Cluster ID: MEP44

Size 15
Phase 1
Pfam domain ID Unknown
Exon block sizes in the Microexon-tag 46,15,47
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq RTTTATGRGCTTTGTGATRTTGACTTGAAAGATTTYAGYMTBCAAGCWTWTGGRCARCAAGGBTGTYTACTTCGRAGCTTRCCTRCAGATRTKGTRTTTGACAAYWCW
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP44 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
Gm_12:688837-688851:-MEP44G. max12688837688851-15
Gm_9:45179994-45180008:+MEP44G. max94517999445180008+15
Ha_9:141124590-141124604:-MEP44H. annuus9141124590141124604-15
Os_10:20780417-20780431:-MEP44O. sativa102078041720780431-15
Pp_13:11957203-11957217:+MEP44P. patens131195720311957217+15
Pp_13:633025-633039:+MEP44P. patens13633025633039+15
Pp_5:10777656-10777670:-MEP44P. patens51077765610777670-15
Ps_NC_039359.1:107733748-107733762:+MEP44P. somniferumNC_039359.1107733748107733762+15
Ps_NC_039367.1:62881612-62881626:+MEP44P. somniferumNC_039367.16288161262881626+15
Sm_GL377579:907715-907729:+MEP44S. moellendorffiiGL377579907715907729+15
Vv_5:23450148-23450162:-MEP44V. vinifera52345014823450162-15
Zm_1:84229758-84229772:-MEP44Z. mays18422975884229772-15
Hv_1H:347882616-347882630:-MEP44H. vulgare1H347882616347882630-15
Pt_17:1320281-1320295:+MEP44P. trichocarpa1713202811320295+15
Pt_7:14640978-14640992:-MEP44P. trichocarpa71464097814640992-15
Pt_7:14654556-14654570:-MEP44P. trichocarpa71465455614654570-15
Pt_7:14668140-14668154:-MEP44P. trichocarpa71466814014668154-15
Sb_1:60377766-60377780:+MEP44S. bicolor16037776660377780+15
Sl_11:31097807-31097821:-MEP44S. lycopersicum113109780731097821-15
Sl_8:3348006-3348020:+MEP44S. lycopersicum833480063348020+15
Ta_1A:333921346-333921360:+MEP44T. aestivum1A333921346333921360+15
Ta_1B:370163427-370163441:+MEP44T. aestivum1B370163427370163441+15
Ta_1D:268929965-268929979:-MEP44T. aestivum1D268929965268929979-15
Nicotiana_tabacum_NW_015870863.1:18130-18144:+MEP44Nicotiana tabacumNW_015870863.11813018144+15
Nicotiana_tabacum_NW_015905230.1:64906-64920:-MEP44Nicotiana tabacumNW_015905230.16490664920-15
Triticum_dicoccoides_NC_041380.1:346527127-346527141:+MEP44Triticum dicoccoidesNC_041380.1346527127346527141+15
Triticum_dicoccoides_NC_041381.1:389631072-389631086:+MEP44Triticum dicoccoidesNC_041381.1389631072389631086+15
Ginkgo_biloba_Chr8:545921179-545921193:+MEP44Ginkgo bilobaChr8545921179545921193+15
Ginkgo_biloba_Chr4:616159407-616159421:-MEP44Ginkgo bilobaChr4616159407616159421-15
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017948593.1:321643-321657:-MEP44Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017948593.1321643321657-15
Gnetum_montanum_scaffold373995:542550-542564:-MEP44Gnetum montanumscaffold373995542550542564-15
Gnetum_montanum_scaffold800909:837089-837103:-MEP44Gnetum montanumscaffold800909837089837103-15
Nicotiana_sylvestris_NW_009424625.1:49012-49026:-MEP44Nicotiana sylvestrisNW_009424625.14901249026-15
Nicotiana_sylvestris_NW_009515554.1:67537-67551:-MEP44Nicotiana sylvestrisNW_009515554.16753767551-15
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008912887.1:35635-35649:-MEP44Nicotiana tomentosiformisNW_008912887.13563535649-15
