Cluster ID: MEP29

Size 12
Phase 0
Pfam domain ID TPR_12
Exon block sizes in the Microexon-tag 48,12,48
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq TTYTATCTTRTSCARMRSAARYTKGAWSAAGCYCRKRCWTGYTATGAGCGTGCTYTRAAGATAAARRGRCGTGTTYTGGGRSWTRRYCAYSCAGAYTATGCARAKACA
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP29 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_5:14930173-14930184:-MEP29A. thaliana51493017314930184-12
Gm_11:30878240-30878251:-MEP29G. max113087824030878251-12
Gm_18:3488801-3488812:+MEP29G. max1834888013488812+12
Ha_9:149645728-149645739:+MEP29H. annuus9149645728149645739+12
Os_4:11772179-11772190:+MEP29O. sativa41177217911772190+12
Pp_16:12744652-12744663:+MEP29P. patens161274465212744663+12
Ps_NC_039361.1:44004937-44004948:+MEP29P. somniferumNC_039361.14400493744004948+12
Ps_NC_039362.1:122173130-122173141:-MEP29P. somniferumNC_039362.1122173130122173141-12
Sm_GL377583:2193462-2193473:+MEP29S. moellendorffiiGL37758321934622193473+12
Sm_GL377599:643575-643586:+MEP29S. moellendorffiiGL377599643575643586+12
Zm_5:26055397-26055408:+MEP29Z. mays52605539726055408+12
Bn_scaffoldA04:11519003-11519014:-MEP29B. napusscaffoldA041151900311519014-12
Bn_scaffoldC04:50258151-50258162:+MEP29B. napusscaffoldC045025815150258162+12
Hv_4H:525562856-525562867:+MEP29H. vulgare4H525562856525562867+12
Pt_4:7075482-7075493:-MEP29P. trichocarpa470754827075493-12
Sb_6:15130328-15130339:-MEP29S. bicolor61513032815130339-12
Sl_11:4466483-4466494:+MEP29S. lycopersicum1144664834466494+12
Ta_4A:60027935-60027946:+MEP29T. aestivum4A6002793560027946+12
Ta_4B:498384361-498384372:+MEP29T. aestivum4B498384361498384372+12
Ta_4D:402539264-402539275:+MEP29T. aestivum4D402539264402539275+12
Nicotiana_tabacum_NW_015903434.1:55215-55226:+MEP29Nicotiana tabacumNW_015903434.15521555226+12
Nicotiana_tabacum_NW_015884665.1:64765-64776:-MEP29Nicotiana tabacumNW_015884665.16476564776-12
Triticum_dicoccoides_NC_041387.1:509076605-509076616:+MEP29Triticum dicoccoidesNC_041387.1509076605509076616+12
Triticum_dicoccoides_NC_041386.1:61363563-61363574:-MEP29Triticum dicoccoidesNC_041386.16136356361363574-12
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017932698.1:3854781-3854792:+MEP29Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017932698.138547813854792+12
Gnetum_montanum_scaffold545385:201139-201150:+MEP29Gnetum montanumscaffold545385201139201150+12
Nicotiana_sylvestris_NW_009420192.1:102608-102619:+MEP29Nicotiana sylvestrisNW_009420192.1102608102619+12
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008919663.1:41347-41358:+MEP29Nicotiana tomentosiformisNW_008919663.14134741358+12
Camellia_sinensis_NW_021024887.1:1491445-1491456:-MEP29Camellia sinensisNW_021024887.114914451491456-12
Nicotiana_attenuata_NC_031995.1:107870201-107870212:+MEP29Nicotiana attenuataNC_031995.1107870201107870212+12
Capsicum_annuum_NC_029981.1:32618128-32618139:+MEP29Capsicum annuumNC_029981.13261812832618139+12
Colocasia_esculenta_CM024764.1:101229444-101229455:-MEP29Colocasia esculentaCM024764.1101229444101229455-12
Helianthus_annuus_NC_035441.2:131198634-131198645:-MEP29Helianthus annuusNC_035441.2131198634131198645-12
Lactuca_sativa_NW_019678017.1:478073-478084:-MEP29Lactuca sativaNW_019678017.1478073478084-12
Papaver_somniferum_NC_039361.1:44004937-44004948:+MEP29Papaver somniferumNC_039361.14400493744004948+12
