Cluster ID: MEP09

Size 5
Phase 2
Pfam domain ID SKG6
Exon block sizes in the Microexon-tag 19,34,5,50
Microexon location in the Microexon-tag 3
Microexon-tag DNA Seq GTDTWYATTCCDGSMMRAGATSAAAATGGAARYTATCSRCCCYTRMMAWCMAGCWCAGGAWTATCARGTGGAGYYATWGSTGGMATAKYTRTAGSAGYAGTAGYWGKR
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP09 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
Gm_15:8717837-8717841:-MEP09G. max1587178378717841-5
Ha_3:92364250-92364254:-MEP09H. annuus39236425092364254-5
Ps_NC_039358.1:145506860-145506864:-MEP09P. somniferumNC_039358.1145506860145506864-5
Ps_NC_039359.1:100599479-100599483:-MEP09P. somniferumNC_039359.1100599479100599483-5
Ps_NC_039367.1:54301721-54301725:-MEP09P. somniferumNC_039367.15430172154301725-5
Vv_10:418597-418601:+MEP09V. vinifera10418597418601+5
Vv_12:6053035-6053039:-MEP09V. vinifera1260530356053039-5
Pt_14:11040677-11040681:-MEP09P. trichocarpa141104067711040681-5
Pt_2:21540039-21540043:+MEP09P. trichocarpa22154003921540043+5
Nicotiana_tabacum_NW_015804919.1:41484-41488:+MEP09Nicotiana tabacumNW_015804919.14148441488+5
Nicotiana_tabacum_NW_015909062.1:9227-9231:+MEP09Nicotiana tabacumNW_015909062.192279231+5
Nicotiana_tabacum_NW_015911676.1:30651-30655:+MEP09Nicotiana tabacumNW_015911676.13065130655+5
Nicotiana_sylvestris_NW_009517031.1:4136-4140:-MEP09Nicotiana sylvestrisNW_009517031.141364140-5
Nicotiana_sylvestris_NW_009570679.1:14801-14805:-MEP09Nicotiana sylvestrisNW_009570679.11480114805-5
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008913717.1:978-982:-MEP09Nicotiana tomentosiformisNW_008913717.1978982-5
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008916439.1:33027-33031:-MEP09Nicotiana tomentosiformisNW_008916439.13302733031-5
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008965897.1:44628-44632:-MEP09Nicotiana tomentosiformisNW_008965897.14462844632-5
Camellia_sinensis_NW_021024559.1:743381-743385:+MEP09Camellia sinensisNW_021024559.1743381743385+5
Camellia_sinensis_NW_021026319.1:747679-747683:+MEP09Camellia sinensisNW_021026319.1747679747683+5
Nicotiana_attenuata_NC_031990.1:21121707-21121711:+MEP09Nicotiana attenuataNC_031990.12112170721121711+5
Nicotiana_attenuata_NC_031999.1:12030364-12030368:+MEP09Nicotiana attenuataNC_031999.11203036412030368+5
Helianthus_annuus_NC_035435.2:103034936-103034940:+MEP09Helianthus annuusNC_035435.2103034936103034940+5
Lactuca_sativa_NW_019678096.1:656545-656549:+MEP09Lactuca sativaNW_019678096.1656545656549+5
Lactuca_sativa_NW_019674435.1:1413326-1413330:-MEP09Lactuca sativaNW_019674435.114133261413330-5
Papaver_somniferum_NC_039358.1:145506860-145506864:-MEP09Papaver somniferumNC_039358.1145506860145506864-5
Papaver_somniferum_NC_039359.1:100599479-100599483:-MEP09Papaver somniferumNC_039359.1100599479100599483-5
Papaver_somniferum_NC_039367.1:54301721-54301725:-MEP09Papaver somniferumNC_039367.15430172154301725-5
Arachis_hypogaea_NC_037634.1:7878555-7878559:+MEP09Arachis hypogaeaNC_037634.178785557878559+5
Arachis_hypogaea_NC_037634.1:7513429-7513433:-MEP09Arachis hypogaeaNC_037634.175134297513433-5
Arachis_hypogaea_NC_037634.1:7535218-7535222:-MEP09Arachis hypogaeaNC_037634.175352187535222-5
