Cluster ID: MEP18

Size 8
Phase 1
Pfam domain ID DEAD
Exon block sizes in the Microexon-tag 49,8,51
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq CCTGCWCTRGCAAARMCAGGMATTGTKCTTGTTGTTTSTCCYTTRATAGCHYTRATGGARAAYCARGTTAYGRSMTTGAARGARAAAGGRRTTSCWGCTGAATWTCTC
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP18 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_4:16936676-16936683:+MEP18A. thaliana41693667616936683+8
Gm_9:7211644-7211651:-MEP18G. max972116447211651-8
Ha_4:173376324-173376331:+MEP18H. annuus4173376324173376331+8
Os_2:33092715-33092722:-MEP18O. sativa23309271533092722-8
Ps_NW_020618825.1:17018971-17018978:-MEP18P. somniferumNW_020618825.11701897117018978-8
Ps_NW_020618825.1:17290395-17290402:-MEP18P. somniferumNW_020618825.11729039517290402-8
Ps_NW_020631041.1:18108387-18108394:-MEP18P. somniferumNW_020631041.11810838718108394-8
Sm_GL377679:184368-184375:+MEP18S. moellendorffiiGL377679184368184375+8
Sm_GL377687:352186-352193:-MEP18S. moellendorffiiGL377687352186352193-8
Vv_11:763974-763981:+MEP18V. vinifera11763974763981+8
Zm_5:217949880-217949887:-MEP18Z. mays5217949880217949887-8
Bn_scaffoldA08:21335094-21335101:-MEP18B. napusscaffoldA082133509421335101-8
Bn_scaffoldC03:67503161-67503168:+MEP18B. napusscaffoldC036750316167503168+8
Hv_6H:528506272-528506279:-MEP18H. vulgare6H528506272528506279-8
Pt_5:7731947-7731954:-MEP18P. trichocarpa577319477731954-8
Sb_4:65454899-65454906:-MEP18S. bicolor46545489965454906-8
Sl_7:54987095-54987102:-MEP18S. lycopersicum75498709554987102-8
Ta_6A:573201014-573201021:-MEP18T. aestivum6A573201014573201021-8
Ta_6B:644483601-644483608:-MEP18T. aestivum6B644483601644483608-8
Ta_6D:428481274-428481281:-MEP18T. aestivum6D428481274428481281-8
Nicotiana_tabacum_NW_015868191.1:148128-148135:-MEP18Nicotiana tabacumNW_015868191.1148128148135-8
Nicotiana_tabacum_NW_015904462.1:77356-77363:-MEP18Nicotiana tabacumNW_015904462.17735677363-8
Triticum_dicoccoides_NC_041390.1:583796967-583796974:-MEP18Triticum dicoccoidesNC_041390.1583796967583796974-8
Triticum_dicoccoides_NC_041391.1:646590768-646590775:-MEP18Triticum dicoccoidesNC_041391.1646590768646590775-8
Ginkgo_biloba_Chr8:634892225-634892232:+MEP18Ginkgo bilobaChr8634892225634892232+8
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017910262.1:421299-421306:+MEP18Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017910262.1421299421306+8
Gnetum_montanum_scaffold41303:906120-906127:+MEP18Gnetum montanumscaffold41303906120906127+8
Gnetum_montanum_scaffold744965:66544-66551:-MEP18Gnetum montanumscaffold7449656654466551-8
Gnetum_montanum_scaffold1001897:99790-99797:-MEP18Gnetum montanumscaffold10018979979099797-8
Nicotiana_sylvestris_NW_009441059.1:82603-82610:+MEP18Nicotiana sylvestrisNW_009441059.18260382610+8
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008894953.1:35062-35069:-MEP18Nicotiana tomentosiformisNW_008894953.13506235069-8
Camellia_sinensis_NW_021025727.1:143790-143797:+MEP18Camellia sinensisNW_021025727.1143790143797+8
Nicotiana_attenuata_NC_031993.1:30858823-30858830:+MEP18Nicotiana attenuataNC_031993.13085882330858830+8
Colocasia_esculenta_CM024766.1:95046057-95046064:+MEP18Colocasia esculentaCM024766.19504605795046064+8
Helianthus_annuus_NC_035436.2:203331219-203331226:+MEP18Helianthus annuusNC_035436.2203331219203331226+8
Lactuca_sativa_NW_019682620.1:659728-659735:+MEP18Lactuca sativaNW_019682620.1659728659735+8
