Cluster ID: MEP20

Size 8
Phase 2
Pfam domain ID VSP
Exon block sizes in the Microexon-tag 16,34,8,50
Microexon location in the Microexon-tag 3
Microexon-tag DNA Seq TWTRTTCCKGGMARAGATSAAAATGGAARYTWYSYRCCHYTRMAGWYRAGHHMARRWGGWWTAKCWRGTGGWGYYATWGCTGGMATATCTRTWGSWGGAGTWRCHGGK
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP20 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
Gm_14:3519416-3519423:-MEP20G. max1435194163519423-8
Gm_2:45470554-45470561:+MEP20G. max24547055445470561+8
Gm_2:45477137-45477144:+MEP20G. max24547713745477144+8
Gm_20:12622223-12622230:+MEP20G. max201262222312622230+8
Ha_1:45066965-45066972:-MEP20H. annuus14506696545066972-8
Vv_10:417821-417828:+MEP20V. vinifera10417821417828+8
Vv_10:417908-417915:+MEP20V. vinifera10417908417915+8
Vv_10:424510-424517:+MEP20V. vinifera10424510424517+8
Sl_2:45667438-45667445:-MEP20S. lycopersicum24566743845667445-8
Sl_7:59568939-59568946:-MEP20S. lycopersicum75956893959568946-8
Nicotiana_tabacum_NW_015909062.1:9227-9234:+MEP20Nicotiana tabacumNW_015909062.192279234+8
Nicotiana_tabacum_NW_015911676.1:30651-30658:+MEP20Nicotiana tabacumNW_015911676.13065130658+8
Nicotiana_tabacum_NW_015793967.1:13736-13743:-MEP20Nicotiana tabacumNW_015793967.11373613743-8
Nicotiana_tabacum_NW_015909875.1:38789-38796:-MEP20Nicotiana tabacumNW_015909875.13878938796-8
Nicotiana_sylvestris_NW_009394382.1:71145-71152:+MEP20Nicotiana sylvestrisNW_009394382.17114571152+8
Nicotiana_sylvestris_NW_009570679.1:14798-14805:-MEP20Nicotiana sylvestrisNW_009570679.11479814805-8
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008897893.1:268074-268081:+MEP20Nicotiana tomentosiformisNW_008897893.1268074268081+8
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008913717.1:975-982:-MEP20Nicotiana tomentosiformisNW_008913717.1975982-8
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008965897.1:44625-44632:-MEP20Nicotiana tomentosiformisNW_008965897.14462544632-8
Camellia_sinensis_NW_021025094.1:60300-60307:+MEP20Camellia sinensisNW_021025094.16030060307+8
Camellia_sinensis_NW_021025866.1:3011833-3011840:+MEP20Camellia sinensisNW_021025866.130118333011840+8
Camellia_sinensis_NW_021025511.1:1729-1736:-MEP20Camellia sinensisNW_021025511.117291736-8
Nicotiana_attenuata_NC_031990.1:21117505-21117512:+MEP20Nicotiana attenuataNC_031990.12111750521117512+8
Nicotiana_attenuata_NC_031999.1:12030364-12030371:+MEP20Nicotiana attenuataNC_031999.11203036412030371+8
Capsicum_annuum_NC_029978.1:142481105-142481112:-MEP20Capsicum annuumNC_029978.1142481105142481112-8
Colocasia_esculenta_CM024755.1:6419995-6420002:-MEP20Colocasia esculentaCM024755.164199956420002-8
Helianthus_annuus_NC_035433.2:32815077-32815084:-MEP20Helianthus annuusNC_035433.23281507732815084-8
Lactuca_sativa_NW_019678096.1:655496-655503:+MEP20Lactuca sativaNW_019678096.1655496655503+8
Lactuca_sativa_NW_019683355.1:420596-420603:+MEP20Lactuca sativaNW_019683355.1420596420603+8
Arachis_hypogaea_NC_037621.1:1277958-1277965:+MEP20Arachis hypogaeaNC_037621.112779581277965+8
Arachis_hypogaea_NC_037631.1:1847440-1847447:+MEP20Arachis hypogaeaNC_037631.118474401847447+8
Arachis_hypogaea_NC_037634.1:7878404-7878411:+MEP20Arachis hypogaeaNC_037634.178784047878411+8
Arachis_hypogaea_NC_037634.1:7516275-7516282:-MEP20Arachis hypogaeaNC_037634.175162757516282-8
Arachis_hypogaea_NC_037634.1:7547256-7547263:-MEP20Arachis hypogaeaNC_037634.175472567547263-8
