Cluster ID: MEP17

Size 8
Phase 1
Pfam domain ID IP_trans
Exon block sizes in the Microexon-tag 49,8,51
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq CTYRYSRTGCAAGAGGAAKCYTGGWATGCRTAYCCAARRWGCARAACAGTRATCAAGTGCCCRYAYTTYASCAAGTKYWCWYTRACCATTGAMACYRTYMAYARRSCY
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP17 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
Os_3:9905784-9905791:-MEP17O. sativa399057849905791-8
Pp_15:14706063-14706070:+MEP17P. patens151470606314706070+8
Pp_21:1029479-1029486:+MEP17P. patens2110294791029486+8
Pp_9:16367165-16367172:+MEP17P. patens91636716516367172+8
Ps_NC_039366.1:28283026-28283033:+MEP17P. somniferumNC_039366.12828302628283033+8
Ps_NC_039368.1:80588987-80588994:+MEP17P. somniferumNC_039368.18058898780588994+8
Vv_6:4230938-4230945:+MEP17V. vinifera642309384230945+8
Zm_1:44245964-44245971:-MEP17Z. mays14424596444245971-8
Hv_4H:456172161-456172168:+MEP17H. vulgare4H456172161456172168+8
Sb_1:69297151-69297158:+MEP17S. bicolor16929715169297158+8
Sl_6:120141-120148:+MEP17S. lycopersicum6120141120148+8
Ta_4A:123075496-123075503:-MEP17T. aestivum4A123075496123075503-8
Ta_4B:424749553-424749560:+MEP17T. aestivum4B424749553424749560+8
Ta_4D:342790975-342790982:+MEP17T. aestivum4D342790975342790982+8
Nicotiana_tabacum_NW_015859628.1:14908-14915:+MEP17Nicotiana tabacumNW_015859628.11490814915+8
Nicotiana_tabacum_NW_015889619.1:5464-5471:-MEP17Nicotiana tabacumNW_015889619.154645471-8
Nicotiana_tabacum_NW_015900810.1:47558-47565:-MEP17Nicotiana tabacumNW_015900810.14755847565-8
Nicotiana_tabacum_NW_015954807.1:18550-18557:-MEP17Nicotiana tabacumNW_015954807.11855018557-8
Triticum_dicoccoides_NC_041387.1:435559787-435559794:+MEP17Triticum dicoccoidesNC_041387.1435559787435559794+8
Triticum_dicoccoides_NC_041386.1:124208072-124208079:-MEP17Triticum dicoccoidesNC_041386.1124208072124208079-8
Ginkgo_biloba_Chr5:139411756-139411763:-MEP17Ginkgo bilobaChr5139411756139411763-8
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017908447.1:231570-231577:+MEP17Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017908447.1231570231577+8
Nicotiana_sylvestris_NW_009561359.1:21380-21387:+MEP17Nicotiana sylvestrisNW_009561359.12138021387+8
Nicotiana_sylvestris_NW_009556053.1:1736-1743:-MEP17Nicotiana sylvestrisNW_009556053.117361743-8
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008828894.1:7030-7037:-MEP17Nicotiana tomentosiformisNW_008828894.170307037-8
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008841203.1:18639-18646:-MEP17Nicotiana tomentosiformisNW_008841203.11863918646-8
Camellia_sinensis_NW_021024752.1:95663-95670:+MEP17Camellia sinensisNW_021024752.19566395670+8
Nicotiana_attenuata_NW_017670590.1:425060-425067:+MEP17Nicotiana attenuataNW_017670590.1425060425067+8
Nicotiana_attenuata_NW_017673024.1:132426-132433:-MEP17Nicotiana attenuataNW_017673024.1132426132433-8
Capsicum_annuum_NC_029982.1:179027287-179027294:+MEP17Capsicum annuumNC_029982.1179027287179027294+8