Papaver_somniferum_NW_020618825.1:17018971-17018978:-MEP18Papaver somniferumNW_020618825.11701897117018978-8
Papaver_somniferum_NW_020618825.1:17290395-17290402:-MEP18Papaver somniferumNW_020618825.11729039517290402-8
Papaver_somniferum_NW_020631041.1:18108387-18108394:-MEP18Papaver somniferumNW_020631041.11810838718108394-8
Arachis_hypogaea_NC_037637.1:37311372-37311379:+MEP18Arachis hypogaeaNC_037637.13731137237311379+8
Arachis_hypogaea_NC_037620.1:49441740-49441747:-MEP18Arachis hypogaeaNC_037620.14944174049441747-8
Arachis_hypogaea_NC_037626.1:84401426-84401433:-MEP18Arachis hypogaeaNC_037626.18440142684401433-8
Arachis_hypogaea_NC_037630.1:51751606-51751613:-MEP18Arachis hypogaeaNC_037630.15175160651751613-8
Arachis_hypogaea_NC_037635.1:34429637-34429644:-MEP18Arachis hypogaeaNC_037635.13442963734429644-8
Elaeis_guineensis_NC_025995.1:39555878-39555885:-MEP18Elaeis guineensisNC_025995.13955587839555885-8
Gossypium_hirsutum_NC_030075.1:54246302-54246309:+MEP18Gossypium hirsutumNC_030075.15424630254246309+8
Gossypium_hirsutum_NC_030094.1:18541161-18541168:-MEP18Gossypium hirsutumNC_030094.11854116118541168-8
Hevea_brasiliensis_NW_018746726.1:67412-67419:+MEP18Hevea brasiliensisNW_018746726.16741267419+8
Liriodendron_chinense_ML058418.1:2802930-2802937:+MEP18Liriodendron chinenseML058418.128029302802937+8
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036238.1:13097285-13097292:-MEP18Olea europaea var.  sylvestrisNC_036238.11309728513097292-8
Persea_americana_SDSS01000019.1:672445-672452:+MEP18Persea americanaSDSS01000019.1672445672452+8
Phalaenopsis_equestris_NW_018164789.1:833534-833541:+MEP18Phalaenopsis equestrisNW_018164789.1833534833541+8
Zea_mays_NC_050100.1:220485870-220485877:-MEP18Zea maysNC_050100.1220485870220485877-8
Chenopodium_quinoa_NW_018742630.1:1365624-1365631:-MEP18Chenopodium quinoaNW_018742630.113656241365631-8
Chenopodium_quinoa_NW_018745533.1:1740755-1740762:-MEP18Chenopodium quinoaNW_018745533.117407551740762-8
Gossypium_arboreum_NC_030667.1:99946491-99946498:-MEP18Gossypium arboreumNC_030667.19994649199946498-8
Hibiscus_syriacus_NW_024062838.1:85458-85465:+MEP18Hibiscus syriacusNW_024062838.18545885465+8
Prosopis_alba_NW_021636754.1:393333-393340:+MEP18Prosopis albaNW_021636754.1393333393340+8
Quercus_suber_NW_019821070.1:738596-738603:-MEP18Quercus suberNW_019821070.1738596738603-8
Arachis_duranensis_NC_029780.2:106798900-106798907:+MEP18Arachis duranensisNC_029780.2106798900106798907+8
Arachis_duranensis_NC_029774.2:48017463-48017470:-MEP18Arachis duranensisNC_029774.24801746348017470-8
Arachis_ipaensis_NC_029787.2:49420634-49420641:-MEP18Arachis ipaensisNC_029787.24942063449420641-8
Arachis_ipaensis_NC_029792.2:33715120-33715127:-MEP18Arachis ipaensisNC_029792.23371512033715127-8
Arachis_ipaensis_NC_029794.2:43027064-43027071:-MEP18Arachis ipaensisNC_029794.24302706443027071-8
Asparagus_officinalis_NC_033801.1:106022647-106022654:-MEP18Asparagus officinalisNC_033801.1106022647106022654-8
Brassica_napus_NC_027769.2:68054564-68054571:+MEP18Brassica napusNC_027769.26805456468054571+8
Brassica_napus_NC_027764.2:18411996-18412003:-MEP18Brassica napusNC_027764.21841199618412003-8
Coffea_arabica_NC_039908.1:7960851-7960858:-MEP18Coffea arabicaNC_039908.179608517960858-8
Coffea_eugenioides_NC_040040.1:11686721-11686728:-MEP18Coffea eugenioidesNC_040040.11168672111686728-8
