Cluster ID: MEP24

Size 10
Phase 1
Pfam domain ID Ham1p_like
Exon block sizes in the Microexon-tag 49,10,32,17
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq YTKGTKGARGAYACTTGYCTCTGYTTCAATGCMYTCAARGGTCTTCCAGGGCCYTACATMAARTGGTTTCTGSAGAAGATTGGTCATGAAGGTYTGAACAAYTTGYTR
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP24 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_4:7968213-7968222:-MEP24A. thaliana479682137968222-10
Gm_10:32699091-32699100:-MEP24G. max103269909132699100-10
Gm_20:28040000-28040009:-MEP24G. max202804000028040009-10
Ha_1:127818334-127818343:+MEP24H. annuus1127818334127818343+10
Os_10:16770493-16770502:-MEP24O. sativa101677049316770502-10
Pp_16:12085849-12085858:+MEP24P. patens161208584912085858+10
Sm_GL377565:4057862-4057871:+MEP24S. moellendorffiiGL37756540578624057871+10
Sm_GL377573:1452227-1452236:-MEP24S. moellendorffiiGL37757314522271452236-10
Vv_5:11354833-11354842:+MEP24V. vinifera51135483311354842+10
Zm_1:238803692-238803701:+MEP24Z. mays1238803692238803701+10
Zm_10:128222235-128222244:+MEP24Z. mays10128222235128222244+10
Zm_2:196521800-196521809:+MEP24Z. mays2196521800196521809+10
Zm_2:80810418-80810427:-MEP24Z. mays28081041880810427-10
Zm_4:64875021-64875030:-MEP24Z. mays46487502164875030-10
Zm_9:19447946-19447955:-MEP24Z. mays91944794619447955-10
Bn_scaffoldA04:6100053-6100062:+MEP24B. napusscaffoldA0461000536100062+10
Bn_scaffoldC04:48072954-48072963:+MEP24B. napusscaffoldC044807295448072963+10
Hv_1H:252138664-252138673:-MEP24H. vulgare1H252138664252138673-10
Pt_1:3973011-3973020:-MEP24P. trichocarpa139730113973020-10
Pt_3:18277531-18277540:+MEP24P. trichocarpa31827753118277540+10
Sb_1:22250100-22250109:+MEP24S. bicolor12225010022250109+10
Sl_9:71174459-71174468:+MEP24S. lycopersicum97117445971174468+10
Ta_1A:248615160-248615169:-MEP24T. aestivum1A248615160248615169-10
Ta_1B:277962853-277962862:-MEP24T. aestivum1B277962853277962862-10
Ta_1D:198022883-198022892:-MEP24T. aestivum1D198022883198022892-10
Nicotiana_tabacum_NW_015909837.1:46033-46042:-MEP24Nicotiana tabacumNW_015909837.14603346042-10
Triticum_dicoccoides_NC_041380.1:262357581-262357590:-MEP24Triticum dicoccoidesNC_041380.1262357581262357590-10
Triticum_dicoccoides_NC_041381.1:311428488-311428497:-MEP24Triticum dicoccoidesNC_041381.1311428488311428497-10
Ginkgo_biloba_Chr6:190421595-190421604:-MEP24Ginkgo bilobaChr6190421595190421604-10
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017932552.1:53544-53553:-MEP24Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017932552.15354453553-10
Gnetum_montanum_scaffold894807:67522-67531:+MEP24Gnetum montanumscaffold8948076752267531+10
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008936906.1:12644-12653:+MEP24Nicotiana tomentosiformisNW_008936906.11264412653+10
Camellia_sinensis_NW_021024498.1:1996560-1996569:+MEP24Camellia sinensisNW_021024498.119965601996569+10
Nicotiana_attenuata_NW_017670438.1:519637-519646:+MEP24Nicotiana attenuataNW_017670438.1519637519646+10
Colocasia_esculenta_CM024759.1:91503049-91503058:-MEP24Colocasia esculentaCM024759.19150304991503058-10
Helianthus_annuus_NC_035433.2:129302733-129302742:-MEP24Helianthus annuusNC_035433.2129302733129302742-10
Lactuca_sativa_NW_019677035.1:2606068-2606077:-MEP24Lactuca sativaNW_019677035.126060682606077-10
Papaver_somniferum_NC_039361.1:104366275-104366284:+MEP24Papaver somniferumNC_039361.1104366275104366284+10
Papaver_somniferum_NC_039365.1:11961323-11961332:+MEP24Papaver somniferumNC_039365.11196132311961332+10
Arachis_hypogaea_NC_037628.1:10200790-10200799:+MEP24Arachis hypogaeaNC_037628.11020079010200799+10