Arachis_hypogaea_NC_037634.1:7569177-7569184:-MEP20Arachis hypogaeaNC_037634.175691777569184-8
Arachis_hypogaea_NC_037623.1:30820898-30820905:-MEP20Arachis hypogaeaNC_037623.13082089830820905-8
Arachis_hypogaea_NC_037624.1:5767389-5767396:-MEP20Arachis hypogaeaNC_037624.157673895767396-8
Arachis_hypogaea_NC_037624.1:5789213-5789220:-MEP20Arachis hypogaeaNC_037624.157892135789220-8
Elaeis_guineensis_NW_011551520.1:75767-75774:+MEP20Elaeis guineensisNW_011551520.17576775774+8
Gossypium_hirsutum_NW_015962019.1:2491321-2491328:-MEP20Gossypium hirsutumNW_015962019.124913212491328-8
Hevea_brasiliensis_NW_018747242.1:28475-28482:-MEP20Hevea brasiliensisNW_018747242.12847528482-8
Liriodendron_chinense_ML058363.1:3214739-3214746:-MEP20Liriodendron chinenseML058363.132147393214746-8
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036257.1:11788733-11788740:+MEP20Olea europaea var.  sylvestrisNC_036257.11178873311788740+8
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036257.1:17085838-17085845:-MEP20Olea europaea var.  sylvestrisNC_036257.11708583817085845-8
Phalaenopsis_equestris_NW_018164739.1:2921441-2921448:+MEP20Phalaenopsis equestrisNW_018164739.129214412921448+8
Gossypium_arboreum_NC_030675.1:1518141-1518148:-MEP20Gossypium arboreumNC_030675.115181411518148-8
Hibiscus_syriacus_NW_024063178.1:3586727-3586734:+MEP20Hibiscus syriacusNW_024063178.135867273586734+8
Prosopis_alba_NW_021634235.1:7160-7167:+MEP20Prosopis albaNW_021634235.171607167+8
Prosopis_alba_NW_021636075.1:26388-26395:+MEP20Prosopis albaNW_021636075.12638826395+8
Prosopis_alba_NW_021636075.1:160724-160731:+MEP20Prosopis albaNW_021636075.1160724160731+8
Prosopis_alba_NW_021636075.1:189073-189080:+MEP20Prosopis albaNW_021636075.1189073189080+8
Prosopis_alba_NW_021636076.1:4065-4072:+MEP20Prosopis albaNW_021636076.140654072+8
Prosopis_alba_NW_021636077.1:829-836:+MEP20Prosopis albaNW_021636077.1829836+8
Quercus_suber_NW_019822142.1:385542-385549:+MEP20Quercus suberNW_019822142.1385542385549+8
Quercus_suber_NW_019822142.1:402698-402705:+MEP20Quercus suberNW_019822142.1402698402705+8
Quercus_suber_NW_019822142.1:440317-440324:+MEP20Quercus suberNW_019822142.1440317440324+8
Arachis_duranensis_NC_029775.2:1259560-1259567:+MEP20Arachis duranensisNC_029775.212595601259567+8
Arachis_duranensis_NC_029777.2:58700579-58700586:+MEP20Arachis duranensisNC_029777.25870057958700586+8
Arachis_duranensis_NC_029777.2:58720954-58720961:+MEP20Arachis duranensisNC_029777.25872095458720961+8
Arachis_duranensis_NC_029778.2:6766998-6767005:-MEP20Arachis duranensisNC_029778.267669986767005-8
Arachis_ipaensis_NC_029788.2:1792925-1792932:+MEP20Arachis ipaensisNC_029788.217929251792932+8
Arachis_ipaensis_NC_029791.2:6684338-6684345:+MEP20Arachis ipaensisNC_029791.266843386684345+8
Arachis_ipaensis_NC_029791.2:6335604-6335611:-MEP20Arachis ipaensisNC_029791.263356046335611-8
Arachis_ipaensis_NC_029791.2:6367550-6367557:-MEP20Arachis ipaensisNC_029791.263675506367557-8
Asparagus_officinalis_NC_033797.1:46856168-46856175:-MEP20Asparagus officinalisNC_033797.14685616846856175-8
Asparagus_officinalis_NC_033802.1:66178643-66178650:-MEP20Asparagus officinalisNC_033802.16617864366178650-8
Coffea_arabica_NC_039914.1:1471654-1471661:+MEP20Coffea arabicaNC_039914.114716541471661+8