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037529.1:4052461-4052468:-MEP18Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037529.140524614052468-8
Dendrobium_catenatum_NW_021319688.1:502636-502643:-MEP18Dendrobium catenatumNW_021319688.1502636502643-8
Glycine_soja_NC_041010.1:7093584-7093591:-MEP18Glycine sojaNC_041010.170935847093591-8
Spinacia_oleracea_NW_018932340.1:4456-4463:+MEP18Spinacia oleraceaNW_018932340.144564463+8
Actinidia_rufa_BJWL01000429.1:564087-564094:+MEP18Actinidia rufaBJWL01000429.1564087564094+8
Amborella_trichopoda_NW_006498137.1:1004461-1004468:+MEP18Amborella trichopodaNW_006498137.110044611004468+8
Benincasa_hispida_NC_052354.1:46107395-46107402:+MEP18Benincasa hispidaNC_052354.14610739546107402+8
Cajanus_cajan_NW_017984305.1:137543-137550:+MEP18Cajanus cajanNW_017984305.1137543137550+8
Cannabis_sativa_NC_044371.1:37463654-37463661:-MEP18Cannabis sativaNC_044371.13746365437463661-8
Cicer_arietinum_NC_021160.1:23132040-23132047:-MEP18Cicer arietinumNC_021160.12313204023132047-8
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000003.1:19437585-19437592:-MEP18Cinnamomum micranthumQPKB01000003.11943758519437592-8
Coffea_canephora_HG974433.1:9989992-9989999:-MEP18Coffea canephoraHG974433.199899929989999-8
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052476.1:670250-670257:-MEP18Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052476.1670250670257-8
Durio_zibethinus_NW_019167860.1:22492501-22492508:-MEP18Durio zibethinusNW_019167860.12249250122492508-8
Eucalyptus_grandis_NC_052614.1:59574678-59574685:+MEP18Eucalyptus grandisNC_052614.15957467859574685+8
Glycine_max_NC_038245.1:7211644-7211651:-MEP18Glycine maxNC_038245.172116447211651-8
Gossypium_raimondii_NC_026935.1:18535589-18535596:+MEP18Gossypium raimondiiNC_026935.11853558918535596+8
Ipomoea_nil_NW_017618464.1:6603586-6603593:+MEP18Ipomoea nilNW_017618464.166035866603593+8
Lupinus_angustifolius_NC_032022.1:1421774-1421781:+MEP18Lupinus angustifoliusNC_032022.114217741421781+8
Nelumbo_nucifera_NW_010729102.1:1586656-1586663:-MEP18Nelumbo nuciferaNW_010729102.115866561586663-8
Phoenix_dactylifera_NC_052399.1:29236499-29236506:-MEP18Phoenix dactyliferaNC_052399.12923649929236506-8
Piper_nigrum_Pn5:3204094-3204101:+MEP18Piper nigrumPn532040943204101+8
Pistacia_vera_NW_022196303.1:439798-439805:+MEP18Pistacia veraNW_022196303.1439798439805+8
Populus_euphratica_NW_011499858.1:2647206-2647213:-MEP18Populus euphraticaNW_011499858.126472062647213-8
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988490.1:179369-179376:+MEP18Pyrus x bretschneideriNW_008988490.1179369179376+8
Quercus_lobata_NC_044914.1:1093871-1093878:-MEP18Quercus lobataNC_044914.110938711093878-8
Solanum_lycopersicum_NC_015444.3:54987095-54987102:-MEP18Solanum lycopersicumNC_015444.35498709554987102-8
Solanum_pennellii_NC_028643.1:65361039-65361046:-MEP18Solanum pennelliiNC_028643.16536103965361046-8
Solanum_tuberosum_NW_006238961.1:2468150-2468157:-MEP18Solanum tuberosumNW_006238961.124681502468157-8
Syzygium_oleosum_NW_022076700.1:200182-200189:+MEP18Syzygium oleosumNW_022076700.1200182200189+8
Abrus_precatorius_NW_020874292.1:33829803-33829810:-MEP18Abrus precatoriusNW_020874292.13382980333829810-8
Ananas_comosus_NC_033626.1:8626741-8626748:+MEP18Ananas comosusNC_033626.186267418626748+8
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NW_017567561.1:178565-178572:+MEP18Beta vulgaris subsp.  vulgarisNW_017567561.1178565178572+8