Papaver_somniferum_NC_039362.1:122173130-122173141:-MEP29Papaver somniferumNC_039362.1122173130122173141-12
Arachis_hypogaea_NC_037620.1:130872784-130872795:+MEP29Arachis hypogaeaNC_037620.1130872784130872795+12
Arachis_hypogaea_NC_037630.1:133284982-133284993:+MEP29Arachis hypogaeaNC_037630.1133284982133284993+12
Elaeis_guineensis_NC_025995.1:18596831-18596842:+MEP29Elaeis guineensisNC_025995.11859683118596842+12
Gossypium_hirsutum_NC_030082.1:44906942-44906953:+MEP29Gossypium hirsutumNC_030082.14490694244906953+12
Gossypium_hirsutum_NC_030090.1:18749565-18749576:-MEP29Gossypium hirsutumNC_030090.11874956518749576-12
Hevea_brasiliensis_NW_018746996.1:119261-119272:-MEP29Hevea brasiliensisNW_018746996.1119261119272-12
Hevea_brasiliensis_NW_018746996.1:151422-151433:-MEP29Hevea brasiliensisNW_018746996.1151422151433-12
Liriodendron_chinense_ML058335.1:5915227-5915238:+MEP29Liriodendron chinenseML058335.159152275915238+12
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036256.1:8061919-8061930:+MEP29Olea europaea var.  sylvestrisNC_036256.180619198061930+12
Phalaenopsis_equestris_NW_018252638.1:197495-197506:+MEP29Phalaenopsis equestrisNW_018252638.1197495197506+12
Zea_mays_NC_050100.1:26450238-26450249:+MEP29Zea maysNC_050100.12645023826450249+12
Chenopodium_quinoa_NW_018742552.1:77056-77067:-MEP29Chenopodium quinoaNW_018742552.17705677067-12
Gossypium_arboreum_NC_030664.1:84588294-84588305:+MEP29Gossypium arboreumNC_030664.18458829484588305+12
Hibiscus_syriacus_NW_024062630.1:2035187-2035198:-MEP29Hibiscus syriacusNW_024062630.120351872035198-12
Prosopis_alba_NW_021634142.1:71988-71999:+MEP29Prosopis albaNW_021634142.17198871999+12
Prosopis_alba_NW_021635252.1:242257-242268:+MEP29Prosopis albaNW_021635252.1242257242268+12
Quercus_suber_NW_019821279.1:20751-20762:+MEP29Quercus suberNW_019821279.12075120762+12
Quercus_suber_NW_019825853.1:33255-33266:-MEP29Quercus suberNW_019825853.13325533266-12
Arachis_duranensis_NC_029774.2:122325478-122325489:+MEP29Arachis duranensisNC_029774.2122325478122325489+12
Arachis_ipaensis_NC_029787.2:122911324-122911335:+MEP29Arachis ipaensisNC_029787.2122911324122911335+12
Asparagus_officinalis_NC_033796.1:35962077-35962088:+MEP29Asparagus officinalisNC_033796.13596207735962088+12
Brassica_napus_NC_027760.2:1042443-1042454:+MEP29Brassica napusNC_027760.210424431042454+12
Brassica_napus_NC_027760.2:1054074-1054085:+MEP29Brassica napusNC_027760.210540741054085+12
Brassica_napus_NW_019168641.1:293192-293203:+MEP29Brassica napusNW_019168641.1293192293203+12
Brassica_napus_NC_027760.2:8371797-8371808:-MEP29Brassica napusNC_027760.283717978371808-12
Brassica_napus_NC_027770.2:47675145-47675156:-MEP29Brassica napusNC_027770.24767514547675156-12
Coffea_arabica_NC_039910.1:9570130-9570141:-MEP29Coffea arabicaNC_039910.195701309570141-12
Coffea_arabica_NC_039911.1:6773956-6773967:-MEP29Coffea arabicaNC_039911.167739566773967-12
Coffea_eugenioides_NC_040041.1:9449430-9449441:+MEP29Coffea eugenioidesNC_040041.194494309449441+12
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037534.1:10453785-10453796:+MEP29Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037534.11045378510453796+12
Glycine_soja_NC_041019.1:3555066-3555077:+MEP29Glycine sojaNC_041019.135550663555077+12
Glycine_soja_NC_041014.1:27651727-27651738:-MEP29Glycine sojaNC_041014.12765172727651738-12
Spinacia_oleracea_NW_018932151.1:91300-91311:+MEP29Spinacia oleraceaNW_018932151.19130091311+12