Coffea_arabica_NC_039915.1:769151-769158:+MEP20Coffea arabicaNC_039915.1769151769158+8
Coffea_eugenioides_NC_040043.1:3276089-3276096:+MEP20Coffea eugenioidesNC_040043.132760893276096+8
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037537.1:502565-502572:+MEP20Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037537.1502565502572+8
Dendrobium_catenatum_NW_021319083.1:30660928-30660935:+MEP20Dendrobium catenatumNW_021319083.13066092830660935+8
Glycine_soja_NC_041003.1:47619124-47619131:+MEP20Glycine sojaNC_041003.14761912447619131+8
Glycine_soja_NC_041021.1:12548046-12548053:+MEP20Glycine sojaNC_041021.11254804612548053+8
Glycine_soja_NC_041015.1:3628384-3628391:-MEP20Glycine sojaNC_041015.136283843628391-8
Actinidia_rufa_BJWL01000018.1:6173560-6173567:-MEP20Actinidia rufaBJWL01000018.161735606173567-8
Actinidia_rufa_BJWL01000220.1:163494-163501:-MEP20Actinidia rufaBJWL01000220.1163494163501-8
Cajanus_cajan_NC_033811.1:4757692-4757699:+MEP20Cajanus cajanNC_033811.147576924757699+8
Cajanus_cajan_NC_033811.1:15786937-15786944:+MEP20Cajanus cajanNC_033811.11578693715786944+8
Cajanus_cajan_NW_017984262.1:112377-112384:-MEP20Cajanus cajanNW_017984262.1112377112384-8
Cicer_arietinum_NC_021161.1:32409875-32409882:+MEP20Cicer arietinumNC_021161.13240987532409882+8
Cicer_arietinum_NC_021164.1:40563347-40563354:+MEP20Cicer arietinumNC_021164.14056334740563354+8
Coffea_canephora_HG974436.1:990306-990313:+MEP20Coffea canephoraHG974436.1990306990313+8
Durio_zibethinus_NW_019167938.1:9379676-9379683:+MEP20Durio zibethinusNW_019167938.193796769379683+8
Durio_zibethinus_NW_019168049.1:10309005-10309012:+MEP20Durio zibethinusNW_019168049.11030900510309012+8
Durio_zibethinus_NW_019167982.1:12173164-12173171:-MEP20Durio zibethinusNW_019167982.11217316412173171-8
Eucalyptus_grandis_NC_052612.1:35075356-35075363:+MEP20Eucalyptus grandisNC_052612.13507535635075363+8
Glycine_max_NC_016089.3:45470554-45470561:+MEP20Glycine maxNC_016089.34547055445470561+8
Glycine_max_NC_038256.1:12622223-12622230:+MEP20Glycine maxNC_038256.11262222312622230+8
Glycine_max_NC_038250.1:3519416-3519423:-MEP20Glycine maxNC_038250.135194163519423-8
Ipomoea_nil_NW_017619497.1:8270931-8270938:-MEP20Ipomoea nilNW_017619497.182709318270938-8
Lupinus_angustifolius_NC_032010.1:23092367-23092374:+MEP20Lupinus angustifoliusNC_032010.12309236723092374+8
Lupinus_angustifolius_NC_032010.1:5589200-5589207:-MEP20Lupinus angustifoliusNC_032010.155892005589207-8
Lupinus_angustifolius_NC_032017.1:16020283-16020290:-MEP20Lupinus angustifoliusNC_032017.11602028316020290-8
Lupinus_angustifolius_NC_032019.1:1227216-1227223:-MEP20Lupinus angustifoliusNC_032019.112272161227223-8
Nelumbo_nucifera_NW_010729084.1:858897-858904:-MEP20Nelumbo nuciferaNW_010729084.1858897858904-8
Nelumbo_nucifera_NW_010729269.1:309828-309835:-MEP20Nelumbo nuciferaNW_010729269.1309828309835-8
Pistacia_vera_NW_022196712.1:54935-54942:+MEP20Pistacia veraNW_022196712.15493554942+8
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988039.1:692305-692312:+MEP20Pyrus x bretschneideriNW_008988039.1692305692312+8
Quercus_lobata_NC_044911.1:31251511-31251518:+MEP20Quercus lobataNC_044911.13125151131251518+8
Quercus_lobata_NC_044911.1:31310228-31310235:+MEP20Quercus lobataNC_044911.13131022831310235+8
Solanum_lycopersicum_NC_015439.3:45667438-45667445:-MEP20Solanum lycopersicumNC_015439.34566743845667445-8
