Cluster ID: MEP23

Size 10
Phase 0
Pfam domain ID AAA
Exon block sizes in the Microexon-tag 48,10,50
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq TCVTTTGARYAYCTKCARGGMGATTAYTACATYGCTCCTSYYTTCMTGGATAAAGTTGYRKKYCACATTGTGAAGAACTAYMTTGCTMATCTTCTYAATRYYAAARTT
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP23 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_1:27496139-27496148:-MEP23A. thaliana12749613927496148-10
Gm_13:45694506-45694515:-MEP23G. max134569450645694515-10
Ha_8:143271514-143271523:-MEP23H. annuus8143271514143271523-10
Os_4:33578824-33578833:-MEP23O. sativa43357882433578833-10
Pp_4:14906193-14906202:-MEP23P. patens41490619314906202-10
Ps_NC_039360.1:211795735-211795744:-MEP23P. somniferumNC_039360.1211795735211795744-10
Ps_NC_039364.1:194516584-194516593:-MEP23P. somniferumNC_039364.1194516584194516593-10
Sm_GL377574:1819876-1819885:-MEP23S. moellendorffiiGL37757418198761819885-10
Vv_9:18216248-18216257:-MEP23V. vinifera91821624818216257-10
Zm_2:4121137-4121146:+MEP23Z. mays241211374121146+10
Bn_scaffoldA07:29510525-29510534:-MEP23B. napusscaffoldA072951052529510534-10
Bn_scaffoldC06:48744876-48744885:-MEP23B. napusscaffoldC064874487648744885-10
Hv_2H:629176245-629176254:+MEP23H. vulgare2H629176245629176254+10
Pt_1:2707639-2707648:+MEP23P. trichocarpa127076392707648+10
Sb_6:58806494-58806503:-MEP23S. bicolor65880649458806503-10
Sl_3:68361090-68361099:-MEP23S. lycopersicum36836109068361099-10
Ta_2A:729670203-729670212:+MEP23T. aestivum2A729670203729670212+10
Ta_2B:724398470-724398479:+MEP23T. aestivum2B724398470724398479+10
Ta_2D:596001694-596001703:+MEP23T. aestivum2D596001694596001703+10
Nicotiana_tabacum_NW_015890884.1:72821-72830:-MEP23Nicotiana tabacumNW_015890884.17282172830-10
Nicotiana_tabacum_NW_015921077.1:109119-109128:-MEP23Nicotiana tabacumNW_015921077.1109119109128-10
Triticum_dicoccoides_NC_041382.1:733234452-733234461:+MEP23Triticum dicoccoidesNC_041382.1733234452733234461+10
Triticum_dicoccoides_NC_041383.1:739522344-739522353:+MEP23Triticum dicoccoidesNC_041383.1739522344739522353+10
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017948151.1:22949-22958:+MEP23Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017948151.12294922958+10
Nicotiana_sylvestris_NW_009553386.1:1577-1586:+MEP23Nicotiana sylvestrisNW_009553386.115771586+10
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008890357.1:116088-116097:-MEP23Nicotiana tomentosiformisNW_008890357.1116088116097-10
Camellia_sinensis_NW_021026203.1:201777-201786:+MEP23Camellia sinensisNW_021026203.1201777201786+10
Nicotiana_attenuata_NC_031991.1:19706168-19706177:-MEP23Nicotiana attenuataNC_031991.11970616819706177-10
Capsicum_annuum_NC_029979.1:8029519-8029528:-MEP23Capsicum annuumNC_029979.180295198029528-10
Colocasia_esculenta_CM024766.1:4759127-4759136:+MEP23Colocasia esculentaCM024766.147591274759136+10
Helianthus_annuus_NC_035440.2:115533147-115533156:-MEP23Helianthus annuusNC_035440.2115533147115533156-10
Lactuca_sativa_NW_019676790.1:352823-352832:+MEP23Lactuca sativaNW_019676790.1352823352832+10
