Cluster ID: MEP33

Size 13
Phase 2
Pfam domain ID Unknown
Exon block sizes in the Microexon-tag 47,13,48
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq GAVTTYYTRTCARTHTCRGARTTYCTWGTKGARRTWTCTGATGAYYTGTWTGAYTAYGAGGATGAYGTKTTRRAGAAYAAYTTCAAYATTYTGCGCATGTTTGTYRRA
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP33 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_5:3244674-3244686:-MEP33A. thaliana532446743244686-13
Gm_11:33539133-33539145:-MEP33G. max113353913333539145-13
Gm_18:1123922-1123934:+MEP33G. max1811239221123934+13
Ha_2:5375308-5375320:-MEP33H. annuus253753085375320-13
Os_4:22476980-22476992:+MEP33O. sativa42247698022476992+13
Pp_26:1867603-1867615:-MEP33P. patens2618676031867615-13
Pp_3:10039830-10039842:-MEP33P. patens31003983010039842-13
Ps_NC_039359.1:34115955-34115967:+MEP33P. somniferumNC_039359.13411595534115967+13
Ps_NW_020621936.1:8539951-8539963:-MEP33P. somniferumNW_020621936.185399518539963-13
Sm_GL377586:1943352-1943364:-MEP33S. moellendorffiiGL37758619433521943364-13
Sm_GL377605:1651840-1651852:+MEP33S. moellendorffiiGL37760516518401651852+13
Sm_GL377640:922714-922726:+MEP33S. moellendorffiiGL377640922714922726+13
Sm_GL377705:150613-150625:+MEP33S. moellendorffiiGL377705150613150625+13
Sm_GL377733:27691-27703:-MEP33S. moellendorffiiGL3777332769127703-13
Vv_Un:27160870-27160882:-MEP33V. viniferaUn2716087027160882-13
Zm_2:45884860-45884872:-MEP33Z. mays24588486045884872-13
Bn_scaffoldA10:23862592-23862604:+MEP33B. napusscaffoldA102386259223862604+13
Bn_scaffoldC09:64197730-64197742:+MEP33B. napusscaffoldC096419773064197742+13
Hv_2H:504845478-504845490:+MEP33H. vulgare2H504845478504845490+13
Pt_5:4901418-4901430:+MEP33P. trichocarpa549014184901430+13
Sb_6:47149086-47149098:+MEP33S. bicolor64714908647149098+13
Sl_11:3183767-3183779:-MEP33S. lycopersicum1131837673183779-13
Ta_2A:544309664-544309676:+MEP33T. aestivum2A544309664544309676+13
Ta_2B:481882265-481882277:+MEP33T. aestivum2B481882265481882277+13
Ta_2D:406208905-406208917:+MEP33T. aestivum2D406208905406208917+13
Nicotiana_tabacum_NW_015949923.1:18878-18890:+MEP33Nicotiana tabacumNW_015949923.11887818890+13
Nicotiana_tabacum_NW_015950399.1:24984-24996:-MEP33Nicotiana tabacumNW_015950399.12498424996-13
Triticum_dicoccoides_NC_041382.1:548044389-548044401:+MEP33Triticum dicoccoidesNC_041382.1548044389548044401+13
Triticum_dicoccoides_NC_041383.1:497201749-497201761:+MEP33Triticum dicoccoidesNC_041383.1497201749497201761+13
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017908313.1:41847-41859:-MEP33Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017908313.14184741859-13
Nicotiana_sylvestris_NW_009519776.1:19515-19527:+MEP33Nicotiana sylvestrisNW_009519776.11951519527+13
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008981807.1:24113-24125:-MEP33Nicotiana tomentosiformisNW_008981807.12411324125-13
Camellia_sinensis_NW_021026066.1:793522-793534:-MEP33Camellia sinensisNW_021026066.1793522793534-13
Nicotiana_attenuata_NW_017671734.1:233104-233116:+MEP33Nicotiana attenuataNW_017671734.1233104233116+13