Solanum_lycopersicum_NC_015444.3:59568939-59568946:-MEP20Solanum lycopersicumNC_015444.35956893959568946-8
Solanum_pennellii_NC_028638.1:48830315-48830322:-MEP20Solanum pennelliiNC_028638.14883031548830322-8
Solanum_pennellii_NC_028643.1:70822703-70822710:-MEP20Solanum pennelliiNC_028643.17082270370822710-8
Solanum_tuberosum_NW_006238930.1:1402981-1402988:-MEP20Solanum tuberosumNW_006238930.114029811402988-8
Solanum_tuberosum_NW_006239023.1:1344287-1344294:-MEP20Solanum tuberosumNW_006239023.113442871344294-8
Solanum_tuberosum_NW_006239186.1:129432-129439:-MEP20Solanum tuberosumNW_006239186.1129432129439-8
Abrus_precatorius_NW_020874291.1:3100924-3100931:+MEP20Abrus precatoriusNW_020874291.131009243100931+8
Abrus_precatorius_NW_020874428.1:24899033-24899040:+MEP20Abrus precatoriusNW_020874428.12489903324899040+8
Ananas_comosus_NC_033625.1:4834061-4834068:+MEP20Ananas comosusNC_033625.148340614834068+8
Carica_papaya_NW_019014560.1:5980-5987:-MEP20Carica papayaNW_019014560.159805987-8
Citrus_sinensis_NC_023047.1:1096454-1096461:+MEP20Citrus sinensisNC_023047.110964541096461+8
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030384.1:34160211-34160218:-MEP20Daucus carota subsp.  sativusNC_030384.13416021134160218-8
Erythranthe_guttata_NW_012193410.1:1791953-1791960:+MEP20Erythranthe guttataNW_012193410.117919531791960+8
Erythranthe_guttata_NW_012192922.1:990499-990506:-MEP20Erythranthe guttataNW_012192922.1990499990506-8
Ipomoea_triloba_NC_044917.1:3941739-3941746:+MEP20Ipomoea trilobaNC_044917.139417393941746+8
Ipomoea_triloba_NC_044925.1:26644030-26644037:-MEP20Ipomoea trilobaNC_044925.12664403026644037-8
Jatropha_curcas_NW_023591667.1:44634-44641:+MEP20Jatropha curcasNW_023591667.14463444641+8
Jatropha_curcas_NW_023590947.1:128652-128659:-MEP20Jatropha curcasNW_023590947.1128652128659-8
Juglans_regia_NC_049901.1:17201750-17201757:+MEP20Juglans regiaNC_049901.11720175017201757+8
Juglans_regia_NC_049910.1:12176121-12176128:+MEP20Juglans regiaNC_049910.11217612112176128+8
Juglans_regia_NC_049910.1:12243533-12243540:+MEP20Juglans regiaNC_049910.11224353312243540+8
Macleaya_cordata_MVGT01002051.1:2221166-2221173:+MEP20Macleaya cordataMVGT01002051.122211662221173+8
Malus_domestica_NC_041793.1:46966607-46966614:-MEP20Malus domesticaNC_041793.14696660746966614-8
Manihot_esculenta_NC_035172.1:7174402-7174409:+MEP20Manihot esculentaNC_035172.171744027174409+8
Manihot_esculenta_NC_035173.1:7745887-7745894:-MEP20Manihot esculentaNC_035173.177458877745894-8
Medicago_truncatula_NC_053044.1:39658698-39658705:+MEP20Medicago truncatulaNC_053044.13965869839658705+8
Medicago_truncatula_NC_053046.1:38396125-38396132:+MEP20Medicago truncatulaNC_053046.13839612538396132+8
Medicago_truncatula_NC_053046.1:38430119-38430126:+MEP20Medicago truncatulaNC_053046.13843011938430126+8
Morus_notabilis_NW_010357944.1:119740-119747:+MEP20Morus notabilisNW_010357944.1119740119747+8
Morus_notabilis_NW_010361938.1:216203-216210:+MEP20Morus notabilisNW_010361938.1216203216210+8
Phaseolus_vulgaris_NC_023754.1:3161934-3161941:-MEP20Phaseolus vulgarisNC_023754.131619343161941-8
Phaseolus_vulgaris_NC_023752.1:52298028-52298035:-MEP20Phaseolus vulgarisNC_023752.15229802852298035-8
Prunus_avium_NW_018921908.1:46100-46107:-MEP20Prunus aviumNW_018921908.14610046107-8
Prunus_avium_NW_018922091.1:309521-309528:-MEP20Prunus aviumNW_018922091.1309521309528-8