Camellia_sinensis_NW_021027599.1:452560-452574:-MEP44Camellia sinensisNW_021027599.1452560452574-15
Nicotiana_attenuata_NC_031994.1:2063346-2063360:-MEP44Nicotiana attenuataNC_031994.120633462063360-15
Nicotiana_attenuata_NW_017673792.1:72611-72625:-MEP44Nicotiana attenuataNW_017673792.17261172625-15
Helianthus_annuus_NC_035446.2:65671367-65671381:+MEP44Helianthus annuusNC_035446.26567136765671381+15
Lactuca_sativa_NW_019675472.1:249618-249632:+MEP44Lactuca sativaNW_019675472.1249618249632+15
Papaver_somniferum_NC_039359.1:107733748-107733762:+MEP44Papaver somniferumNC_039359.1107733748107733762+15
Papaver_somniferum_NC_039367.1:62881612-62881626:+MEP44Papaver somniferumNC_039367.16288161262881626+15
Elaeis_guineensis_NC_025994.1:1684460-1684474:+MEP44Elaeis guineensisNC_025994.116844601684474+15
Elaeis_guineensis_NC_026001.1:25659805-25659819:+MEP44Elaeis guineensisNC_026001.12565980525659819+15
Elaeis_guineensis_NC_025994.1:29719208-29719222:-MEP44Elaeis guineensisNC_025994.12971920829719222-15
Elaeis_guineensis_NW_011551172.1:166340-166354:-MEP44Elaeis guineensisNW_011551172.1166340166354-15
Gossypium_hirsutum_NC_030083.1:14442579-14442593:-MEP44Gossypium hirsutumNC_030083.11444257914442593-15
Gossypium_hirsutum_NC_030087.1:3495387-3495401:-MEP44Gossypium hirsutumNC_030087.134953873495401-15
Hevea_brasiliensis_NW_018746250.1:756683-756697:-MEP44Hevea brasiliensisNW_018746250.1756683756697-15
Liriodendron_chinense_ML058411.1:495814-495828:-MEP44Liriodendron chinenseML058411.1495814495828-15
Liriodendron_chinense_PVNU02004155.1:1711475-1711489:-MEP44Liriodendron chinensePVNU02004155.117114751711489-15
Olea_europaea_var._sylvestris_NW_019265529.1:19219-19233:+MEP44Olea europaea var.  sylvestrisNW_019265529.11921919233+15
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036240.1:5475473-5475487:-MEP44Olea europaea var.  sylvestrisNC_036240.154754735475487-15
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036254.1:7751795-7751809:-MEP44Olea europaea var.  sylvestrisNC_036254.177517957751809-15
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036258.1:6266702-6266716:-MEP44Olea europaea var.  sylvestrisNC_036258.162667026266716-15
Persea_americana_SDSS01000060.1:695507-695521:-MEP44Persea americanaSDSS01000060.1695507695521-15
Phalaenopsis_equestris_NW_018164959.1:42949-42963:+MEP44Phalaenopsis equestrisNW_018164959.14294942963+15
Zea_mays_NC_050096.1:83407489-83407503:-MEP44Zea maysNC_050096.18340748983407503-15
Chenopodium_quinoa_NW_018743391.1:2643844-2643858:+MEP44Chenopodium quinoaNW_018743391.126438442643858+15
Chenopodium_quinoa_NW_018745684.1:5578117-5578131:-MEP44Chenopodium quinoaNW_018745684.155781175578131-15
Gossypium_arboreum_NC_030674.1:35326809-35326823:-MEP44Gossypium arboreumNC_030674.13532680935326823-15
Hibiscus_syriacus_NW_024062798.1:201502-201516:+MEP44Hibiscus syriacusNW_024062798.1201502201516+15
Hibiscus_syriacus_NW_024063495.1:2825796-2825810:+MEP44Hibiscus syriacusNW_024063495.128257962825810+15
Hibiscus_syriacus_NW_024062574.1:1264702-1264716:-MEP44Hibiscus syriacusNW_024062574.112647021264716-15
Hibiscus_syriacus_NW_024063263.1:1350423-1350437:-MEP44Hibiscus syriacusNW_024063263.113504231350437-15