Capsicum_annuum_NC_029988.1:224634019-224634031:-MEP33Capsicum annuumNC_029988.1224634019224634031-13
Colocasia_esculenta_CM024764.1:80140486-80140498:+MEP33Colocasia esculentaCM024764.18014048680140498+13
Helianthus_annuus_NC_035444.2:122596934-122596946:-MEP33Helianthus annuusNC_035444.2122596934122596946-13
Lactuca_sativa_NW_019680628.1:134300-134312:-MEP33Lactuca sativaNW_019680628.1134300134312-13
Papaver_somniferum_NC_039359.1:34115955-34115967:+MEP33Papaver somniferumNC_039359.13411595534115967+13
Papaver_somniferum_NW_020621936.1:8539951-8539963:-MEP33Papaver somniferumNW_020621936.185399518539963-13
Arachis_hypogaea_NC_037627.1:11861027-11861039:+MEP33Arachis hypogaeaNC_037627.11186102711861039+13
Arachis_hypogaea_NC_037637.1:18925541-18925553:+MEP33Arachis hypogaeaNC_037637.11892554118925553+13
Elaeis_guineensis_NC_026007.1:17741611-17741623:-MEP33Elaeis guineensisNC_026007.11774161117741623-13
Gossypium_hirsutum_NC_030095.1:12511583-12511595:-MEP33Gossypium hirsutumNC_030095.11251158312511595-13
Hevea_brasiliensis_NW_018746037.1:1079594-1079606:-MEP33Hevea brasiliensisNW_018746037.110795941079606-13
Liriodendron_chinense_PVNU02002694.1:2089047-2089059:+MEP33Liriodendron chinensePVNU02002694.120890472089059+13
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036246.1:9105582-9105594:-MEP33Olea europaea var.  sylvestrisNC_036246.191055829105594-13
Persea_americana_SDSS01000037.1:603494-603506:+MEP33Persea americanaSDSS01000037.1603494603506+13
Phalaenopsis_equestris_NW_018164576.1:2678825-2678837:-MEP33Phalaenopsis equestrisNW_018164576.126788252678837-13
Zea_mays_NC_050097.1:45830052-45830064:-MEP33Zea maysNC_050097.14583005245830064-13
Chenopodium_quinoa_NW_018745684.1:1061599-1061611:+MEP33Chenopodium quinoaNW_018745684.110615991061611+13
Chenopodium_quinoa_NW_018743574.1:4920060-4920072:-MEP33Chenopodium quinoaNW_018743574.149200604920072-13
Gossypium_arboreum_NC_030672.1:9349947-9349959:-MEP33Gossypium arboreumNC_030672.193499479349959-13
Hibiscus_syriacus_NW_024062783.1:519450-519462:-MEP33Hibiscus syriacusNW_024062783.1519450519462-13
Prosopis_alba_NW_021632501.1:30216-30228:+MEP33Prosopis albaNW_021632501.13021630228+13
Prosopis_alba_NW_021636181.1:139576-139588:-MEP33Prosopis albaNW_021636181.1139576139588-13
Quercus_suber_NW_019823064.1:192613-192625:+MEP33Quercus suberNW_019823064.1192613192625+13
Quercus_suber_NW_019823064.1:215279-215291:+MEP33Quercus suberNW_019823064.1215279215291+13
Arachis_duranensis_NC_029781.2:12040319-12040331:+MEP33Arachis duranensisNC_029781.21204031912040331+13
Arachis_ipaensis_NC_029794.2:18025382-18025394:+MEP33Arachis ipaensisNC_029794.21802538218025394+13
Asparagus_officinalis_NC_033796.1:5714919-5714931:-MEP33Asparagus officinalisNC_033796.157149195714931-13
Brassica_napus_NC_027766.2:18079387-18079399:+MEP33Brassica napusNC_027766.21807938718079399+13
Brassica_napus_NW_019168639.1:166317-166329:-MEP33Brassica napusNW_019168639.1166317166329-13
Coffea_arabica_NC_039901.1:60114617-60114629:+MEP33Coffea arabicaNC_039901.16011461760114629+13