Arachis_hypogaea_NC_037618.1:3123095-3123104:-MEP24Arachis hypogaeaNC_037618.131230953123104-10
Elaeis_guineensis_NC_025996.1:33121352-33121361:-MEP24Elaeis guineensisNC_025996.13312135233121361-10
Gossypium_hirsutum_NC_030087.1:3820332-3820341:-MEP24Gossypium hirsutumNC_030087.138203323820341-10
Hevea_brasiliensis_NW_018746277.1:689601-689610:-MEP24Hevea brasiliensisNW_018746277.1689601689610-10
Hevea_brasiliensis_NW_018746395.1:512718-512727:-MEP24Hevea brasiliensisNW_018746395.1512718512727-10
Hevea_brasiliensis_NW_018746525.1:103131-103140:-MEP24Hevea brasiliensisNW_018746525.1103131103140-10
Liriodendron_chinense_PVNU02003440.1:590069-590078:-MEP24Liriodendron chinensePVNU02003440.1590069590078-10
Persea_americana_SDSS01001083.1:120644-120653:+MEP24Persea americanaSDSS01001083.1120644120653+10
Phalaenopsis_equestris_NW_018229940.1:252435-252444:-MEP24Phalaenopsis equestrisNW_018229940.1252435252444-10
Zea_mays_NC_050096.1:240897429-240897438:+MEP24Zea maysNC_050096.1240897429240897438+10
Zea_mays_NC_050097.1:196734992-196735001:+MEP24Zea maysNC_050097.1196734992196735001+10
Zea_mays_NC_050097.1:81157638-81157647:-MEP24Zea maysNC_050097.18115763881157647-10
Zea_mays_NC_050099.1:65124702-65124711:-MEP24Zea maysNC_050099.16512470265124711-10
Zea_mays_NC_050105.1:129706084-129706093:+MEP24Zea maysNC_050105.1129706084129706093+10
Zea_mays_NC_050104.1:21351477-21351486:-MEP24Zea maysNC_050104.12135147721351486-10
Chenopodium_quinoa_NW_018744858.1:90956-90965:+MEP24Chenopodium quinoaNW_018744858.19095690965+10
Chenopodium_quinoa_NW_018744113.1:412329-412338:-MEP24Chenopodium quinoaNW_018744113.1412329412338-10
Gossypium_arboreum_NC_030674.1:7431521-7431530:+MEP24Gossypium arboreumNC_030674.174315217431530+10
Hibiscus_syriacus_NW_024062030.1:55070-55079:-MEP24Hibiscus syriacusNW_024062030.15507055079-10
Hibiscus_syriacus_NW_024062574.1:846162-846171:-MEP24Hibiscus syriacusNW_024062574.1846162846171-10
Prosopis_alba_NW_021637159.1:328301-328310:+MEP24Prosopis albaNW_021637159.1328301328310+10
Quercus_suber_NW_019811595.1:403498-403507:-MEP24Quercus suberNW_019811595.1403498403507-10
Arachis_duranensis_NC_029772.2:2982920-2982929:-MEP24Arachis duranensisNC_029772.229829202982929-10
Arachis_ipaensis_NC_029785.2:9641402-9641411:+MEP24Arachis ipaensisNC_029785.296414029641411+10
Asparagus_officinalis_NC_033797.1:7589461-7589470:+MEP24Asparagus officinalisNC_033797.175894617589470+10
Brassica_napus_NC_027760.2:7604858-7604867:+MEP24Brassica napusNC_027760.276048587604867+10
Brassica_napus_NC_027770.2:44850885-44850894:+MEP24Brassica napusNC_027770.24485088544850894+10
Coffea_arabica_NC_039902.1:6410954-6410963:+MEP24Coffea arabicaNC_039902.164109546410963+10
Coffea_arabica_NC_039903.1:5075063-5075072:+MEP24Coffea arabicaNC_039903.150750635075072+10
Coffea_eugenioides_NC_040037.1:7299422-7299431:+MEP24Coffea eugenioidesNC_040037.172994227299431+10
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037537.1:21952445-21952454:-MEP24Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037537.12195244521952454-10
Dendrobium_catenatum_NW_021319234.1:290957-290966:-MEP24Dendrobium catenatumNW_021319234.1290957290966-10
Glycine_soja_NC_041011.1:34447790-34447799:-MEP24Glycine sojaNC_041011.13444779034447799-10
Glycine_soja_NC_041021.1:31205372-31205381:-MEP24Glycine sojaNC_041021.13120537231205381-10
Spinacia_oleracea_NW_018934098.1:26742-26751:+MEP24Spinacia oleraceaNW_018934098.12674226751+10
Actinidia_rufa_BJWL01000001.1:15701893-15701902:+MEP24Actinidia rufaBJWL01000001.11570189315701902+10