Arachis_hypogaea_NC_037634.1:7569028-7569032:-MEP09Arachis hypogaeaNC_037634.175690287569032-5
Arachis_hypogaea_NC_037621.1:5207846-5207850:-MEP09Arachis hypogaeaNC_037621.152078465207850-5
Arachis_hypogaea_NC_037624.1:5789064-5789068:-MEP09Arachis hypogaeaNC_037624.157890645789068-5
Arachis_hypogaea_NC_037631.1:6511451-6511455:-MEP09Arachis hypogaeaNC_037631.165114516511455-5
Gossypium_hirsutum_NC_030094.1:13820959-13820963:+MEP09Gossypium hirsutumNC_030094.11382095913820963+5
Hevea_brasiliensis_NW_018745710.1:3573049-3573053:+MEP09Hevea brasiliensisNW_018745710.135730493573053+5
Hevea_brasiliensis_NW_018747242.1:28478-28482:-MEP09Hevea brasiliensisNW_018747242.12847828482-5
Liriodendron_chinense_ML058363.1:3214742-3214746:-MEP09Liriodendron chinenseML058363.132147423214746-5
Olea_europaea_var._sylvestris_NW_019257731.1:26639-26643:+MEP09Olea europaea var.  sylvestrisNW_019257731.12663926643+5
Chenopodium_quinoa_NW_018743204.1:856470-856474:+MEP09Chenopodium quinoaNW_018743204.1856470856474+5
Chenopodium_quinoa_NW_018743283.1:560249-560253:-MEP09Chenopodium quinoaNW_018743283.1560249560253-5
Gossypium_arboreum_NC_030667.1:22126620-22126624:+MEP09Gossypium arboreumNC_030667.12212662022126624+5
Gossypium_arboreum_NC_030664.1:129406346-129406350:-MEP09Gossypium arboreumNC_030664.1129406346129406350-5
Hibiscus_syriacus_NW_024063187.1:640991-640995:+MEP09Hibiscus syriacusNW_024063187.1640991640995+5
Hibiscus_syriacus_NW_024063081.1:2200165-2200169:-MEP09Hibiscus syriacusNW_024063081.122001652200169-5
Prosopis_alba_NW_021634213.1:5068-5072:-MEP09Prosopis albaNW_021634213.150685072-5
Prosopis_alba_NW_021636190.1:293852-293856:-MEP09Prosopis albaNW_021636190.1293852293856-5
Prosopis_alba_NW_021636598.1:144209-144213:-MEP09Prosopis albaNW_021636598.1144209144213-5
Arachis_duranensis_NC_029775.2:4955663-4955667:-MEP09Arachis duranensisNC_029775.249556634955667-5
Arachis_duranensis_NC_029778.2:6756145-6756149:-MEP09Arachis duranensisNC_029778.267561456756149-5
Arachis_duranensis_NC_029778.2:6779528-6779532:-MEP09Arachis duranensisNC_029778.267795286779532-5
Arachis_ipaensis_NC_029791.2:6684489-6684493:+MEP09Arachis ipaensisNC_029791.266844896684493+5
Arachis_ipaensis_NC_029791.2:6332757-6332761:-MEP09Arachis ipaensisNC_029791.263327576332761-5
Arachis_ipaensis_NC_029791.2:6355733-6355737:-MEP09Arachis ipaensisNC_029791.263557336355737-5
Arachis_ipaensis_NC_029791.2:6389371-6389375:-MEP09Arachis ipaensisNC_029791.263893716389375-5
Arachis_ipaensis_NC_029788.2:6301552-6301556:-MEP09Arachis ipaensisNC_029788.263015526301556-5
Coffea_arabica_NC_039906.1:25045230-25045234:+MEP09Coffea arabicaNC_039906.12504523025045234+5
Coffea_arabica_NC_039907.1:32230654-32230658:+MEP09Coffea arabicaNC_039907.13223065432230658+5
Coffea_eugenioides_NC_040039.1:35141470-35141474:+MEP09Coffea eugenioidesNC_040039.13514147035141474+5
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037544.1:3942182-3942186:+MEP09Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037544.139421823942186+5
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037544.1:3962833-3962837:+MEP09Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037544.139628333962837+5
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037544.1:3978554-3978558:+MEP09Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037544.139785543978558+5