Prosopis_alba_NW_021637663.1:9328-9342:+MEP44Prosopis albaNW_021637663.193289342+15
Prosopis_alba_NW_021637609.1:78590-78604:-MEP44Prosopis albaNW_021637609.17859078604-15
Asparagus_officinalis_NC_033795.1:8585888-8585902:+MEP44Asparagus officinalisNC_033795.185858888585902+15
Coffea_arabica_NC_039902.1:33108793-33108807:-MEP44Coffea arabicaNC_039902.13310879333108807-15
Coffea_arabica_NC_039903.1:28949648-28949662:-MEP44Coffea arabicaNC_039903.12894964828949662-15
Coffea_eugenioides_NC_040037.1:34734558-34734572:-MEP44Coffea eugenioidesNC_040037.13473455834734572-15
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037528.1:30856521-30856535:+MEP44Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037528.13085652130856535+15
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037543.1:12228317-12228331:-MEP44Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037543.11222831712228331-15
Dendrobium_catenatum_NW_021318644.1:25106-25120:+MEP44Dendrobium catenatumNW_021318644.12510625120+15
Glycine_soja_NC_041010.1:43078240-43078254:+MEP44Glycine sojaNC_041010.14307824043078254+15
Glycine_soja_NC_041013.1:686797-686811:-MEP44Glycine sojaNC_041013.1686797686811-15
Spinacia_oleracea_NW_018932821.1:18441-18455:+MEP44Spinacia oleraceaNW_018932821.11844118455+15
Actinidia_rufa_BJWL01000002.1:9233066-9233080:+MEP44Actinidia rufaBJWL01000002.192330669233080+15
Amborella_trichopoda_NW_006500355.1:3571770-3571784:-MEP44Amborella trichopodaNW_006500355.135717703571784-15
Benincasa_hispida_NC_052349.1:94805188-94805202:+MEP44Benincasa hispidaNC_052349.19480518894805202+15
Cajanus_cajan_NC_033807.1:761671-761685:-MEP44Cajanus cajanNC_033807.1761671761685-15
Cannabis_sativa_NC_044375.1:95966359-95966373:-MEP44Cannabis sativaNC_044375.19596635995966373-15
Cicer_arietinum_NW_004515740.1:40659-40673:+MEP44Cicer arietinumNW_004515740.14065940673+15
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000012.1:13614421-13614435:-MEP44Cinnamomum micranthumQPKB01000012.11361442113614435-15
Coffea_canephora_HG974430.1:21864788-21864802:-MEP44Coffea canephoraHG974430.12186478821864802-15
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052475.1:3186472-3186486:-MEP44Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052475.131864723186486-15
Durio_zibethinus_NW_019167904.1:2591767-2591781:+MEP44Durio zibethinusNW_019167904.125917672591781+15
Durio_zibethinus_NW_019168026.1:9610783-9610797:+MEP44Durio zibethinusNW_019168026.196107839610797+15
Durio_zibethinus_NW_019168270.1:1153519-1153533:+MEP44Durio zibethinusNW_019168270.111535191153533+15
Eucalyptus_grandis_NC_052612.1:2169512-2169526:-MEP44Eucalyptus grandisNC_052612.121695122169526-15
Glycine_max_NC_038245.1:45179994-45180008:+MEP44Glycine maxNC_038245.14517999445180008+15
Glycine_max_NC_038248.1:688837-688851:-MEP44Glycine maxNC_038248.1688837688851-15
Gossypium_raimondii_NC_026934.1:48021150-48021164:-MEP44Gossypium raimondiiNC_026934.14802115048021164-15
Ipomoea_nil_NW_017619354.1:5216979-5216993:-MEP44Ipomoea nilNW_017619354.152169795216993-15
Nelumbo_nucifera_NW_010729125.1:2531402-2531416:-MEP44Nelumbo nuciferaNW_010729125.125314022531416-15