Actinidia_rufa_BJWL01000396.1:117331-117340:-MEP24Actinidia rufaBJWL01000396.1117331117340-10
Amborella_trichopoda_NW_006496825.1:878735-878744:+MEP24Amborella trichopodaNW_006496825.1878735878744+10
Benincasa_hispida_NC_052349.1:33521-33530:-MEP24Benincasa hispidaNC_052349.13352133530-10
Cajanus_cajan_NW_017984097.1:605356-605365:-MEP24Cajanus cajanNW_017984097.1605356605365-10
Cannabis_sativa_NC_044376.1:2565864-2565873:+MEP24Cannabis sativaNC_044376.125658642565873+10
Cannabis_sativa_NC_044376.1:2373594-2373603:-MEP24Cannabis sativaNC_044376.123735942373603-10
Cicer_arietinum_NC_021163.1:26231935-26231944:-MEP24Cicer arietinumNC_021163.12623193526231944-10
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000012.1:1416454-1416463:-MEP24Cinnamomum micranthumQPKB01000012.114164541416463-10
Coffea_canephora_HG974430.1:6469838-6469847:+MEP24Coffea canephoraHG974430.164698386469847+10
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052472.1:17901793-17901802:-MEP24Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052472.11790179317901802-10
Durio_zibethinus_NW_019168026.1:15097071-15097080:+MEP24Durio zibethinusNW_019168026.11509707115097080+10
Eucalyptus_grandis_NC_052619.1:5774655-5774664:-MEP24Eucalyptus grandisNC_052619.157746555774664-10
Glycine_max_NC_038246.1:32699091-32699100:-MEP24Glycine maxNC_038246.13269909132699100-10
Glycine_max_NC_038256.1:28040000-28040009:-MEP24Glycine maxNC_038256.12804000028040009-10
Gossypium_raimondii_NC_026934.1:47209978-47209987:+MEP24Gossypium raimondiiNC_026934.14720997847209987+10
Ipomoea_nil_NW_017617134.1:1930997-1931006:+MEP24Ipomoea nilNW_017617134.119309971931006+10
Lupinus_angustifolius_NW_017721075.1:11140-11149:+MEP24Lupinus angustifoliusNW_017721075.11114011149+10
Phoenix_dactylifera_NC_052393.1:17906766-17906775:-MEP24Phoenix dactyliferaNC_052393.11790676617906775-10
Piper_nigrum_Pn5:4634455-4634464:-MEP24Piper nigrumPn546344554634464-10
Piper_nigrum_Pn5:5409853-5409862:-MEP24Piper nigrumPn554098535409862-10
Piper_nigrum_Pn7:4496071-4496080:-MEP24Piper nigrumPn744960714496080-10
Pistacia_vera_NW_022196398.1:285137-285146:+MEP24Pistacia veraNW_022196398.1285137285146+10
Populus_euphratica_NW_011500094.1:316806-316815:+MEP24Populus euphraticaNW_011500094.1316806316815+10
Populus_euphratica_NW_011499855.1:1662546-1662555:-MEP24Populus euphraticaNW_011499855.116625461662555-10
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988344.1:490861-490870:+MEP24Pyrus x bretschneideriNW_008988344.1490861490870+10
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988128.1:526887-526896:-MEP24Pyrus x bretschneideriNW_008988128.1526887526896-10
Quercus_lobata_NC_044909.1:23220258-23220267:+MEP24Quercus lobataNC_044909.12322025823220267+10
Solanum_lycopersicum_NC_015446.3:71174459-71174468:+MEP24Solanum lycopersicumNC_015446.37117445971174468+10
Solanum_pennellii_NC_028645.1:82362389-82362398:+MEP24Solanum pennelliiNC_028645.18236238982362398+10
Solanum_tuberosum_NW_006239243.1:184192-184201:+MEP24Solanum tuberosumNW_006239243.1184192184201+10
Syzygium_oleosum_NW_022076894.1:66827-66836:+MEP24Syzygium oleosumNW_022076894.16682766836+10
Ananas_comosus_NC_033628.1:2787351-2787360:+MEP24Ananas comosusNC_033628.127873512787360+10
Ananas_comosus_NW_017891079.1:21109-21118:-MEP24Ananas comosusNW_017891079.12110921118-10
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025814.2:10164402-10164411:-MEP24Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025814.21016440210164411-10
Brassica_oleracea_var._oleracea_NC_027751.1:33707726-33707735:+MEP24Brassica oleracea var.  oleraceaNC_027751.13370772633707735+10