Glycine_soja_NC_041016.1:8689718-8689722:-MEP09Glycine sojaNC_041016.186897188689722-5
Actinidia_rufa_BJWL01000012.1:1367301-1367305:+MEP09Actinidia rufaBJWL01000012.113673011367305+5
Actinidia_rufa_BJWL01000013.1:5818872-5818876:+MEP09Actinidia rufaBJWL01000013.158188725818876+5
Actinidia_rufa_BJWL01000220.1:163497-163501:-MEP09Actinidia rufaBJWL01000220.1163497163501-5
Actinidia_rufa_BJWL01000307.1:181367-181371:-MEP09Actinidia rufaBJWL01000307.1181367181371-5
Benincasa_hispida_NC_052353.1:47487269-47487273:-MEP09Benincasa hispidaNC_052353.14748726947487273-5
Cannabis_sativa_NC_044371.1:96861469-96861473:+MEP09Cannabis sativaNC_044371.19686146996861473+5
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000002.1:66725974-66725978:-MEP09Cinnamomum micranthumQPKB01000002.16672597466725978-5
Coffea_canephora_HG974432.1:14625327-14625331:+MEP09Coffea canephoraHG974432.11462532714625331+5
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052489.1:23746391-23746395:-MEP09Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052489.12374639123746395-5
Durio_zibethinus_NW_019167938.1:9371814-9371818:+MEP09Durio zibethinusNW_019167938.193718149371818+5
Eucalyptus_grandis_NC_052612.1:35069601-35069605:+MEP09Eucalyptus grandisNC_052612.13506960135069605+5
Eucalyptus_grandis_NC_052612.1:35079701-35079705:+MEP09Eucalyptus grandisNC_052612.13507970135079705+5
Eucalyptus_grandis_NC_052612.1:35090448-35090452:+MEP09Eucalyptus grandisNC_052612.13509044835090452+5
Eucalyptus_grandis_NC_052612.1:35103189-35103193:+MEP09Eucalyptus grandisNC_052612.13510318935103193+5
Glycine_max_NC_038251.1:8717837-8717841:-MEP09Glycine maxNC_038251.187178378717841-5
Gossypium_raimondii_NC_026929.1:10705985-10705989:+MEP09Gossypium raimondiiNC_026929.11070598510705989+5
Gossypium_raimondii_NC_026935.1:15555062-15555066:+MEP09Gossypium raimondiiNC_026935.11555506215555066+5
Nelumbo_nucifera_NW_010729084.1:858900-858904:-MEP09Nelumbo nuciferaNW_010729084.1858900858904-5
Nelumbo_nucifera_NW_010729269.1:309831-309835:-MEP09Nelumbo nuciferaNW_010729269.1309831309835-5
Pistacia_vera_NW_022196712.1:54935-54939:+MEP09Pistacia veraNW_022196712.15493554939+5
Populus_euphratica_NW_011500015.1:273002-273006:+MEP09Populus euphraticaNW_011500015.1273002273006+5
Populus_euphratica_NW_011500269.1:213724-213728:-MEP09Populus euphraticaNW_011500269.1213724213728-5
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988352.1:394479-394483:+MEP09Pyrus x bretschneideriNW_008988352.1394479394483+5
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988159.1:32418-32422:-MEP09Pyrus x bretschneideriNW_008988159.13241832422-5
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988159.1:62732-62736:-MEP09Pyrus x bretschneideriNW_008988159.16273262736-5
Syzygium_oleosum_NW_022076625.1:203597-203601:-MEP09Syzygium oleosumNW_022076625.1203597203601-5
Abrus_precatorius_NW_020874292.1:27695605-27695609:-MEP09Abrus precatoriusNW_020874292.12769560527695609-5
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025816.2:20068255-20068259:+MEP09Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025816.22006825520068259+5