Papaver_somniferum_NC_039360.1:211795735-211795744:-MEP23Papaver somniferumNC_039360.1211795735211795744-10
Papaver_somniferum_NC_039364.1:194516584-194516593:-MEP23Papaver somniferumNC_039364.1194516584194516593-10
Arachis_hypogaea_NC_037618.1:3472738-3472747:+MEP23Arachis hypogaeaNC_037618.134727383472747+10
Arachis_hypogaea_NC_037628.1:9444044-9444053:-MEP23Arachis hypogaeaNC_037628.194440449444053-10
Elaeis_guineensis_NC_026000.1:38208318-38208327:+MEP23Elaeis guineensisNC_026000.13820831838208327+10
Gossypium_hirsutum_NC_030083.1:44733668-44733677:-MEP23Gossypium hirsutumNC_030083.14473366844733677-10
Gossypium_hirsutum_NC_030092.1:57355294-57355303:-MEP23Gossypium hirsutumNC_030092.15735529457355303-10
Hevea_brasiliensis_NW_018745690.1:4152927-4152936:-MEP23Hevea brasiliensisNW_018745690.141529274152936-10
Olea_europaea_var._sylvestris_NW_019249964.1:295341-295350:-MEP23Olea europaea var.  sylvestrisNW_019249964.1295341295350-10
Persea_americana_SDSS01000284.1:55649-55658:+MEP23Persea americanaSDSS01000284.15564955658+10
Zea_mays_NC_050097.1:4383764-4383773:+MEP23Zea maysNC_050097.143837644383773+10
Chenopodium_quinoa_NW_018744202.1:223636-223645:-MEP23Chenopodium quinoaNW_018744202.1223636223645-10
Chenopodium_quinoa_NW_018744367.1:3230887-3230896:-MEP23Chenopodium quinoaNW_018744367.132308873230896-10
Gossypium_arboreum_NC_030673.1:15330246-15330255:-MEP23Gossypium arboreumNC_030673.11533024615330255-10
Hibiscus_syriacus_NW_024063488.1:4953513-4953522:+MEP23Hibiscus syriacusNW_024063488.149535134953522+10
Prosopis_alba_NW_021634581.1:49314-49323:-MEP23Prosopis albaNW_021634581.14931449323-10
Prosopis_alba_NW_021637057.1:32282-32291:-MEP23Prosopis albaNW_021637057.13228232291-10
Quercus_suber_NW_019823336.1:642060-642069:-MEP23Quercus suberNW_019823336.1642060642069-10
Arachis_duranensis_NC_029772.2:3279617-3279626:+MEP23Arachis duranensisNC_029772.232796173279626+10
Arachis_ipaensis_NC_029785.2:8926513-8926522:-MEP23Arachis ipaensisNC_029785.289265138926522-10
Asparagus_officinalis_NC_033798.1:102979936-102979945:-MEP23Asparagus officinalisNC_033798.1102979936102979945-10
Brassica_napus_NC_027763.2:24011364-24011373:-MEP23Brassica napusNC_027763.22401136424011373-10
Brassica_napus_NC_027772.2:41462411-41462420:-MEP23Brassica napusNC_027772.24146241141462420-10
Coffea_arabica_NC_039904.1:2656692-2656701:-MEP23Coffea arabicaNC_039904.126566922656701-10
Coffea_arabica_NC_039905.1:4679731-4679740:-MEP23Coffea arabicaNC_039905.146797314679740-10
Coffea_eugenioides_NC_040038.1:4215961-4215970:-MEP23Coffea eugenioidesNC_040038.142159614215970-10
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037533.1:18030686-18030695:-MEP23Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037533.11803068618030695-10
Glycine_soja_NC_041012.1:53387188-53387197:-MEP23Glycine sojaNC_041012.15338718853387197-10
Spinacia_oleracea_NW_018932128.1:57710-57719:-MEP23Spinacia oleraceaNW_018932128.15771057719-10
Actinidia_rufa_BJWL01000023.1:3049911-3049920:-MEP23Actinidia rufaBJWL01000023.130499113049920-10
Amborella_trichopoda_NW_006498608.1:5568019-5568028:+MEP23Amborella trichopodaNW_006498608.155680195568028+10