Coffea_arabica_NC_039910.1:11077274-11077286:+MEP33Coffea arabicaNC_039910.11107727411077286+13
Coffea_arabica_NC_039911.1:8317805-8317817:+MEP33Coffea arabicaNC_039911.183178058317817+13
Coffea_eugenioides_NC_040036.1:66290718-66290730:+MEP33Coffea eugenioidesNC_040036.16629071866290730+13
Coffea_eugenioides_NC_040041.1:7167508-7167520:-MEP33Coffea eugenioidesNC_040041.171675087167520-13
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037532.1:23406717-23406729:-MEP33Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037532.12340671723406729-13
Dendrobium_catenatum_NW_021318998.1:542962-542974:-MEP33Dendrobium catenatumNW_021318998.1542962542974-13
Glycine_soja_NC_041019.1:1171329-1171341:+MEP33Glycine sojaNC_041019.111713291171341+13
Glycine_soja_NC_041014.1:30302915-30302927:-MEP33Glycine sojaNC_041014.13030291530302927-13
Spinacia_oleracea_NW_018931881.1:280647-280659:+MEP33Spinacia oleraceaNW_018931881.1280647280659+13
Spinacia_oleracea_NW_018931422.1:1145045-1145057:-MEP33Spinacia oleraceaNW_018931422.111450451145057-13
Actinidia_rufa_BJWL01000001.1:483887-483899:+MEP33Actinidia rufaBJWL01000001.1483887483899+13
Actinidia_rufa_BJWL01000001.1:565068-565080:+MEP33Actinidia rufaBJWL01000001.1565068565080+13
Amborella_trichopoda_NW_006494931.1:8666460-8666472:-MEP33Amborella trichopodaNW_006494931.186664608666472-13
Benincasa_hispida_NC_052349.1:25698052-25698064:-MEP33Benincasa hispidaNC_052349.12569805225698064-13
Cajanus_cajan_NC_033804.1:2314382-2314394:+MEP33Cajanus cajanNC_033804.123143822314394+13
Cannabis_sativa_NC_044373.1:76379639-76379651:-MEP33Cannabis sativaNC_044373.17637963976379651-13
Cicer_arietinum_NC_021164.1:43443137-43443149:+MEP33Cicer arietinumNC_021164.14344313743443149+13
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000009.1:34006832-34006844:-MEP33Cinnamomum micranthumQPKB01000009.13400683234006844-13
Coffea_canephora_HG974434.1:11482525-11482537:+MEP33Coffea canephoraHG974434.11148252511482537+13
Durio_zibethinus_NW_019167860.1:18891214-18891226:-MEP33Durio zibethinusNW_019167860.11889121418891226-13
Eucalyptus_grandis_NC_052619.1:68342654-68342666:+MEP33Eucalyptus grandisNC_052619.16834265468342666+13
Glycine_max_NC_038254.1:1123922-1123934:+MEP33Glycine maxNC_038254.111239221123934+13
Glycine_max_NC_038247.1:33539133-33539145:-MEP33Glycine maxNC_038247.13353913333539145-13
Gossypium_raimondii_NC_026939.1:14351968-14351980:-MEP33Gossypium raimondiiNC_026939.11435196814351980-13
Ipomoea_nil_NW_017617233.1:1129533-1129545:+MEP33Ipomoea nilNW_017617233.111295331129545+13
Lupinus_angustifolius_NC_032019.1:35611006-35611018:+MEP33Lupinus angustifoliusNC_032019.13561100635611018+13
Nelumbo_nucifera_NW_010729151.1:2683371-2683383:+MEP33Nelumbo nuciferaNW_010729151.126833712683383+13
Phoenix_dactylifera_NC_052406.1:6364501-6364513:+MEP33Phoenix dactyliferaNC_052406.163645016364513+13
Piper_nigrum_Pn20:10416114-10416126:-MEP33Piper nigrumPn201041611410416126-13
Pistacia_vera_NW_022196427.1:166513-166525:-MEP33Pistacia veraNW_022196427.1166513166525-13