Brassica_oleracea_var._oleracea_NC_027750.1:55699992-55699999:+MEP18Brassica oleracea var.  oleraceaNC_027750.15569999255699999+8
Brassica_rapa_NC_024802.2:15813104-15813111:-MEP18Brassica rapaNC_024802.21581310415813111-8
Camelina_sativa_NC_025694.1:2182971-2182978:-MEP18Camelina sativaNC_025694.121829712182978-8
Camelina_sativa_NC_025695.1:2465226-2465233:-MEP18Camelina sativaNC_025695.124652262465233-8
Camelina_sativa_NC_025696.1:2295750-2295757:-MEP18Camelina sativaNC_025696.122957502295757-8
Carica_papaya_NW_019014686.1:2423014-2423021:+MEP18Carica papayaNW_019014686.124230142423021+8
Ceratophyllum_demersum_5:6217637-6217644:-MEP18Ceratophyllum demersum562176376217644-8
Citrus_sinensis_NC_023046.1:28318327-28318334:-MEP18Citrus sinensisNC_023046.12831832728318334-8
Cucumis_melo_NW_007546270.1:8941272-8941279:-MEP18Cucumis meloNW_007546270.189412728941279-8
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030388.1:7270754-7270761:+MEP18Daucus carota subsp.  sativusNC_030388.172707547270761+8
Erythranthe_guttata_NW_012193677.1:1523493-1523500:-MEP18Erythranthe guttataNW_012193677.115234931523500-8
Euryale_ferox_19:926280-926287:-MEP18Euryale ferox19926280926287-8
Ipomoea_triloba_NC_044927.1:23626643-23626650:-MEP18Ipomoea trilobaNC_044927.12362664323626650-8
Jatropha_curcas_NW_023590593.1:129076-129083:+MEP18Jatropha curcasNW_023590593.1129076129083+8
Juglans_regia_NC_049901.1:33879831-33879838:+MEP18Juglans regiaNC_049901.13387983133879838+8
Macleaya_cordata_MVGT01003059.1:15717-15724:-MEP18Macleaya cordataMVGT01003059.11571715724-8
Malus_domestica_NC_041790.1:7513958-7513965:-MEP18Malus domesticaNC_041790.175139587513965-8
Manihot_esculenta_NC_035161.1:26174986-26174993:-MEP18Manihot esculentaNC_035161.12617498626174993-8
Medicago_truncatula_NC_053043.1:18632704-18632711:-MEP18Medicago truncatulaNC_053043.11863270418632711-8
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025204.1:7458209-7458216:-MEP18Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025204.174582097458216-8
Nymphaea_colorata_NC_045148.1:14676082-14676089:-MEP18Nymphaea colorataNC_045148.11467608214676089-8
Panicum_hallii_NC_038042.1:57343797-57343804:-MEP18Panicum halliiNC_038042.15734379757343804-8
Phaseolus_vulgaris_NC_023751.1:33492366-33492373:+MEP18Phaseolus vulgarisNC_023751.13349236633492373+8
Populus_alba_NW_023271902.1:1879760-1879767:+MEP18Populus albaNW_023271902.118797601879767+8
Populus_trichocarpa_NC_037289.1:8206912-8206919:-MEP18Populus trichocarpaNC_037289.182069128206919-8
Prunus_avium_NW_018921354.1:631599-631606:-MEP18Prunus aviumNW_018921354.1631599631606-8
Raphanus_sativus_NW_017353146.1:9756579-9756586:+MEP18Raphanus sativusNW_017353146.197565799756586+8
Raphanus_sativus_NW_017353146.1:9769222-9769229:+MEP18Raphanus sativusNW_017353146.197692229769229+8
Raphanus_sativus_NW_017353146.1:9786941-9786948:+MEP18Raphanus sativusNW_017353146.197869419786948+8
Rhodamnia_argentea_NW_022060866.1:265110-265117:-MEP18Rhodamnia argenteaNW_022060866.1265110265117-8
Rhododendron_simsii_CM024955.1:34878222-34878229:+MEP18Rhododendron simsiiCM024955.13487822234878229+8
Ricinus_communis_NW_002994732.1:50304-50311:-MEP18Ricinus communisNW_002994732.15030450311-8
Rosa_chinensis_NC_037089.1:8319833-8319840:-MEP18Rosa chinensisNC_037089.183198338319840-8
Setaria_italica_NC_028450.1:39741507-39741514:-MEP18Setaria italicaNC_028450.13974150739741514-8