Lactuca_sativa_NW_019683394.1:850682-850689:+MEP17Lactuca sativaNW_019683394.1850682850689+8
Papaver_somniferum_NC_039366.1:28283026-28283033:+MEP17Papaver somniferumNC_039366.12828302628283033+8
Papaver_somniferum_NC_039368.1:80588987-80588994:+MEP17Papaver somniferumNC_039368.18058898780588994+8
Elaeis_guineensis_NC_025997.1:3656481-3656488:-MEP17Elaeis guineensisNC_025997.136564813656488-8
Gossypium_hirsutum_NC_030087.1:14086181-14086188:+MEP17Gossypium hirsutumNC_030087.11408618114086188+8
Gossypium_hirsutum_NC_030083.1:54484620-54484627:-MEP17Gossypium hirsutumNC_030083.15448462054484627-8
Gossypium_hirsutum_NC_030086.1:47840966-47840973:-MEP17Gossypium hirsutumNC_030086.14784096647840973-8
Hevea_brasiliensis_NW_018746159.1:408175-408182:+MEP17Hevea brasiliensisNW_018746159.1408175408182+8
Hevea_brasiliensis_NW_018745718.1:777502-777509:-MEP17Hevea brasiliensisNW_018745718.1777502777509-8
Zea_mays_NC_050096.1:43869531-43869538:-MEP17Zea maysNC_050096.14386953143869538-8
Chenopodium_quinoa_NW_018744633.1:1560624-1560631:-MEP17Chenopodium quinoaNW_018744633.115606241560631-8
Gossypium_arboreum_NC_030673.1:21656065-21656072:+MEP17Gossypium arboreumNC_030673.12165606521656072+8
Gossypium_arboreum_NC_030674.1:78577603-78577610:-MEP17Gossypium arboreumNC_030674.17857760378577610-8
Hibiscus_syriacus_NW_024061811.1:1414181-1414188:+MEP17Hibiscus syriacusNW_024061811.114141811414188+8
Hibiscus_syriacus_NW_024062730.1:1377935-1377942:+MEP17Hibiscus syriacusNW_024062730.113779351377942+8
Hibiscus_syriacus_NW_024061944.1:352249-352256:-MEP17Hibiscus syriacusNW_024061944.1352249352256-8
Hibiscus_syriacus_NW_024062780.1:463461-463468:-MEP17Hibiscus syriacusNW_024062780.1463461463468-8
Hibiscus_syriacus_NW_024062896.1:1053281-1053288:-MEP17Hibiscus syriacusNW_024062896.110532811053288-8
Hibiscus_syriacus_NW_024063030.1:477723-477730:-MEP17Hibiscus syriacusNW_024063030.1477723477730-8
Quercus_suber_NW_019809864.1:241443-241450:+MEP17Quercus suberNW_019809864.1241443241450+8
Asparagus_officinalis_NC_033800.1:9485438-9485445:-MEP17Asparagus officinalisNC_033800.194854389485445-8
Coffea_arabica_NC_039898.1:43882138-43882145:+MEP17Coffea arabicaNC_039898.14388213843882145+8
Coffea_arabica_NC_039899.1:40564333-40564340:+MEP17Coffea arabicaNC_039899.14056433340564340+8
Coffea_eugenioides_NC_040035.1:53188966-53188973:-MEP17Coffea eugenioidesNC_040035.15318896653188973-8
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037528.1:44756914-44756921:+MEP17Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037528.14475691444756921+8
Cannabis_sativa_NC_044375.1:92297378-92297385:-MEP17Cannabis sativaNC_044375.19229737892297385-8
Coffea_canephora_HG974428.1:30289558-30289565:+MEP17Coffea canephoraHG974428.13028955830289565+8
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052482.1:20385994-20386001:+MEP17Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052482.12038599420386001+8
Durio_zibethinus_NW_019168159.1:6002166-6002173:-MEP17Durio zibethinusNW_019168159.160021666002173-8