Populus_euphratica_NW_011499886.1:529159-529171:-MEP33Populus euphraticaNW_011499886.1529159529171-13
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988224.1:625656-625668:-MEP33Pyrus x bretschneideriNW_008988224.1625656625668-13
Quercus_lobata_NC_044909.1:48478383-48478395:+MEP33Quercus lobataNC_044909.14847838348478395+13
Quercus_lobata_NC_044909.1:48510078-48510090:+MEP33Quercus lobataNC_044909.14851007848510090+13
Solanum_lycopersicum_NC_015448.3:3183767-3183779:-MEP33Solanum lycopersicumNC_015448.331837673183779-13
Solanum_pennellii_NC_028647.1:3301249-3301261:-MEP33Solanum pennelliiNC_028647.133012493301261-13
Solanum_tuberosum_NW_006239078.1:799653-799665:+MEP33Solanum tuberosumNW_006239078.1799653799665+13
Syzygium_oleosum_NW_022076643.1:336804-336816:+MEP33Syzygium oleosumNW_022076643.1336804336816+13
Abrus_precatorius_NW_020874439.1:34555682-34555694:-MEP33Abrus precatoriusNW_020874439.13455568234555694-13
Ananas_comosus_NC_033640.1:9478710-9478722:+MEP33Ananas comosusNC_033640.194787109478722+13
Ananas_comosus_NW_017891238.1:4951-4963:+MEP33Ananas comosusNW_017891238.149514963+13
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025817.2:9144689-9144701:+MEP33Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025817.291446899144701+13
Brassica_oleracea_var._oleracea_NC_027756.1:50936187-50936199:+MEP33Brassica oleracea var.  oleraceaNC_027756.15093618750936199+13
Brassica_rapa_NC_024804.2:18064489-18064501:+MEP33Brassica rapaNC_024804.21806448918064501+13
Camelina_sativa_NC_025692.1:23215061-23215073:+MEP33Camelina sativaNC_025692.12321506123215073+13
Camelina_sativa_NC_025697.1:4149685-4149697:-MEP33Camelina sativaNC_025697.141496854149697-13
Camelina_sativa_NC_025704.1:4296043-4296055:-MEP33Camelina sativaNC_025704.142960434296055-13
Carica_papaya_NW_019014637.1:547314-547326:+MEP33Carica papayaNW_019014637.1547314547326+13
Citrus_sinensis_NC_023046.1:23006292-23006304:-MEP33Citrus sinensisNC_023046.12300629223006304-13
Cucumis_melo_NW_007546298.1:727310-727322:+MEP33Cucumis meloNW_007546298.1727310727322+13
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030384.1:23869359-23869371:-MEP33Daucus carota subsp.  sativusNC_030384.12386935923869371-13
Erythranthe_guttata_NW_012193676.1:3016734-3016746:+MEP33Erythranthe guttataNW_012193676.130167343016746+13
Euryale_ferox_20:21124910-21124922:+MEP33Euryale ferox202112491021124922+13
Ipomoea_triloba_NC_044927.1:1496526-1496538:+MEP33Ipomoea trilobaNC_044927.114965261496538+13
Jatropha_curcas_NW_023590879.1:9825-9837:-MEP33Jatropha curcasNW_023590879.198259837-13
Juglans_regia_NC_049901.1:15407758-15407770:-MEP33Juglans regiaNC_049901.11540775815407770-13
Macleaya_cordata_MVGT01004392.1:401152-401164:+MEP33Macleaya cordataMVGT01004392.1401152401164+13
Malus_domestica_NC_041789.1:11465812-11465824:-MEP33Malus domesticaNC_041789.11146581211465824-13
Manihot_esculenta_NC_035173.1:20335755-20335767:-MEP33Manihot esculentaNC_035173.12033575520335767-13
Medicago_truncatula_NC_053044.1:42893757-42893769:+MEP33Medicago truncatulaNC_053044.14289375742893769+13