Actinidia_rufa_BJWL01000333.1:795395-795406:-MEP29Actinidia rufaBJWL01000333.1795395795406-12
Amborella_trichopoda_NW_006495044.1:1731720-1731731:+MEP29Amborella trichopodaNW_006495044.117317201731731+12
Benincasa_hispida_NC_052349.1:37715405-37715416:-MEP29Benincasa hispidaNC_052349.13771540537715416-12
Cajanus_cajan_NC_033804.1:4322369-4322380:+MEP29Cajanus cajanNC_033804.143223694322380+12
Cicer_arietinum_NC_021165.1:601296-601307:-MEP29Cicer arietinumNC_021165.1601296601307-12
Coffea_canephora_HG974434.1:9961568-9961579:-MEP29Coffea canephoraHG974434.199615689961579-12
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052489.1:3418699-3418710:-MEP29Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052489.134186993418710-12
Durio_zibethinus_NW_019167938.1:17670696-17670707:+MEP29Durio zibethinusNW_019167938.11767069617670707+12
Eucalyptus_grandis_NC_052617.1:40403568-40403579:+MEP29Eucalyptus grandisNC_052617.14040356840403579+12
Glycine_max_NC_038254.1:3488801-3488812:+MEP29Glycine maxNC_038254.134888013488812+12
Glycine_max_NC_038247.1:30878240-30878251:-MEP29Glycine maxNC_038247.13087824030878251-12
Gossypium_raimondii_NC_026929.1:8801202-8801213:-MEP29Gossypium raimondiiNC_026929.188012028801213-12
Ipomoea_nil_NW_017617454.1:3445821-3445832:+MEP29Ipomoea nilNW_017617454.134458213445832+12
Lupinus_angustifolius_NC_032012.1:3493267-3493278:+MEP29Lupinus angustifoliusNC_032012.134932673493278+12
Phoenix_dactylifera_NC_052399.1:13531252-13531263:-MEP29Phoenix dactyliferaNC_052399.11353125213531263-12
Piper_nigrum_Pn3:35875077-35875088:+MEP29Piper nigrumPn33587507735875088+12
Piper_nigrum_Pn3:36885267-36885278:+MEP29Piper nigrumPn33688526736885278+12
Piper_nigrum_Pn3:37018629-37018640:+MEP29Piper nigrumPn33701862937018640+12
Piper_nigrum_Pn3:37344449-37344460:+MEP29Piper nigrumPn33734444937344460+12
Piper_nigrum_Pn3:37101114-37101125:-MEP29Piper nigrumPn33710111437101125-12
Piper_nigrum_Pn10:18260590-18260601:-MEP29Piper nigrumPn101826059018260601-12
Pistacia_vera_NW_022195155.1:29972-29983:+MEP29Pistacia veraNW_022195155.12997229983+12
Populus_euphratica_NW_011500095.1:132659-132670:+MEP29Populus euphraticaNW_011500095.1132659132670+12
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988222.1:160977-160988:+MEP29Pyrus x bretschneideriNW_008988222.1160977160988+12
Quercus_lobata_NC_044905.1:59281770-59281781:+MEP29Quercus lobataNC_044905.15928177059281781+12
Solanum_lycopersicum_NC_015448.3:4466483-4466494:+MEP29Solanum lycopersicumNC_015448.344664834466494+12
Solanum_pennellii_NC_028647.1:4539448-4539459:+MEP29Solanum pennelliiNC_028647.145394484539459+12
Solanum_tuberosum_NW_006239071.1:1274813-1274824:-MEP29Solanum tuberosumNW_006239071.112748131274824-12
Syzygium_oleosum_NW_022076630.1:207348-207359:-MEP29Syzygium oleosumNW_022076630.1207348207359-12
Abrus_precatorius_NW_020874439.1:32786722-32786733:-MEP29Abrus precatoriusNW_020874439.13278672232786733-12
Ananas_comosus_NC_033635.1:10176794-10176805:-MEP29Ananas comosusNC_033635.11017679410176805-12
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NW_017567363.1:35847-35858:+MEP29Beta vulgaris subsp.  vulgarisNW_017567363.13584735858+12
Brassica_oleracea_var._oleracea_NC_027751.1:35580025-35580036:-MEP29Brassica oleracea var.  oleraceaNC_027751.13558002535580036-12
Brassica_rapa_NC_024798.2:8258740-8258751:-MEP29Brassica rapaNC_024798.282587408258751-12