Phoenix_dactylifera_NC_052392.1:40003693-40003707:-MEP44Phoenix dactyliferaNC_052392.14000369340003707-15
Phoenix_dactylifera_NC_052405.1:11409254-11409268:-MEP44Phoenix dactyliferaNC_052405.11140925411409268-15
Piper_nigrum_Pn5:7815592-7815606:+MEP44Piper nigrumPn578155927815606+15
Piper_nigrum_Pn5:8031309-8031323:+MEP44Piper nigrumPn580313098031323+15
Piper_nigrum_Pn7:7496807-7496821:+MEP44Piper nigrumPn774968077496821+15
Piper_nigrum_Pn7:8022102-8022116:+MEP44Piper nigrumPn780221028022116+15
Pistacia_vera_NW_022195652.1:185828-185842:-MEP44Pistacia veraNW_022195652.1185828185842-15
Pistacia_vera_NW_022196679.1:237544-237558:-MEP44Pistacia veraNW_022196679.1237544237558-15
Populus_euphratica_NW_011500022.1:505825-505839:+MEP44Populus euphraticaNW_011500022.1505825505839+15
Populus_euphratica_NW_011499967.1:375433-375447:-MEP44Populus euphraticaNW_011499967.1375433375447-15
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988087.1:605992-606006:-MEP44Pyrus x bretschneideriNW_008988087.1605992606006-15
Solanum_lycopersicum_NC_015445.3:3348006-3348020:+MEP44Solanum lycopersicumNC_015445.333480063348020+15
Solanum_lycopersicum_NC_015448.3:31097807-31097821:-MEP44Solanum lycopersicumNC_015448.33109780731097821-15
Solanum_pennellii_NC_028644.1:3571118-3571132:+MEP44Solanum pennelliiNC_028644.135711183571132+15
Solanum_pennellii_NC_028647.1:47730230-47730244:+MEP44Solanum pennelliiNC_028647.14773023047730244+15
Solanum_tuberosum_NW_006239161.1:988339-988353:+MEP44Solanum tuberosumNW_006239161.1988339988353+15
Solanum_tuberosum_NW_006239070.1:217313-217327:-MEP44Solanum tuberosumNW_006239070.1217313217327-15
Abrus_precatorius_NW_020874384.1:8568227-8568241:+MEP44Abrus precatoriusNW_020874384.185682278568241+15
Ananas_comosus_NC_033640.1:1291058-1291072:+MEP44Ananas comosusNC_033640.112910581291072+15
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025814.2:12992826-12992840:-MEP44Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025814.21299282612992840-15
Carica_papaya_NW_019014638.1:8820-8834:-MEP44Carica papayaNW_019014638.188208834-15
Carica_papaya_NW_019014683.1:2332982-2332996:-MEP44Carica papayaNW_019014683.123329822332996-15
Ceratophyllum_demersum_5:25786521-25786535:-MEP44Ceratophyllum demersum52578652125786535-15
Ceratophyllum_demersum_5:25916173-25916187:-MEP44Ceratophyllum demersum52591617325916187-15
Ceratophyllum_demersum_5:26152768-26152782:-MEP44Ceratophyllum demersum52615276826152782-15
Citrus_sinensis_NC_023050.1:26852671-26852685:-MEP44Citrus sinensisNC_023050.12685267126852685-15
Cucumis_melo_NW_007546298.1:2183915-2183929:+MEP44Cucumis meloNW_007546298.121839152183929+15
Erythranthe_guttata_NW_012193028.1:1529384-1529398:+MEP44Erythranthe guttataNW_012193028.115293841529398+15
Euryale_ferox_25:98164-98178:+MEP44Euryale ferox259816498178+15
Euryale_ferox_26:2754477-2754491:+MEP44Euryale ferox2627544772754491+15
Ipomoea_triloba_NC_044916.1:32230536-32230550:-MEP44Ipomoea trilobaNC_044916.13223053632230550-15
Jatropha_curcas_NW_023591078.1:764034-764048:+MEP44Jatropha curcasNW_023591078.1764034764048+15
Juglans_regia_NC_049907.1:37885550-37885564:+MEP44Juglans regiaNC_049907.13788555037885564+15