Eucalyptus_grandis_NC_052613.1:41204473-41204480:-MEP17Eucalyptus grandisNC_052613.14120447341204480-8
Gossypium_raimondii_NC_026934.1:37150722-37150729:+MEP17Gossypium raimondiiNC_026934.13715072237150729+8
Gossypium_raimondii_NC_026937.1:5710617-5710624:+MEP17Gossypium raimondiiNC_026937.157106175710624+8
Ipomoea_nil_NW_017618262.1:4086294-4086301:+MEP17Ipomoea nilNW_017618262.140862944086301+8
Ipomoea_nil_NW_017616574.1:1610650-1610657:-MEP17Ipomoea nilNW_017616574.116106501610657-8
Nelumbo_nucifera_NW_010729085.1:5698287-5698294:-MEP17Nelumbo nuciferaNW_010729085.156982875698294-8
Phoenix_dactylifera_NC_052394.1:2737225-2737232:-MEP17Phoenix dactyliferaNC_052394.127372252737232-8
Pistacia_vera_NW_022196166.1:142703-142710:+MEP17Pistacia veraNW_022196166.1142703142710+8
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988099.1:106762-106769:+MEP17Pyrus x bretschneideriNW_008988099.1106762106769+8
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988519.1:303374-303381:+MEP17Pyrus x bretschneideriNW_008988519.1303374303381+8
Quercus_lobata_NC_044904.1:36765077-36765084:-MEP17Quercus lobataNC_044904.13676507736765084-8
Quercus_lobata_NC_044904.1:36877077-36877084:-MEP17Quercus lobataNC_044904.13687707736877084-8
Solanum_lycopersicum_NC_015443.3:120141-120148:+MEP17Solanum lycopersicumNC_015443.3120141120148+8
Solanum_pennellii_NC_028642.1:157708-157715:+MEP17Solanum pennelliiNC_028642.1157708157715+8
Solanum_tuberosum_NW_006238970.1:2265586-2265593:+MEP17Solanum tuberosumNW_006238970.122655862265593+8
Syzygium_oleosum_NW_022076586.1:105353-105360:-MEP17Syzygium oleosumNW_022076586.1105353105360-8
Ananas_comosus_NC_033638.1:9846602-9846609:+MEP17Ananas comosusNC_033638.198466029846609+8
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NW_017567509.1:106632-106639:+MEP17Beta vulgaris subsp.  vulgarisNW_017567509.1106632106639+8
Carica_papaya_NW_019014378.1:38038-38045:-MEP17Carica papayaNW_019014378.13803838045-8
Citrus_sinensis_NC_023053.1:20067285-20067292:+MEP17Citrus sinensisNC_023053.12006728520067292+8
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030382.1:13888695-13888702:+MEP17Daucus carota subsp.  sativusNC_030382.11388869513888702+8
Erythranthe_guttata_NW_012193250.1:1594582-1594589:+MEP17Erythranthe guttataNW_012193250.115945821594589+8
Ipomoea_triloba_NC_044929.1:19538140-19538147:+MEP17Ipomoea trilobaNC_044929.11953814019538147+8
Ipomoea_triloba_NC_044919.1:33126031-33126038:-MEP17Ipomoea trilobaNC_044919.13312603133126038-8
Jatropha_curcas_NW_023591413.1:11101-11108:-MEP17Jatropha curcasNW_023591413.11110111108-8
Juglans_regia_NC_049905.1:9951173-9951180:-MEP17Juglans regiaNC_049905.199511739951180-8
Juglans_regia_NC_049914.1:11119379-11119386:-MEP17Juglans regiaNC_049914.11111937911119386-8
Macleaya_cordata_MVGT01002043.1:760298-760305:+MEP17Macleaya cordataMVGT01002043.1760298760305+8
Malus_domestica_NC_041791.1:9721897-9721904:-MEP17Malus domesticaNC_041791.197218979721904-8
Malus_domestica_NC_041799.1:11409974-11409981:-MEP17Malus domesticaNC_041799.11140997411409981-8