Camelina_sativa_NC_025694.1:19706988-19706999:-MEP29Camelina sativaNC_025694.11970698819706999-12
Camelina_sativa_NC_025695.1:23492497-23492508:-MEP29Camelina sativaNC_025695.12349249723492508-12
Camelina_sativa_NC_025696.1:26122485-26122496:-MEP29Camelina sativaNC_025696.12612248526122496-12
Carica_papaya_NW_019014357.1:29936-29947:-MEP29Carica papayaNW_019014357.12993629947-12
Ceratophyllum_demersum_4:27419746-27419757:+MEP29Ceratophyllum demersum42741974627419757+12
Citrus_sinensis_NC_023051.1:17920930-17920941:+MEP29Citrus sinensisNC_023051.11792093017920941+12
Cucumis_melo_NW_007546309.1:3232194-3232205:+MEP29Cucumis meloNW_007546309.132321943232205+12
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030385.1:6553048-6553059:+MEP29Daucus carota subsp.  sativusNC_030385.165530486553059+12
Erythranthe_guttata_NW_012193676.1:1825737-1825748:+MEP29Erythranthe guttataNW_012193676.118257371825748+12
Euryale_ferox_18:14027730-14027741:+MEP29Euryale ferox181402773014027741+12
Ipomoea_triloba_NC_044918.1:2916754-2916765:+MEP29Ipomoea trilobaNC_044918.129167542916765+12
Jatropha_curcas_NW_023590789.1:15213932-15213943:+MEP29Jatropha curcasNW_023590789.11521393215213943+12
Juglans_regia_NC_049901.1:6064336-6064347:+MEP29Juglans regiaNC_049901.160643366064347+12
Macleaya_cordata_MVGT01001414.1:11052-11063:+MEP29Macleaya cordataMVGT01001414.11105211063+12
Malus_domestica_NC_041805.1:32893469-32893480:+MEP29Malus domesticaNC_041805.13289346932893480+12
Manihot_esculenta_NC_035161.1:23799257-23799268:+MEP29Manihot esculentaNC_035161.12379925723799268+12
Medicago_truncatula_NC_053044.1:32931541-32931552:-MEP29Medicago truncatulaNC_053044.13293154132931552-12
Morus_notabilis_NW_010363899.1:130417-130428:-MEP29Morus notabilisNW_010363899.1130417130428-12
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025208.1:8904008-8904019:+MEP29Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025208.189040088904019+12
Nymphaea_colorata_NC_045145.1:18573348-18573359:-MEP29Nymphaea colorataNC_045145.11857334818573359-12
Panicum_hallii_NC_038048.1:25392850-25392861:-MEP29Panicum halliiNC_038048.12539285025392861-12
Phaseolus_vulgaris_NC_023759.1:49031509-49031520:+MEP29Phaseolus vulgarisNC_023759.14903150949031520+12
Physcomitrella_patens_NC_037268.1:12744652-12744663:+MEP29Physcomitrella patensNC_037268.11274465212744663+12
Populus_alba_NW_023271072.1:652285-652296:+MEP29Populus albaNW_023271072.1652285652296+12
Populus_trichocarpa_NC_037288.1:7065587-7065598:-MEP29Populus trichocarpaNC_037288.170655877065598-12
Prunus_avium_NW_018922797.1:156112-156123:+MEP29Prunus aviumNW_018922797.1156112156123+12
Raphanus_sativus_NW_017353142.1:25496238-25496249:-MEP29Raphanus sativusNW_017353142.12549623825496249-12
Rhodamnia_argentea_NW_022060796.1:5762656-5762667:-MEP29Rhodamnia argenteaNW_022060796.157626565762667-12
Rhododendron_simsii_CM024960.1:2159110-2159121:+MEP29Rhododendron simsiiCM024960.121591102159121+12
Ricinus_communis_NW_002994894.1:43564-43575:-MEP29Ricinus communisNW_002994894.14356443575-12
Rosa_chinensis_NC_037090.1:38143094-38143105:-MEP29Rosa chinensisNC_037090.13814309438143105-12
Setaria_italica_NC_028456.1:7096778-7096789:+MEP29Setaria italicaNC_028456.170967787096789+12
Setaria_viridis_NC_048269.1:6564351-6564362:+MEP29Setaria viridisNC_048269.165643516564362+12
