Cluster ID: MEP36

Size 14
Phase 1
Pfam domain ID EFP_N
Exon block sizes in the Microexon-tag 15,31,14,48
Microexon location in the Microexon-tag 3
Microexon-tag DNA Seq KTYYGCGGCTCYGATGTGARRCYWGGRAAYGTCATTGAAARAAAAGGAMRBATTTAYSAGGTKRTAAARGCASAACAYWCWMMTCAAGGAAGAGGAGGAGCYAYWATA
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP36 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_4:13315563-13315576:-MEP36A. thaliana41331556313315576-14
Gm_4:15772746-15772759:-MEP36G. max41577274615772759-14
Gm_4:44236327-44236340:-MEP36G. max44423632744236340-14
Gm_4:44252406-44252419:-MEP36G. max44425240644252419-14
Ha_1:123324777-123324790:-MEP36H. annuus1123324777123324790-14
Os_3:33691337-33691350:-MEP36O. sativa33369133733691350-14
Pp_1:21038827-21038840:+MEP36P. patens12103882721038840+14
Ps_NC_039366.1:85657975-85657988:-MEP36P. somniferumNC_039366.18565797585657988-14
Ps_NC_039368.1:39028757-39028770:+MEP36P. somniferumNC_039368.13902875739028770+14
Sm_GL377597:713662-713675:+MEP36S. moellendorffiiGL377597713662713675+14
Sm_GL377610:708189-708202:+MEP36S. moellendorffiiGL377610708189708202+14
Vv_6:634354-634367:+MEP36V. vinifera6634354634367+14
Zm_1:295631961-295631974:-MEP36Z. mays1295631961295631974-14
Bn_scaffoldA05:38821820-38821833:-MEP36B. napusscaffoldA053882182038821833-14
Bn_scaffoldC05:49594488-49594501:-MEP36B. napusscaffoldC054959448849594501-14
Hv_5H:553871791-553871804:-MEP36H. vulgare5H553871791553871804-14
Pt_1:280170-280183:+MEP36P. trichocarpa1280170280183+14
Sb_1:3536960-3536973:+MEP36S. bicolor135369603536973+14
Sl_1:44025380-44025393:+MEP36S. lycopersicum14402538044025393+14
Ta_5A:636417982-636417995:-MEP36T. aestivum5A636417982636417995-14
Ta_5B:639682210-639682223:-MEP36T. aestivum5B639682210639682223-14
Ta_5D:509141128-509141141:-MEP36T. aestivum5D509141128509141141-14
Nicotiana_tabacum_NW_015912200.1:21774-21787:+MEP36Nicotiana tabacumNW_015912200.12177421787+14
Triticum_dicoccoides_NC_041388.1:640732074-640732087:-MEP36Triticum dicoccoidesNC_041388.1640732074640732087-14
Triticum_dicoccoides_NC_041389.1:652310892-652310905:-MEP36Triticum dicoccoidesNC_041389.1652310892652310905-14
Ginkgo_biloba_Chr10:43905459-43905472:-MEP36Ginkgo bilobaChr104390545943905472-14
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017948512.1:160018-160031:-MEP36Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017948512.1160018160031-14
Nicotiana_sylvestris_NW_009532275.1:174374-174387:-MEP36Nicotiana sylvestrisNW_009532275.1174374174387-14
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008834026.1:164696-164709:-MEP36Nicotiana tomentosiformisNW_008834026.1164696164709-14
Camellia_sinensis_NW_021024614.1:299681-299694:-MEP36Camellia sinensisNW_021024614.1299681299694-14
Camellia_sinensis_NW_021031744.1:16517-16530:-MEP36Camellia sinensisNW_021031744.11651716530-14
Nicotiana_attenuata_NW_017670368.1:154760-154773:-MEP36Nicotiana attenuataNW_017670368.1154760154773-14
Capsicum_annuum_NW_015960697.1:153194-153207:+MEP36Capsicum annuumNW_015960697.1153194153207+14
Capsicum_annuum_NC_029977.1:97243518-97243531:-MEP36Capsicum annuumNC_029977.19724351897243531-14
Colocasia_esculenta_CM024766.1:79863549-79863562:+MEP36Colocasia esculentaCM024766.17986354979863562+14
Helianthus_annuus_NC_035433.2:125468137-125468150:-MEP36Helianthus annuusNC_035433.2125468137125468150-14
Lactuca_sativa_NW_019672089.1:607322-607335:+MEP36Lactuca sativaNW_019672089.1607322607335+14
Papaver_somniferum_NC_039368.1:39028757-39028770:+MEP36Papaver somniferumNC_039368.13902875739028770+14
Papaver_somniferum_NC_039366.1:85657975-85657988:-MEP36Papaver somniferumNC_039366.18565797585657988-14
Arachis_hypogaea_NC_037618.1:1907090-1907103:+MEP36Arachis hypogaeaNC_037618.119070901907103+14