Benincasa_hispida_NC_052357.1:11844085-11844094:-MEP23Benincasa hispidaNC_052357.11184408511844094-10
Cajanus_cajan_NW_017984104.1:312946-312955:+MEP23Cajanus cajanNW_017984104.1312946312955+10
Cannabis_sativa_NC_044379.1:4660413-4660422:-MEP23Cannabis sativaNC_044379.146604134660422-10
Cicer_arietinum_NC_021160.1:8717482-8717491:+MEP23Cicer arietinumNC_021160.187174828717491+10
Coffea_canephora_HG974431.1:4092825-4092834:-MEP23Coffea canephoraHG974431.140928254092834-10
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052473.1:18289976-18289985:+MEP23Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052473.11828997618289985+10
Durio_zibethinus_NW_019168015.1:12163727-12163736:+MEP23Durio zibethinusNW_019168015.11216372712163736+10
Eucalyptus_grandis_NC_052621.1:37976738-37976747:-MEP23Eucalyptus grandisNC_052621.13797673837976747-10
Glycine_max_NC_038249.1:45694506-45694515:-MEP23Glycine maxNC_038249.14569450645694515-10
Gossypium_raimondii_NC_026937.1:11331087-11331096:+MEP23Gossypium raimondiiNC_026937.11133108711331096+10
Ipomoea_nil_NW_017619403.1:2680824-2680833:-MEP23Ipomoea nilNW_017619403.126808242680833-10
Lupinus_angustifolius_NC_032014.1:29519377-29519386:+MEP23Lupinus angustifoliusNC_032014.12951937729519386+10
Phoenix_dactylifera_NC_052398.1:169262-169271:+MEP23Phoenix dactyliferaNC_052398.1169262169271+10
Piper_nigrum_Pn4:10538092-10538101:-MEP23Piper nigrumPn41053809210538101-10
Pistacia_vera_NW_022196618.1:147547-147556:-MEP23Pistacia veraNW_022196618.1147547147556-10
Populus_euphratica_NW_011499900.1:921742-921751:-MEP23Populus euphraticaNW_011499900.1921742921751-10
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988160.1:237216-237225:-MEP23Pyrus x bretschneideriNW_008988160.1237216237225-10
Quercus_lobata_NW_022154763.1:74917-74926:+MEP23Quercus lobataNW_022154763.17491774926+10
Solanum_lycopersicum_NC_015440.3:68361090-68361099:-MEP23Solanum lycopersicumNC_015440.36836109068361099-10
Solanum_pennellii_NC_028639.1:71383415-71383424:-MEP23Solanum pennelliiNC_028639.17138341571383424-10
Solanum_tuberosum_NW_006238952.1:829685-829694:-MEP23Solanum tuberosumNW_006238952.1829685829694-10
Syzygium_oleosum_NW_022076713.1:221364-221373:+MEP23Syzygium oleosumNW_022076713.1221364221373+10
Abrus_precatorius_NW_020874303.1:30324425-30324434:-MEP23Abrus precatoriusNW_020874303.13032442530324434-10
Ananas_comosus_NC_033622.1:9803899-9803908:-MEP23Ananas comosusNC_033622.198038999803908-10
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025819.2:22174001-22174010:-MEP23Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025819.22217400122174010-10
Brassica_oleracea_var._oleracea_NC_027753.1:36413075-36413084:-MEP23Brassica oleracea var.  oleraceaNC_027753.13641307536413084-10
Brassica_rapa_NC_024801.2:25936231-25936240:-MEP23Brassica rapaNC_024801.22593623125936240-10
Camelina_sativa_NC_025691.1:22473047-22473056:-MEP23Camelina sativaNC_025691.12247304722473056-10
Camelina_sativa_NC_025693.1:29160491-29160500:-MEP23Camelina sativaNC_025693.12916049129160500-10