Brassica_rapa_NC_024798.2:5903651-5903660:+MEP24Brassica rapaNC_024798.259036515903660+10
Camelina_sativa_NC_025694.1:15850771-15850780:+MEP24Camelina sativaNC_025694.11585077115850780+10
Camelina_sativa_NC_025695.1:19146704-19146713:+MEP24Camelina sativaNC_025695.11914670419146713+10
Camelina_sativa_NC_025696.1:20508476-20508485:+MEP24Camelina sativaNC_025696.12050847620508485+10
Carica_papaya_NW_019014633.1:787791-787800:+MEP24Carica papayaNW_019014633.1787791787800+10
Ceratophyllum_demersum_2:72865065-72865074:+MEP24Ceratophyllum demersum27286506572865074+10
Citrus_sinensis_NC_023053.1:11496015-11496024:+MEP24Citrus sinensisNC_023053.11149601511496024+10
Cucumis_melo_NW_007546273.1:2669764-2669773:-MEP24Cucumis meloNW_007546273.126697642669773-10
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030381.1:27698894-27698903:-MEP24Daucus carota subsp.  sativusNC_030381.12769889427698903-10
Erythranthe_guttata_NW_012193485.1:500559-500568:+MEP24Erythranthe guttataNW_012193485.1500559500568+10
Euryale_ferox_7:21537584-21537593:-MEP24Euryale ferox72153758421537593-10
Ipomoea_triloba_NC_044919.1:9217233-9217242:+MEP24Ipomoea trilobaNC_044919.192172339217242+10
Jatropha_curcas_NW_023590739.1:3702210-3702219:+MEP24Jatropha curcasNW_023590739.137022103702219+10
Juglans_regia_NC_049907.1:18269395-18269404:+MEP24Juglans regiaNC_049907.11826939518269404+10
Macleaya_cordata_MVGT01004423.1:125816-125825:-MEP24Macleaya cordataMVGT01004423.1125816125825-10
Manihot_esculenta_NC_035163.1:24845204-24845213:-MEP24Manihot esculentaNC_035163.12484520424845213-10
Manihot_esculenta_NC_035175.1:3662408-3662417:-MEP24Manihot esculentaNC_035175.136624083662417-10
Medicago_truncatula_NC_053042.1:18411029-18411038:+MEP24Medicago truncatulaNC_053042.11841102918411038+10
Morus_notabilis_NW_010365641.1:21272-21281:-MEP24Morus notabilisNW_010365641.12127221281-10
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025202.1:2717536-2717545:-MEP24Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025202.127175362717545-10
Nymphaea_colorata_NC_045149.1:17751348-17751357:-MEP24Nymphaea colorataNC_045149.11775134817751357-10
Panicum_hallii_NC_038050.1:15151532-15151541:+MEP24Panicum halliiNC_038050.11515153215151541+10
Phaseolus_vulgaris_NC_023753.1:47779349-47779358:-MEP24Phaseolus vulgarisNC_023753.14777934947779358-10
Physcomitrella_patens_NC_037268.1:12085849-12085858:+MEP24Physcomitrella patensNC_037268.11208584912085858+10
Populus_alba_NW_023271091.1:420856-420865:+MEP24Populus albaNW_023271091.1420856420865+10
Populus_alba_NW_023271554.1:1673603-1673612:+MEP24Populus albaNW_023271554.116736031673612+10
Populus_trichocarpa_NC_037287.1:18418317-18418326:+MEP24Populus trichocarpaNC_037287.11841831718418326+10
Populus_trichocarpa_NC_037285.1:4000548-4000557:-MEP24Populus trichocarpaNC_037285.140005484000557-10
Prunus_avium_NW_018921420.1:602593-602602:+MEP24Prunus aviumNW_018921420.1602593602602+10
Raphanus_sativus_NW_017353142.1:44477882-44477891:-MEP24Raphanus sativusNW_017353142.14447788244477891-10
Rhodamnia_argentea_NW_022060841.1:794020-794029:+MEP24Rhodamnia argenteaNW_022060841.1794020794029+10
Rhododendron_simsii_CM024961.1:8389057-8389066:+MEP24Rhododendron simsiiCM024961.183890578389066+10
Ricinus_communis_NW_002994327.1:759058-759067:-MEP24Ricinus communisNW_002994327.1759058759067-10
Rosa_chinensis_NC_037091.1:13096990-13096999:+MEP24Rosa chinensisNC_037091.11309699013096999+10
Rosa_chinensis_NC_037093.1:19804976-19804985:+MEP24Rosa chinensisNC_037093.11980497619804985+10
Setaria_italica_NC_028458.1:17777095-17777104:+MEP24Setaria italicaNC_028458.11777709517777104+10