Sorghum_bicolor_NC_012875.2:15130328-15130339:-MEP29Sorghum bicolorNC_012875.21513032815130339-12
Tripterygium_wilfordii_NC_052236.1:2301507-2301518:+MEP29Tripterygium wilfordiiNC_052236.123015072301518+12
Vigna_angularis_NC_030639.1:36210841-36210852:+MEP29Vigna angularisNC_030639.13621084136210852+12
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028353.1:9309737-9309748:-MEP29Vigna radiata var.  radiataNC_028353.193097379309748-12
Vigna_unguiculata_NC_040279.1:38810162-38810173:-MEP29Vigna unguiculataNC_040279.13881016238810173-12
Ziziphus_jujuba_NC_029682.1:27481674-27481685:+MEP29Ziziphus jujubaNC_029682.12748167427481685+12
Arabidopsis_lyrata_subsp._lyrata_NW_003302549.1:20489179-20489190:-MEP29Arabidopsis lyrata subsp.  lyrataNW_003302549.12048917920489190-12
Arabidopsis_thaliana_NC_003076.8:14930173-14930184:-MEP29Arabidopsis thalianaNC_003076.81493017314930184-12
Brachypodium_distachyon_NC_016131.3:68231002-68231013:+MEP29Brachypodium distachyonNC_016131.36823100268231013+12
Capsella_rubella_NW_006238917.1:14843148-14843159:-MEP29Capsella rubellaNW_006238917.11484314814843159-12
Citrus_clementina_NW_006262139.1:22389468-22389479:+MEP29Citrus clementinaNW_006262139.12238946822389479+12
Cucumis_sativus_NC_026657.2:13454920-13454931:+MEP29Cucumis sativusNC_026657.21345492013454931+12
Cucurbita_maxima_NW_019272034.1:1660964-1660975:-MEP29Cucurbita maximaNW_019272034.116609641660975-12
Cucurbita_moschata_NW_019268530.1:1709064-1709075:-MEP29Cucurbita moschataNW_019268530.117090641709075-12
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036639.1:12687182-12687193:+MEP29Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036639.11268718212687193+12
Eutrema_salsugineum_NW_006256877.1:6702274-6702285:+MEP29Eutrema salsugineumNW_006256877.167022746702285+12
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020491.1:21820772-21820783:+MEP29Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020491.12182077221820783+12
Herrania_umbratica_NW_018397273.1:732806-732817:+MEP29Herrania umbraticaNW_018397273.1732806732817+12
Momordica_charantia_NW_019104512.1:1130502-1130513:+MEP29Momordica charantiaNW_019104512.111305021130513+12
Oryza_brachyantha_NC_023172.1:4891777-4891788:-MEP29Oryza brachyanthaNC_023172.148917774891788-12
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029259.1:11772179-11772190:+MEP29Oryza sativa Japonica GroupNC_029259.11177217911772190+12
Prunus_dulcis_NC_047652.1:15647729-15647740:+MEP29Prunus dulcisNC_047652.11564772915647740+12
Prunus_mume_NC_024129.1:13451501-13451512:+MEP29Prunus mumeNC_024129.11345150113451512+12
Prunus_mume_NW_007362807.1:9756-9767:+MEP29Prunus mumeNW_007362807.197569767+12
Prunus_persica_NC_034011.1:18517237-18517248:+MEP29Prunus persicaNC_034011.11851723718517248+12
Punica_granatum_NC_045131.1:231300-231311:-MEP29Punica granatumNC_045131.1231300231311-12
Selaginella_moellendorffii_NW_003314279.1:2193462-2193473:+MEP29Selaginella moellendorffiiNW_003314279.121934622193473+12
Selaginella_moellendorffii_NW_003314295.1:643575-643586:+MEP29Selaginella moellendorffiiNW_003314295.1643575643586+12
Sesamum_indicum_NC_026145.1:11989516-11989527:-MEP29Sesamum indicumNC_026145.11198951611989527-12
Tarenaya_hassleriana_NW_010961290.1:843325-843336:+MEP29Tarenaya hasslerianaNW_010961290.1843325843336+12
Theobroma_cacao_NC_030853.1:3730693-3730704:+MEP29Theobroma cacaoNC_030853.137306933730704+12