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025816.2:20129060-20129064:+MEP09Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025816.22012906020129064+5
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025818.2:1625598-1625602:+MEP09Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025818.216255981625602+5
Carica_papaya_NW_019014560.1:5983-5987:-MEP09Carica papayaNW_019014560.159835987-5
Citrus_sinensis_NC_023047.1:1092678-1092682:+MEP09Citrus sinensisNC_023047.110926781092682+5
Cucumis_melo_NW_007546301.1:3214354-3214358:-MEP09Cucumis meloNW_007546301.132143543214358-5
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030386.1:25509513-25509517:-MEP09Daucus carota subsp.  sativusNC_030386.12550951325509517-5
Erythranthe_guttata_NW_012192922.1:990502-990506:-MEP09Erythranthe guttataNW_012192922.1990502990506-5
Ipomoea_triloba_NC_044917.1:3941739-3941743:+MEP09Ipomoea trilobaNC_044917.139417393941743+5
Jatropha_curcas_NW_023591667.1:44634-44638:+MEP09Jatropha curcasNW_023591667.14463444638+5
Macleaya_cordata_MVGT01003688.1:490237-490241:-MEP09Macleaya cordataMVGT01003688.1490237490241-5
Malus_domestica_NC_041797.1:8509118-8509122:-MEP09Malus domesticaNC_041797.185091188509122-5
Malus_domestica_NC_041805.1:8759954-8759958:-MEP09Malus domesticaNC_041805.187599548759958-5
Manihot_esculenta_NC_035172.1:7174402-7174406:+MEP09Manihot esculentaNC_035172.171744027174406+5
Manihot_esculenta_NC_035173.1:7745890-7745894:-MEP09Manihot esculentaNC_035173.177458907745894-5
Medicago_truncatula_NC_053046.1:38432835-38432839:+MEP09Medicago truncatulaNC_053046.13843283538432839+5
Medicago_truncatula_NC_053046.1:34897558-34897562:-MEP09Medicago truncatulaNC_053046.13489755834897562-5
Medicago_truncatula_NC_053043.1:8768482-8768486:-MEP09Medicago truncatulaNC_053043.187684828768486-5
Morus_notabilis_NW_010361938.1:216467-216471:+MEP09Morus notabilisNW_010361938.1216467216471+5
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025206.1:23677513-23677517:-MEP09Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025206.12367751323677517-5
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025212.1:20989607-20989611:-MEP09Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025212.12098960720989611-5
Phaseolus_vulgaris_NC_023754.1:26016682-26016686:+MEP09Phaseolus vulgarisNC_023754.12601668226016686+5
Populus_alba_NW_023271052.1:2276672-2276676:+MEP09Populus albaNW_023271052.122766722276676+5
Populus_alba_NW_023271961.1:436627-436631:-MEP09Populus albaNW_023271961.1436627436631-5
Populus_trichocarpa_NC_037286.1:21586518-21586522:+MEP09Populus trichocarpaNC_037286.12158651821586522+5
Populus_trichocarpa_NC_037298.1:12198173-12198177:-MEP09Populus trichocarpaNC_037298.11219817312198177-5
Prunus_avium_NW_018921908.1:46103-46107:-MEP09Prunus aviumNW_018921908.14610346107-5
Prunus_avium_NW_018922091.1:299013-299017:-MEP09Prunus aviumNW_018922091.1299013299017-5
Rhodamnia_argentea_NW_022060873.1:963565-963569:+MEP09Rhodamnia argenteaNW_022060873.1963565963569+5
Rhododendron_simsii_CM024956.1:7003832-7003836:+MEP09Rhododendron simsiiCM024956.170038327003836+5
Rhododendron_simsii_CM024956.1:7026621-7026625:+MEP09Rhododendron simsiiCM024956.170266217026625+5