Setaria_viridis_NC_048263.1:39303645-39303652:-MEP18Setaria viridisNC_048263.13930364539303652-8
Sorghum_bicolor_NC_012873.2:65454899-65454906:-MEP18Sorghum bicolorNC_012873.26545489965454906-8
Tripterygium_wilfordii_NC_052232.1:10820242-10820249:-MEP18Tripterygium wilfordiiNC_052232.11082024210820249-8
Vigna_angularis_NC_030640.1:1763425-1763432:-MEP18Vigna angularisNC_030640.117634251763432-8
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028355.1:2288210-2288217:+MEP18Vigna radiata var.  radiataNC_028355.122882102288217+8
Vigna_unguiculata_NC_040287.1:3521585-3521592:-MEP18Vigna unguiculataNC_040287.135215853521592-8
Vitis_riparia_NC_048441.1:19065142-19065149:-MEP18Vitis ripariaNC_048441.11906514219065149-8
Vitis_vinifera_NC_012017.3:763974-763981:+MEP18Vitis viniferaNC_012017.3763974763981+8
Ziziphus_jujuba_NC_029686.1:2374221-2374228:-MEP18Ziziphus jujubaNC_029686.123742212374228-8
Aquilegia_coerulea_KZ305074.1:1564326-1564333:+MEP18Aquilegia coeruleaKZ305074.115643261564333+8
Arabidopsis_lyrata_subsp._lyrata_NW_003302549.1:2205106-2205113:-MEP18Arabidopsis lyrata subsp.  lyrataNW_003302549.122051062205113-8
Arabidopsis_thaliana_NC_003075.7:16936676-16936683:+MEP18Arabidopsis thalianaNC_003075.71693667616936683+8
Brachypodium_distachyon_NC_016133.3:56506529-56506536:+MEP18Brachypodium distachyonNC_016133.35650652956506536+8
Capsella_rubella_NW_006238917.1:1707722-1707729:-MEP18Capsella rubellaNW_006238917.117077221707729-8
Citrus_clementina_NW_006262075.1:444032-444039:+MEP18Citrus clementinaNW_006262075.1444032444039+8
Cucumis_sativus_NC_026656.2:211909-211916:+MEP18Cucumis sativusNC_026656.2211909211916+8
Cucurbita_maxima_NW_019272045.1:3197763-3197770:-MEP18Cucurbita maximaNW_019272045.131977633197770-8
Cucurbita_moschata_NW_019268522.1:57679-57686:+MEP18Cucurbita moschataNW_019268522.15767957686+8
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036644.1:9539395-9539402:-MEP18Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036644.195393959539402-8
Eutrema_salsugineum_NW_006256909.1:1825452-1825459:-MEP18Eutrema salsugineumNW_006256909.118254521825459-8
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020491.1:6902051-6902058:-MEP18Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020491.169020516902058-8
Herrania_umbratica_NW_018397255.1:300819-300826:+MEP18Herrania umbraticaNW_018397255.1300819300826+8
Momordica_charantia_NW_019104606.1:126911-126918:-MEP18Momordica charantiaNW_019104606.1126911126918-8
Oryza_brachyantha_NC_023164.1:24754470-24754477:-MEP18Oryza brachyanthaNC_023164.12475447024754477-8
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029257.1:33092715-33092722:-MEP18Oryza sativa Japonica GroupNC_029257.13309271533092722-8
Prunus_dulcis_NC_047656.1:17431226-17431233:+MEP18Prunus dulcisNC_047656.11743122617431233+8
Prunus_mume_NC_024133.1:13427434-13427441:-MEP18Prunus mumeNC_024133.11342743413427441-8
Prunus_persica_NC_034015.1:18556917-18556924:+MEP18Prunus persicaNC_034015.11855691718556924+8
Punica_granatum_NC_045134.1:5318306-5318313:-MEP18Punica granatumNC_045134.153183065318313-8
Sesamum_indicum_NC_026149.1:4563504-4563511:+MEP18Sesamum indicumNC_026149.145635044563511+8
Tarenaya_hassleriana_NW_010966177.1:6352708-6352715:+MEP18Tarenaya hasslerianaNW_010966177.163527086352715+8
Theobroma_cacao_NC_030850.1:463505-463512:+MEP18Theobroma cacaoNC_030850.1463505463512+8