Camelina_sativa_NC_025700.1:18822865-18822874:-MEP23Camelina sativaNC_025700.11882286518822874-10
Ceratophyllum_demersum_3:6949600-6949609:+MEP23Ceratophyllum demersum369496006949609+10
Citrus_sinensis_NW_006257107.1:228719-228728:+MEP23Citrus sinensisNW_006257107.1228719228728+10
Cucumis_melo_NW_007546327.1:841488-841497:-MEP23Cucumis meloNW_007546327.1841488841497-10
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030387.1:29048841-29048850:-MEP23Daucus carota subsp.  sativusNC_030387.12904884129048850-10
Erythranthe_guttata_NW_012194881.1:3195492-3195501:+MEP23Erythranthe guttataNW_012194881.131954923195501+10
Ipomoea_triloba_NC_044926.1:8209749-8209758:+MEP23Ipomoea trilobaNC_044926.182097498209758+10
Jatropha_curcas_NW_023590704.1:165125-165134:+MEP23Jatropha curcasNW_023590704.1165125165134+10
Macleaya_cordata_MVGT01004285.1:578131-578140:+MEP23Macleaya cordataMVGT01004285.1578131578140+10
Malus_domestica_NC_041797.1:28622466-28622475:-MEP23Malus domesticaNC_041797.12862246628622475-10
Manihot_esculenta_NC_035171.1:8136500-8136509:-MEP23Manihot esculentaNC_035171.181365008136509-10
Medicago_truncatula_NC_053043.1:51738735-51738744:-MEP23Medicago truncatulaNC_053043.15173873551738744-10
Morus_notabilis_NW_010365947.1:143712-143721:-MEP23Morus notabilisNW_010365947.1143712143721-10
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025211.1:33068561-33068570:+MEP23Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025211.13306856133068570+10
Panicum_hallii_NC_038048.1:46219644-46219653:-MEP23Panicum halliiNC_038048.14621964446219653-10
Phaseolus_vulgaris_NC_023755.1:40476148-40476157:-MEP23Phaseolus vulgarisNC_023755.14047614840476157-10
Physcomitrella_patens_NC_037256.1:14906193-14906202:-MEP23Physcomitrella patensNC_037256.11490619314906202-10
Populus_alba_NW_023271544.1:531198-531207:+MEP23Populus albaNW_023271544.1531198531207+10
Populus_trichocarpa_NC_037285.1:2636614-2636623:+MEP23Populus trichocarpaNC_037285.126366142636623+10
Prunus_avium_NW_018922314.1:15341-15350:+MEP23Prunus aviumNW_018922314.11534115350+10
Raphanus_sativus_NW_017353147.1:5414888-5414897:-MEP23Raphanus sativusNW_017353147.154148885414897-10
Rhodamnia_argentea_NW_022060994.1:127161-127170:-MEP23Rhodamnia argenteaNW_022060994.1127161127170-10
Rhododendron_simsii_CM024964.1:26832801-26832810:+MEP23Rhododendron simsiiCM024964.12683280126832810+10
Ricinus_communis_NW_002994282.1:394600-394609:-MEP23Ricinus communisNW_002994282.1394600394609-10
Rosa_chinensis_NC_037089.1:47824114-47824123:+MEP23Rosa chinensisNC_037089.14782411447824123+10
Setaria_italica_NC_028452.1:1423855-1423864:-MEP23Setaria italicaNC_028452.114238551423864-10
Setaria_viridis_NC_048265.1:1560497-1560506:-MEP23Setaria viridisNC_048265.115604971560506-10
Sorghum_bicolor_NC_012875.2:58806494-58806503:-MEP23Sorghum bicolorNC_012875.25880649458806503-10
Tripterygium_wilfordii_NC_052253.1:13858985-13858994:-MEP23Tripterygium wilfordiiNC_052253.11385898513858994-10
Vigna_angularis_NC_030641.1:30470354-30470363:-MEP23Vigna angularisNC_030641.13047035430470363-10
