC_023753.11555104215551049+8
Physcomitrella_patens_NC_037260.1:2974751-2974758:+MEP19Physcomitrella patensNC_037260.129747512974758+8
Populus_alba_NW_023271245.1:65010-65017:+MEP19Populus albaNW_023271245.16501065017+8
Populus_alba_NW_023271464.1:1176020-1176027:+MEP19Populus albaNW_023271464.111760201176027+8
Populus_trichocarpa_NC_037288.1:15587774-15587781:+MEP19Populus trichocarpaNC_037288.11558777415587781+8
Populus_trichocarpa_NW_020167890.1:18695-18702:+MEP19Populus trichocarpaNW_020167890.11869518702+8
Populus_trichocarpa_NW_020167874.1:509750-509757:-MEP19Populus trichocarpaNW_020167874.1509750509757-8
Prunus_avium_NW_018922639.1:35518-35525:-MEP19Prunus aviumNW_018922639.13551835525-8
Rhodamnia_argentea_NW_022060998.1:131887-131894:+MEP19Rhodamnia argenteaNW_022060998.1131887131894+8
Rhododendron_simsii_CM024962.1:19814974-19814981:-MEP19Rhododendron simsiiCM024962.11981497419814981-8
Ricinus_communis_NW_002994326.1:1038060-1038067:+MEP19Ricinus communisNW_002994326.110380601038067+8
Rosa_chinensis_NC_037090.1:31607974-31607981:+MEP19Rosa chinensisNC_037090.13160797431607981+8
Sorghum_bicolor_NC_012876.2:50952246-50952253:+MEP19Sorghum bicolorNC_012876.25095224650952253+8
Sorghum_bicolor_NC_012870.2:80660754-80660761:-MEP19Sorghum bicolorNC_012870.28066075480660761-8
Tripterygium_wilfordii_NC_052233.1:9679475-9679482:-MEP19Tripterygium wilfordiiNC_052233.196794759679482-8
Tripterygium_wilfordii_NC_052238.1:3866537-3866544:-MEP19Tripterygium wilfordiiNC_052238.138665373866544-8
Vigna_angularis_NC_030638.1:25322569-25322576:+MEP19Vigna angularisNC_030638.12532256925322576+8
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028358.1:34143337-34143344:-MEP19Vigna radiata var.  radiataNC_028358.13414333734143344-8
Vigna_unguiculata_NC_040285.1:28140969-28140976:-MEP19Vigna unguiculataNC_040285.12814096928140976-8
Ziziphus_jujuba_NC_029682.1:6883072-6883079:+MEP19Ziziphus jujubaNC_029682.168830726883079+8
Ziziphus_jujuba_NW_015453987.1:34527-34534:+MEP19Ziziphus jujubaNW_015453987.13452734534+8
Ziziphus_jujuba_NW_015453727.1:55160-55167:-MEP19Ziziphus jujubaNW_015453727.15516055167-8
Ziziphus_jujuba_NW_015453988.1:18964-18971:-MEP19Ziziphus jujubaNW_015453988.11896418971-8
Aquilegia_coerulea_KZ305040.1:542732-542739:-MEP19Aquilegia coeruleaKZ305040.1542732542739-8
Brachypodium_distachyon_NC_016131.3:16412372-16412379:-MEP19Brachypodium distachyonNC_016131.31641237216412379-8
Citrus_clementina_NW_006262075.1:5734789-5734796:-MEP19Citrus clementinaNW_006262075.157347895734796-8
Cucumis_sativus_NC_026656.2:15636104-15636111:+MEP19Cucumis sativusNC_026656.21563610415636111+8
Cucurbita_maxima_NW_019272057.1:1529375-1529382:+MEP19Cucurbita maximaNW_019272057.115293751529382+8
Cucurbita_maxima_NW_019272086.1:209290-209297:-MEP19Cucurbita maximaNW_019272086.1209290209297-8
Cucurbita_moschata_NW_019268529.1:5295076-5295083:+MEP19Cucurbita moschataNW_019268529.152950765295083+8
Cucurbita_moschata_NW_019268589.1:371580-371587:-MEP19Cucurbita moschataNW_019268589.1371580371587-8
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036642.1:10765654-10765661:+MEP19Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036642.11076565410765661+8
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036653.1:1900817-1900824:-MEP19Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036653.119008171900824-8
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020491.1:22443808-22443815:+MEP19Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020491.12244380822443815+8
Herrania_umbratica_NW_018397293.1:265512-265519:+MEP19Herrania umbraticaNW_018397293.1265512265519+8
Oryza_brachyantha_NC_023169.1:9418416-9418423:+MEP19Oryza brachyanthaNC_023169.194184169418423+8
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029262.1:17280489-17280496:+MEP19Oryza sativa Japonica GroupNC_029262.11728048917280496+8
Prunus_dulcis_NC_047653.1:22989212-22989219:+MEP19Prunus dulcisNC_047653.12298921222989219+8
Prunus_mume_NC_024128.1:21516157-21516164:-MEP19Prunus mumeNC_024128.12151615721516164-8
Prunus_persica_NC_034012.1:23712071-23712078:+MEP19Prunus persicaNC_034012.12371207123712078+8
Punica_granatum_NC_045132.1:148942-148949:+MEP19Punica granatumNC_045132.1148942148949+8
Sesamum_indicum_NC_026150.1:25033778-25033785:+MEP19Sesamum indicumNC_026150.12503377825033785+8
Theobroma_cacao_NC_030856.1:17761980-17761987:+MEP19Theobroma cacaoNC_030856.11776198017761987+8