Manihot_esculenta_NC_035164.1:2702305-2702312:+MEP17Manihot esculentaNC_035164.127023052702312+8
Morus_notabilis_NW_010364141.1:390895-390902:+MEP17Morus notabilisNW_010364141.1390895390902+8
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025207.1:23637556-23637563:+MEP17Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025207.12363755623637563+8
Panicum_hallii_NC_038050.1:64959229-64959236:+MEP17Panicum halliiNC_038050.16495922964959236+8
Physcomitrella_patens_NC_037261.1:16367165-16367172:+MEP17Physcomitrella patensNC_037261.11636716516367172+8
Physcomitrella_patens_NC_037267.1:14706063-14706070:+MEP17Physcomitrella patensNC_037267.11470606314706070+8
Physcomitrella_patens_NC_037273.1:1029479-1029486:+MEP17Physcomitrella patensNC_037273.110294791029486+8
Prunus_avium_NW_018921511.1:524821-524828:-MEP17Prunus aviumNW_018921511.1524821524828-8
Rhodamnia_argentea_NW_022060921.1:448164-448171:+MEP17Rhodamnia argenteaNW_022060921.1448164448171+8
Ricinus_communis_NW_002994502.1:18113-18120:-MEP17Ricinus communisNW_002994502.11811318120-8
Rosa_chinensis_NC_037092.1:66301597-66301604:+MEP17Rosa chinensisNC_037092.16630159766301604+8
Setaria_italica_NC_028458.1:49407589-49407596:+MEP17Setaria italicaNC_028458.14940758949407596+8
Setaria_viridis_NC_048271.1:47010982-47010989:+MEP17Setaria viridisNC_048271.14701098247010989+8
Sorghum_bicolor_NC_012870.2:69297151-69297158:+MEP17Sorghum bicolorNC_012870.26929715169297158+8
Tripterygium_wilfordii_NC_052253.1:11026257-11026264:-MEP17Tripterygium wilfordiiNC_052253.11102625711026264-8
Vitis_riparia_NC_048436.1:18824880-18824887:-MEP17Vitis ripariaNC_048436.11882488018824887-8
Vitis_vinifera_NC_012012.3:4230938-4230945:+MEP17Vitis viniferaNC_012012.342309384230945+8
Brachypodium_distachyon_NC_016131.3:64913163-64913170:+MEP17Brachypodium distachyonNC_016131.36491316364913170+8
Citrus_clementina_NW_006262022.1:22457441-22457448:+MEP17Citrus clementinaNW_006262022.12245744122457448+8
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020493.1:19337003-19337010:+MEP17Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020493.11933700319337010+8
Herrania_umbratica_NW_018397257.1:6749017-6749024:+MEP17Herrania umbraticaNW_018397257.167490176749024+8
Oryza_brachyantha_NC_023165.1:8664038-8664045:-MEP17Oryza brachyanthaNC_023165.186640388664045-8
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029258.1:9905784-9905791:-MEP17Oryza sativa Japonica GroupNC_029258.199057849905791-8
Prunus_dulcis_NC_047655.1:6586322-6586329:-MEP17Prunus dulcisNC_047655.165863226586329-8
Prunus_mume_NC_024126.1:5779617-5779624:+MEP17Prunus mumeNC_024126.157796175779624+8
Prunus_persica_NC_034014.1:6453372-6453379:-MEP17Prunus persicaNC_034014.164533726453379-8
Punica_granatum_NC_045129.1:30086461-30086468:-MEP17Punica granatumNC_045129.13008646130086468-8
Sesamum_indicum_NC_026153.1:5233018-5233025:-MEP17Sesamum indicumNC_026153.152330185233025-8
Theobroma_cacao_NC_030858.1:32130163-32130170:+MEP17Theobroma cacaoNC_030858.13213016332130170+8