Rhododendron_simsii_CM024956.1:7678812-7678816:+MEP09Rhododendron simsiiCM024956.176788127678816+5
Rhododendron_simsii_CM024956.1:7696719-7696723:+MEP09Rhododendron simsiiCM024956.176967197696723+5
Rhododendron_simsii_CM024956.1:7741812-7741816:+MEP09Rhododendron simsiiCM024956.177418127741816+5
Rhododendron_simsii_CM024957.1:7834995-7834999:+MEP09Rhododendron simsiiCM024957.178349957834999+5
Ricinus_communis_NW_002994464.1:14776-14780:-MEP09Ricinus communisNW_002994464.11477614780-5
Vigna_angularis_NC_030645.1:25538442-25538446:+MEP09Vigna angularisNC_030645.12553844225538446+5
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028360.1:15236498-15236502:-MEP09Vigna radiata var.  radiataNC_028360.11523649815236502-5
Vigna_unguiculata_NC_040284.1:28165282-28165286:+MEP09Vigna unguiculataNC_040284.12816528228165286+5
Vitis_riparia_NC_048440.1:23268366-23268370:-MEP09Vitis ripariaNC_048440.12326836623268370-5
Vitis_vinifera_NC_012016.3:418597-418601:+MEP09Vitis viniferaNC_012016.3418597418601+5
Vitis_vinifera_NC_012018.3:6053035-6053039:-MEP09Vitis viniferaNC_012018.360530356053039-5
Ziziphus_jujuba_NC_029679.1:12477964-12477968:+MEP09Ziziphus jujubaNC_029679.11247796412477968+5
Ziziphus_jujuba_NC_029682.1:22107630-22107634:+MEP09Ziziphus jujubaNC_029682.12210763022107634+5
Ziziphus_jujuba_NW_015454169.1:22522-22526:+MEP09Ziziphus jujubaNW_015454169.12252222526+5
Aquilegia_coerulea_KZ305049.1:702386-702390:+MEP09Aquilegia coeruleaKZ305049.1702386702390+5
Aquilegia_coerulea_KZ305024.1:167078-167082:-MEP09Aquilegia coeruleaKZ305024.1167078167082-5
Aquilegia_coerulea_KZ305029.1:417418-417422:-MEP09Aquilegia coeruleaKZ305029.1417418417422-5
Aquilegia_coerulea_KZ305029.1:450773-450777:-MEP09Aquilegia coeruleaKZ305029.1450773450777-5
Citrus_clementina_NW_006262688.1:35597019-35597023:-MEP09Citrus clementinaNW_006262688.13559701935597023-5
Cucumis_sativus_NC_026661.2:2519436-2519440:+MEP09Cucumis sativusNC_026661.225194362519440+5
Cucurbita_maxima_NW_019272027.1:864395-864399:-MEP09Cucurbita maximaNW_019272027.1864395864399-5
Cucurbita_moschata_NW_019268578.1:238860-238864:+MEP09Cucurbita moschataNW_019268578.1238860238864+5
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036641.1:7078709-7078713:+MEP09Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036641.170787097078713+5
Herrania_umbratica_NW_018397255.1:9410754-9410758:-MEP09Herrania umbraticaNW_018397255.194107549410758-5
Prunus_dulcis_NC_047652.1:18882871-18882875:+MEP09Prunus dulcisNC_047652.11888287118882875+5
Prunus_dulcis_NC_047653.1:788269-788273:+MEP09Prunus dulcisNC_047653.1788269788273+5
Prunus_mume_NC_024128.1:481200-481204:-MEP09Prunus mumeNC_024128.1481200481204-5
Prunus_mume_NC_024129.1:17608874-17608878:-MEP09Prunus mumeNC_024129.11760887417608878-5
Prunus_persica_NC_034011.1:21712032-21712036:+MEP09Prunus persicaNC_034011.12171203221712036+5
Prunus_persica_NC_034012.1:762495-762499:+MEP09Prunus persicaNC_034012.1762495762499+5
Punica_granatum_NC_045130.1:37011718-37011722:-MEP09Punica granatumNC_045130.13701171837011722-5
Sesamum_indicum_NC_026149.1:13504415-13504419:-MEP09Sesamum indicumNC_026149.11350441513504419-5
Theobroma_cacao_NC_030850.1:11768793-11768797:-MEP09Theobroma cacaoNC_030850.11176879311768797-5