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028355.1:24968754-24968763:+MEP23Vigna radiata var.  radiataNC_028355.12496875424968763+10
Vigna_unguiculata_NC_040283.1:48503029-48503038:-MEP23Vigna unguiculataNC_040283.14850302948503038-10
Vitis_riparia_NW_023269807.1:55788-55797:+MEP23Vitis ripariaNW_023269807.15578855797+10
Vitis_riparia_NC_048439.1:18640468-18640477:-MEP23Vitis ripariaNC_048439.11864046818640477-10
Vitis_vinifera_NC_012015.3:18216248-18216257:-MEP23Vitis viniferaNC_012015.31821624818216257-10
Ziziphus_jujuba_NC_029688.1:19735251-19735260:-MEP23Ziziphus jujubaNC_029688.11973525119735260-10
Aquilegia_coerulea_KZ305041.1:3299201-3299210:-MEP23Aquilegia coeruleaKZ305041.132992013299210-10
Arabidopsis_lyrata_subsp._lyrata_NW_003302554.1:15701454-15701463:-MEP23Arabidopsis lyrata subsp.  lyrataNW_003302554.11570145415701463-10
Arabidopsis_thaliana_NC_003070.9:27496139-27496148:-MEP23Arabidopsis thalianaNC_003070.92749613927496148-10
Brachypodium_distachyon_NC_016135.3:26359690-26359699:+MEP23Brachypodium distachyonNC_016135.32635969026359699+10
Capsella_rubella_NW_006238922.1:11033051-11033060:-MEP23Capsella rubellaNW_006238922.11103305111033060-10
Citrus_clementina_NW_006262075.1:15369870-15369879:-MEP23Citrus clementinaNW_006262075.11536987015369879-10
Cucumis_sativus_NC_026661.2:20050960-20050969:+MEP23Cucumis sativusNC_026661.22005096020050969+10
Cucurbita_maxima_NW_019272040.1:440185-440194:-MEP23Cucurbita maximaNW_019272040.1440185440194-10
Cucurbita_moschata_NW_019268540.1:3481257-3481266:+MEP23Cucurbita moschataNW_019268540.134812573481266+10
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036654.1:5254348-5254357:-MEP23Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036654.152543485254357-10
Eutrema_salsugineum_NW_006256342.1:3282407-3282416:+MEP23Eutrema salsugineumNW_006256342.132824073282416+10
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020496.1:16257663-16257672:+MEP23Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020496.11625766316257672+10
Herrania_umbratica_NW_018397267.1:4753917-4753926:-MEP23Herrania umbraticaNW_018397267.147539174753926-10
Momordica_charantia_NW_019104489.1:2707663-2707672:+MEP23Momordica charantiaNW_019104489.127076632707672+10
Oryza_brachyantha_NC_023166.1:19785393-19785402:-MEP23Oryza brachyanthaNC_023166.11978539319785402-10
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029259.1:33578824-33578833:-MEP23Oryza sativa Japonica GroupNC_029259.13357882433578833-10
Prunus_dulcis_NC_047652.1:8099397-8099406:-MEP23Prunus dulcisNC_047652.180993978099406-10
Prunus_mume_NC_024129.1:7562429-7562438:-MEP23Prunus mumeNC_024129.175624297562438-10
Prunus_persica_NC_034011.1:8504589-8504598:-MEP23Prunus persicaNC_034011.185045898504598-10
Punica_granatum_NC_045127.1:384505-384514:+MEP23Punica granatumNC_045127.1384505384514+10
Sesamum_indicum_NC_026147.1:13371080-13371089:-MEP23Sesamum indicumNC_026147.11337108013371089-10
Tarenaya_hassleriana_NW_010965373.1:2509067-2509076:+MEP23Tarenaya hasslerianaNW_010965373.125090672509076+10
Theobroma_cacao_NC_030855.1:20786387-20786396:+MEP23Theobroma cacaoNC_030855.12078638720786396+10