Setaria_viridis_NC_048271.1:17735564-17735573:+MEP24Setaria viridisNC_048271.11773556417735573+10
Sorghum_bicolor_NC_012870.2:22250100-22250109:+MEP24Sorghum bicolorNC_012870.22225010022250109+10
Tripterygium_wilfordii_NC_052232.1:2897980-2897989:+MEP24Tripterygium wilfordiiNC_052232.128979802897989+10
Vigna_angularis_NC_030638.1:6873011-6873020:+MEP24Vigna angularisNC_030638.168730116873020+10
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028358.1:6990897-6990906:+MEP24Vigna radiata var.  radiataNC_028358.169908976990906+10
Vigna_unguiculata_NC_040285.1:5307974-5307983:+MEP24Vigna unguiculataNC_040285.153079745307983+10
Aquilegia_coerulea_KZ305051.1:1456011-1456020:+MEP24Aquilegia coeruleaKZ305051.114560111456020+10
Arabidopsis_lyrata_subsp._lyrata_NW_003302551.1:1139170-1139179:+MEP24Arabidopsis lyrata subsp.  lyrataNW_003302551.111391701139179+10
Arabidopsis_lyrata_subsp._lyrata_NW_003302549.1:14694341-14694350:+MEP24Arabidopsis lyrata subsp.  lyrataNW_003302549.11469434114694350+10
Arabidopsis_thaliana_NC_003075.7:7968213-7968222:-MEP24Arabidopsis thalianaNC_003075.779682137968222-10
Brachypodium_distachyon_NC_016133.3:28916684-28916693:-MEP24Brachypodium distachyonNC_016133.32891668428916693-10
Capsella_rubella_NW_006238917.1:10996885-10996894:+MEP24Capsella rubellaNW_006238917.11099688510996894+10
Citrus_clementina_NW_006261964.1:9766934-9766943:+MEP24Citrus clementinaNW_006261964.197669349766943+10
Cucumis_sativus_NC_026657.2:8906845-8906854:-MEP24Cucumis sativusNC_026657.289068458906854-10
Cucurbita_maxima_NW_019272021.1:5267000-5267009:+MEP24Cucurbita maximaNW_019272021.152670005267009+10
Cucurbita_moschata_NW_019268553.1:1645243-1645252:-MEP24Cucurbita moschataNW_019268553.116452431645252-10
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036640.1:12144517-12144526:+MEP24Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036640.11214451712144526+10
Eutrema_salsugineum_NW_006256909.1:15815306-15815315:+MEP24Eutrema salsugineumNW_006256909.11581530615815315+10
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020492.1:2449368-2449377:+MEP24Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020492.124493682449377+10
Herrania_umbratica_NW_018397264.1:3809340-3809349:-MEP24Herrania umbraticaNW_018397264.138093403809349-10
Momordica_charantia_NW_019104531.1:1248236-1248245:-MEP24Momordica charantiaNW_019104531.112482361248245-10
Oryza_brachyantha_NC_023172.1:9692043-9692052:-MEP24Oryza brachyanthaNC_023172.196920439692052-10
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029265.1:16770493-16770502:-MEP24Oryza sativa Japonica GroupNC_029265.11677049316770502-10
Prunus_dulcis_NC_047650.1:4328899-4328908:+MEP24Prunus dulcisNC_047650.143288994328908+10
Prunus_mume_NC_024127.1:37727271-37727280:+MEP24Prunus mumeNC_024127.13772727137727280+10
Prunus_persica_NC_034009.1:4281741-4281750:+MEP24Prunus persicaNC_034009.142817414281750+10
Punica_granatum_NC_045128.1:23131576-23131585:-MEP24Punica granatumNC_045128.12313157623131585-10
Selaginella_moellendorffii_NW_003314261.1:4057862-4057871:+MEP24Selaginella moellendorffiiNW_003314261.140578624057871+10
Selaginella_moellendorffii_NW_003314269.1:1452227-1452236:-MEP24Selaginella moellendorffiiNW_003314269.114522271452236-10
Sesamum_indicum_NC_026147.1:17395988-17395997:-MEP24Sesamum indicumNC_026147.11739598817395997-10
Tarenaya_hassleriana_NW_010964923.1:1269663-1269672:-MEP24Tarenaya hasslerianaNW_010964923.112696631269672-10
Theobroma_cacao_NC_030853.1:26847220-26847229:-MEP24Theobroma cacaoNC_030853.12684722026847229-10