Morus_notabilis_NW_010357121.1:623069-623081:-MEP33Morus notabilisNW_010357121.1623069623081-13
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025211.1:29014046-29014058:-MEP33Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025211.12901404629014058-13
Nymphaea_colorata_NC_045145.1:14411833-14411845:-MEP33Nymphaea colorataNC_045145.11441183314411845-13
Panicum_hallii_NC_038048.1:36616109-36616121:+MEP33Panicum halliiNC_038048.13661610936616121+13
Phaseolus_vulgaris_NC_023759.1:51058747-51058759:-MEP33Phaseolus vulgarisNC_023759.15105874751058759-13
Physcomitrella_patens_NC_037255.1:10039830-10039842:-MEP33Physcomitrella patensNC_037255.11003983010039842-13
Physcomitrella_patens_NC_037278.1:1867603-1867615:-MEP33Physcomitrella patensNC_037278.118676031867615-13
Populus_alba_NW_023271134.1:1265315-1265327:+MEP33Populus albaNW_023271134.112653151265327+13
Populus_trichocarpa_NC_037289.1:5361105-5361117:+MEP33Populus trichocarpaNC_037289.153611055361117+13
Prunus_avium_NW_018922154.1:35969-35981:-MEP33Prunus aviumNW_018922154.13596935981-13
Raphanus_sativus_NW_017353145.1:6646256-6646268:+MEP33Raphanus sativusNW_017353145.166462566646268+13
Rhodamnia_argentea_NW_022060818.1:1504921-1504933:+MEP33Rhodamnia argenteaNW_022060818.115049211504933+13
Rhododendron_simsii_CM024960.1:1471770-1471782:-MEP33Rhododendron simsiiCM024960.114717701471782-13
Ricinus_communis_NW_002994934.1:18409-18421:+MEP33Ricinus communisNW_002994934.11840918421+13
Rosa_chinensis_NC_037089.1:24818015-24818027:+MEP33Rosa chinensisNC_037089.12481801524818027+13
Setaria_italica_NC_028456.1:21574293-21574305:+MEP33Setaria italicaNC_028456.12157429321574305+13
Setaria_viridis_NC_048269.1:20640244-20640256:+MEP33Setaria viridisNC_048269.12064024420640256+13
Sorghum_bicolor_NC_012875.2:47149086-47149098:+MEP33Sorghum bicolorNC_012875.24714908647149098+13
Tripterygium_wilfordii_NC_052244.1:11665251-11665263:-MEP33Tripterygium wilfordiiNC_052244.11166525111665263-13
Vigna_angularis_NC_030639.1:40110481-40110493:-MEP33Vigna angularisNC_030639.14011048140110493-13
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028352.1:22759477-22759489:+MEP33Vigna radiata var.  radiataNC_028352.12275947722759489+13
Vigna_unguiculata_NC_040279.1:40908246-40908258:-MEP33Vigna unguiculataNC_040279.14090824640908258-13
Vitis_riparia_NC_048437.1:7493763-7493775:+MEP33Vitis ripariaNC_048437.174937637493775+13
Vitis_vinifera_NW_003724338.1:38189-38201:-MEP33Vitis viniferaNW_003724338.13818938201-13
Ziziphus_jujuba_NC_029686.1:13843393-13843405:+MEP33Ziziphus jujubaNC_029686.11384339313843405+13
Aquilegia_coerulea_KZ305027.1:975577-975589:+MEP33Aquilegia coeruleaKZ305027.1975577975589+13
Arabidopsis_lyrata_subsp._lyrata_NW_003302550.1:4117281-4117293:-MEP33Arabidopsis lyrata subsp.  lyrataNW_003302550.141172814117293-13
Arabidopsis_thaliana_NC_003076.8:3244674-3244686:-MEP33Arabidopsis thalianaNC_003076.832446743244686-13
Brachypodium_distachyon_NC_016135.3:15563144-15563156:+MEP33Brachypodium distachyonNC_016135.31556314415563156+13