Ricinus_communis_NW_002994332.1:205227-205234:+MEP20Ricinus communisNW_002994332.1205227205234+8
Rosa_chinensis_NC_037089.1:74770428-74770435:+MEP20Rosa chinensisNC_037089.17477042874770435+8
Rosa_chinensis_NC_037092.1:1358540-1358547:+MEP20Rosa chinensisNC_037092.113585401358547+8
Vigna_angularis_NC_030645.1:1832365-1832372:+MEP20Vigna angularisNC_030645.118323651832372+8
Vigna_angularis_NC_030643.1:4086952-4086959:-MEP20Vigna angularisNC_030643.140869524086959-8
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028357.1:61722-61729:+MEP20Vigna radiata var.  radiataNC_028357.16172261729+8
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028356.1:3857954-3857961:-MEP20Vigna radiata var.  radiataNC_028356.138579543857961-8
Vigna_unguiculata_NC_040280.1:15729422-15729429:+MEP20Vigna unguiculataNC_040280.11572942215729429+8
Vigna_unguiculata_NC_040284.1:6001330-6001337:+MEP20Vigna unguiculataNC_040284.160013306001337+8
Vigna_unguiculata_NC_040286.1:34535403-34535410:+MEP20Vigna unguiculataNC_040286.13453540334535410+8
Vigna_unguiculata_NC_040286.1:34541171-34541178:+MEP20Vigna unguiculataNC_040286.13454117134541178+8
Vigna_unguiculata_NC_040282.1:33441435-33441442:-MEP20Vigna unguiculataNC_040282.13344143533441442-8
Vigna_unguiculata_NC_040283.1:33849539-33849546:-MEP20Vigna unguiculataNC_040283.13384953933849546-8
Vigna_unguiculata_NC_040284.1:4935983-4935990:-MEP20Vigna unguiculataNC_040284.149359834935990-8
Vitis_riparia_NC_048440.1:23268269-23268276:-MEP20Vitis ripariaNC_048440.12326826923268276-8
Vitis_vinifera_NC_012016.3:417821-417828:+MEP20Vitis viniferaNC_012016.3417821417828+8
Aquilegia_coerulea_KZ305049.1:702386-702393:+MEP20Aquilegia coeruleaKZ305049.1702386702393+8
Citrus_clementina_NW_006262688.1:35593010-35593017:-MEP20Citrus clementinaNW_006262688.13559301035593017-8
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020493.1:747943-747950:-MEP20Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020493.1747943747950-8
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NW_004443388.1:6169-6176:-MEP20Fragaria vesca subsp.  vescaNW_004443388.161696176-8
Herrania_umbratica_NW_018397267.1:638683-638690:+MEP20Herrania umbraticaNW_018397267.1638683638690+8
Herrania_umbratica_NW_018397255.1:9410751-9410758:-MEP20Herrania umbraticaNW_018397255.194107519410758-8
Prunus_dulcis_NC_047652.1:18877187-18877194:+MEP20Prunus dulcisNC_047652.11887718718877194+8
Prunus_dulcis_NC_047653.1:788269-788276:+MEP20Prunus dulcisNC_047653.1788269788276+8
Prunus_mume_NC_024128.1:481197-481204:-MEP20Prunus mumeNC_024128.1481197481204-8
Prunus_mume_NC_024129.1:17616023-17616030:-MEP20Prunus mumeNC_024129.11761602317616030-8
Prunus_persica_NC_034012.1:762495-762502:+MEP20Prunus persicaNC_034012.1762495762502+8
Punica_granatum_NC_045130.1:37011715-37011722:-MEP20Punica granatumNC_045130.13701171537011722-8
Sesamum_indicum_NW_011628150.1:5107-5114:+MEP20Sesamum indicumNW_011628150.151075114+8
Sesamum_indicum_NC_026149.1:13504412-13504419:-MEP20Sesamum indicumNC_026149.11350441213504419-8
Sesamum_indicum_NC_026152.1:8837865-8837872:-MEP20Sesamum indicumNC_026152.188378658837872-8
Theobroma_cacao_NC_030850.1:11760425-11760432:-MEP20Theobroma cacaoNC_030850.11176042511760432-8
Theobroma_cacao_NC_030855.1:25552697-25552704:-MEP20Theobroma cacaoNC_030855.12555269725552704-8