Juglans_regia_NC_049912.1:22924517-22924531:+MEP44Juglans regiaNC_049912.12292451722924531+15
Macleaya_cordata_MVGT01001732.1:278930-278944:+MEP44Macleaya cordataMVGT01001732.1278930278944+15
Malus_domestica_NC_041791.1:31686460-31686474:+MEP44Malus domesticaNC_041791.13168646031686474+15
Manihot_esculenta_NC_035171.1:23767647-23767661:-MEP44Manihot esculentaNC_035171.12376764723767661-15
Morus_notabilis_NW_010360036.1:431797-431811:-MEP44Morus notabilisNW_010360036.1431797431811-15
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025209.1:14118491-14118505:-MEP44Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025209.11411849114118505-15
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025212.1:11781433-11781447:-MEP44Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025212.11178143311781447-15
Nymphaea_colorata_NC_045140.1:19624376-19624390:+MEP44Nymphaea colorataNC_045140.11962437619624390+15
Panicum_hallii_NC_038050.1:57322452-57322466:+MEP44Panicum halliiNC_038050.15732245257322466+15
Phaseolus_vulgaris_NC_023749.1:903383-903397:+MEP44Phaseolus vulgarisNC_023749.1903383903397+15
Physcomitrella_patens_NC_037265.1:633025-633039:+MEP44Physcomitrella patensNC_037265.1633025633039+15
Physcomitrella_patens_NC_037265.1:11957203-11957217:+MEP44Physcomitrella patensNC_037265.11195720311957217+15
Physcomitrella_patens_NC_037257.1:10777656-10777670:-MEP44Physcomitrella patensNC_037257.11077765610777670-15
Populus_alba_NW_023271727.1:21652-21666:-MEP44Populus albaNW_023271727.12165221666-15
Populus_alba_NW_023271850.1:232138-232152:-MEP44Populus albaNW_023271850.1232138232152-15
Populus_trichocarpa_NC_037301.1:1509136-1509150:+MEP44Populus trichocarpaNC_037301.115091361509150+15
Populus_trichocarpa_NW_020167921.1:2975-2989:+MEP44Populus trichocarpaNW_020167921.129752989+15
Populus_trichocarpa_NC_037291.1:14725079-14725093:-MEP44Populus trichocarpaNC_037291.11472507914725093-15
Populus_trichocarpa_NC_037291.1:14738645-14738659:-MEP44Populus trichocarpaNC_037291.11473864514738659-15
Prunus_avium_NW_018924182.1:25796-25810:+MEP44Prunus aviumNW_018924182.12579625810+15
Prunus_avium_NW_018924999.1:10157-10171:-MEP44Prunus aviumNW_018924999.11015710171-15
Rhodamnia_argentea_NW_022060819.1:1507269-1507283:+MEP44Rhodamnia argenteaNW_022060819.115072691507283+15
Rhododendron_simsii_CM024954.1:13050486-13050500:-MEP44Rhododendron simsiiCM024954.11305048613050500-15
Ricinus_communis_NW_002994701.1:23564-23578:-MEP44Ricinus communisNW_002994701.12356423578-15
Rosa_chinensis_NC_037091.1:27499681-27499695:-MEP44Rosa chinensisNC_037091.12749968127499695-15
Setaria_italica_NC_028458.1:40414045-40414059:+MEP44Setaria italicaNC_028458.14041404540414059+15
Setaria_viridis_NC_048271.1:38719712-38719726:+MEP44Setaria viridisNC_048271.13871971238719726+15
Sorghum_bicolor_NC_012870.2:60377766-60377780:+MEP44Sorghum bicolorNC_012870.26037776660377780+15
Tripterygium_wilfordii_NC_052233.1:9958698-9958712:+MEP44Tripterygium wilfordiiNC_052233.199586989958712+15
Vigna_angularis_NC_030644.1:30061069-30061083:-MEP44Vigna angularisNC_030644.13006106930061083-15