Capsella_rubella_NW_006238918.1:3188478-3188490:-MEP33Capsella rubellaNW_006238918.131884783188490-13
Citrus_clementina_NW_006262075.1:5624803-5624815:+MEP33Citrus clementinaNW_006262075.156248035624815+13
Cucumis_sativus_NW_022279559.1:375071-375083:+MEP33Cucumis sativusNW_022279559.1375071375083+13
Cucumis_sativus_NW_022279561.1:173320-173332:+MEP33Cucumis sativusNW_022279561.1173320173332+13
Cucumis_sativus_NC_026658.2:2873893-2873905:-MEP33Cucumis sativusNC_026658.228738932873905-13
Cucumis_sativus_NW_022279559.1:32834-32846:-MEP33Cucumis sativusNW_022279559.13283432846-13
Cucurbita_maxima_NW_019272024.1:3650984-3650996:+MEP33Cucurbita maximaNW_019272024.136509843650996+13
Cucurbita_moschata_NW_019268567.1:1086562-1086574:-MEP33Cucurbita moschataNW_019268567.110865621086574-13
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036651.1:3811467-3811479:+MEP33Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036651.138114673811479+13
Eutrema_salsugineum_NW_006256829.1:3297752-3297764:-MEP33Eutrema salsugineumNW_006256829.132977523297764-13
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020491.1:13232165-13232177:+MEP33Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020491.11323216513232177+13
Herrania_umbratica_NW_018397255.1:4395620-4395632:+MEP33Herrania umbraticaNW_018397255.143956204395632+13
Momordica_charantia_NW_019104496.1:2447272-2447284:+MEP33Momordica charantiaNW_019104496.124472722447284+13
Oryza_brachyantha_NC_023166.1:11109806-11109818:+MEP33Oryza brachyanthaNC_023166.11110980611109818+13
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029259.1:22476980-22476992:+MEP33Oryza sativa Japonica GroupNC_029259.12247698022476992+13
Prunus_dulcis_NC_047655.1:18519111-18519123:-MEP33Prunus dulcisNC_047655.11851911118519123-13
Prunus_dulcis_NC_047655.1:18561258-18561270:-MEP33Prunus dulcisNC_047655.11856125818561270-13
Prunus_mume_NC_024126.1:16366528-16366540:-MEP33Prunus mumeNC_024126.11636652816366540-13
Prunus_persica_NC_034014.1:19808467-19808479:-MEP33Prunus persicaNC_034014.11980846719808479-13
Punica_granatum_NC_045129.1:9940039-9940051:+MEP33Punica granatumNC_045129.199400399940051+13
Selaginella_moellendorffii_NW_003314301.1:1651840-1651852:+MEP33Selaginella moellendorffiiNW_003314301.116518401651852+13
Selaginella_moellendorffii_NW_003314336.1:922714-922726:+MEP33Selaginella moellendorffiiNW_003314336.1922714922726+13
Selaginella_moellendorffii_NW_003314401.1:150613-150625:+MEP33Selaginella moellendorffiiNW_003314401.1150613150625+13
Selaginella_moellendorffii_NW_003314282.1:1943352-1943364:-MEP33Selaginella moellendorffiiNW_003314282.119433521943364-13
Selaginella_moellendorffii_NW_003314429.1:27691-27703:-MEP33Selaginella moellendorffiiNW_003314429.12769127703-13
Sesamum_indicum_NC_026159.1:9367435-9367447:+MEP33Sesamum indicumNC_026159.193674359367447+13
Tarenaya_hassleriana_NW_010966177.1:4324872-4324884:+MEP33Tarenaya hasslerianaNW_010966177.143248724324884+13
Theobroma_cacao_NC_030850.1:5091541-5091553:+MEP33Theobroma cacaoNC_030850.150915415091553+13