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028352.1:839098-839112:+MEP44Vigna radiata var.  radiataNC_028352.1839098839112+15
Vigna_unguiculata_NC_040289.1:40922945-40922959:-MEP44Vigna unguiculataNC_040289.14092294540922959-15
Vitis_riparia_NC_048435.1:23182016-23182030:-MEP44Vitis ripariaNC_048435.12318201623182030-15
Vitis_vinifera_NC_012011.3:23450148-23450162:-MEP44Vitis viniferaNC_012011.32345014823450162-15
Ziziphus_jujuba_NW_015453504.1:28560-28574:+MEP44Ziziphus jujubaNW_015453504.12856028574+15
Ziziphus_jujuba_NC_029679.1:40354490-40354504:-MEP44Ziziphus jujubaNC_029679.14035449040354504-15
Aquilegia_coerulea_KZ305124.1:342222-342236:+MEP44Aquilegia coeruleaKZ305124.1342222342236+15
Brachypodium_distachyon_NC_016133.3:33960681-33960695:-MEP44Brachypodium distachyonNC_016133.33396068133960695-15
Citrus_clementina_NW_006262339.1:37499142-37499156:-MEP44Citrus clementinaNW_006262339.13749914237499156-15
Cucumis_sativus_NC_026658.2:1595200-1595214:-MEP44Cucumis sativusNC_026658.215952001595214-15
Cucurbita_maxima_NW_019272021.1:2938719-2938733:-MEP44Cucurbita maximaNW_019272021.129387192938733-15
Cucurbita_maxima_NW_019272063.1:297707-297721:-MEP44Cucurbita maximaNW_019272063.1297707297721-15
Cucurbita_moschata_NW_019268536.1:1953416-1953430:+MEP44Cucurbita moschataNW_019268536.119534161953430+15
Cucurbita_moschata_NW_019268602.1:401280-401294:+MEP44Cucurbita moschataNW_019268602.1401280401294+15
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036640.1:9790059-9790073:-MEP44Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036640.197900599790073-15
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036645.1:327375-327389:-MEP44Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036645.1327375327389-15
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NW_004443442.1:307588-307602:+MEP44Fragaria vesca subsp.  vescaNW_004443442.1307588307602+15
Herrania_umbratica_NW_018397264.1:1599550-1599564:+MEP44Herrania umbraticaNW_018397264.115995501599564+15
Momordica_charantia_NW_019104525.1:145327-145341:+MEP44Momordica charantiaNW_019104525.1145327145341+15
Oryza_brachyantha_NC_023172.1:12610196-12610210:-MEP44Oryza brachyanthaNC_023172.11261019612610210-15
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029265.1:20780417-20780431:-MEP44Oryza sativa Japonica GroupNC_029265.12078041720780431-15
Prunus_dulcis_NC_047650.1:18349138-18349152:-MEP44Prunus dulcisNC_047650.11834913818349152-15
Prunus_dulcis_NC_047653.1:10973241-10973255:-MEP44Prunus dulcisNC_047653.11097324110973255-15
Prunus_dulcis_NC_047656.1:4498007-4498021:-MEP44Prunus dulcisNC_047656.144980074498021-15
Prunus_mume_NC_024128.1:11740130-11740144:-MEP44Prunus mumeNC_024128.11174013011740144-15
Prunus_mume_NW_007362601.1:4659-4673:-MEP44Prunus mumeNW_007362601.146594673-15
Prunus_persica_NC_034009.1:19831591-19831605:-MEP44Prunus persicaNC_034009.11983159119831605-15
Prunus_persica_NC_034012.1:10631208-10631222:-MEP44Prunus persicaNC_034012.11063120810631222-15
Sesamum_indicum_NC_026154.1:5658807-5658821:+MEP44Sesamum indicumNC_026154.156588075658821+15
Theobroma_cacao_NC_030853.1:24223404-24223418:+MEP44Theobroma cacaoNC_030853.12422340424223418+15