Arachis_hypogaea_NC_037628.1:12633452-12633465:-MEP36Arachis hypogaeaNC_037628.11263345212633465-14
Elaeis_guineensis_NC_025993.1:37423768-37423781:-MEP36Elaeis guineensisNC_025993.13742376837423781-14
Gossypium_hirsutum_NC_030083.1:46628387-46628400:+MEP36Gossypium hirsutumNC_030083.14662838746628400+14
Gossypium_hirsutum_NC_030092.1:59976815-59976828:-MEP36Gossypium hirsutumNC_030092.15997681559976828-14
Hevea_brasiliensis_NW_018748852.1:2865-2878:+MEP36Hevea brasiliensisNW_018748852.128652878+14
Liriodendron_chinense_PVNU02001864.1:1228771-1228784:-MEP36Liriodendron chinensePVNU02001864.112287711228784-14
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036248.1:15494963-15494976:+MEP36Olea europaea var.  sylvestrisNC_036248.11549496315494976+14
Persea_americana_SDSS01000125.1:743156-743169:-MEP36Persea americanaSDSS01000125.1743156743169-14
Phalaenopsis_equestris_NW_018164973.1:368376-368389:-MEP36Phalaenopsis equestrisNW_018164973.1368376368389-14
Zea_mays_NC_050096.1:297170935-297170948:-MEP36Zea maysNC_050096.1297170935297170948-14
Chenopodium_quinoa_NW_018743613.1:289358-289371:+MEP36Chenopodium quinoaNW_018743613.1289358289371+14
Chenopodium_quinoa_NW_018744311.1:162136-162149:+MEP36Chenopodium quinoaNW_018744311.1162136162149+14
Gossypium_arboreum_NC_030670.1:116604282-116604295:+MEP36Gossypium arboreumNC_030670.1116604282116604295+14
Hibiscus_syriacus_NW_024062779.1:4877902-4877915:+MEP36Hibiscus syriacusNW_024062779.148779024877915+14
Hibiscus_syriacus_NW_024063532.1:329100-329113:-MEP36Hibiscus syriacusNW_024063532.1329100329113-14
Prosopis_alba_NW_021636455.1:168371-168384:+MEP36Prosopis albaNW_021636455.1168371168384+14
Quercus_suber_NW_019822685.1:33019-33032:+MEP36Quercus suberNW_019822685.13301933032+14
Arachis_duranensis_NC_029772.2:1864070-1864083:+MEP36Arachis duranensisNC_029772.218640701864083+14
Arachis_ipaensis_NC_029785.2:12007000-12007013:-MEP36Arachis ipaensisNC_029785.21200700012007013-14
Asparagus_officinalis_NC_033800.1:147654202-147654215:+MEP36Asparagus officinalisNC_033800.1147654202147654215+14
Brassica_napus_NC_027761.2:27047319-27047332:-MEP36Brassica napusNC_027761.22704731927047332-14
Brassica_napus_NC_027771.2:36839589-36839602:-MEP36Brassica napusNC_027771.23683958936839602-14
Coffea_arabica_NC_039898.1:1035342-1035355:+MEP36Coffea arabicaNC_039898.110353421035355+14
Coffea_arabica_NC_039899.1:634413-634426:+MEP36Coffea arabicaNC_039899.1634413634426+14
Coffea_eugenioides_NC_040035.1:827109-827122:+MEP36Coffea eugenioidesNC_040035.1827109827122+14
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037537.1:22614554-22614567:+MEP36Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037537.12261455422614567+14
Dendrobium_catenatum_NW_021319944.1:346761-346774:+MEP36Dendrobium catenatumNW_021319944.1346761346774+14
Dendrobium_catenatum_NW_021319944.1:363784-363797:+MEP36Dendrobium catenatumNW_021319944.1363784363797+14
Glycine_soja_NC_041005.1:14821968-14821981:-MEP36Glycine sojaNC_041005.11482196814821981-14
Glycine_soja_NC_041005.1:43678877-43678890:-MEP36Glycine sojaNC_041005.14367887743678890-14
Glycine_soja_NC_041005.1:43694813-43694826:-MEP36Glycine sojaNC_041005.14369481343694826-14
Spinacia_oleracea_NW_018931653.1:189828-189841:+MEP36Spinacia oleraceaNW_018931653.1189828189841+14
Actinidia_rufa_BJWL01000028.1:17906702-17906715:-MEP36Actinidia rufaBJWL01000028.11790670217906715-14
Amborella_trichopoda_NW_006500356.1:890988-891001:+MEP36Amborella trichopodaNW_006500356.1890988891001+14
Benincasa_hispida_NC_052350.1:46999617-46999630:+MEP36Benincasa hispidaNC_052350.14699961746999630+14
Cajanus_cajan_NC_033814.1:24793169-24793182:+MEP36Cajanus cajanNC_033814.12479316924793182+14
Cannabis_sativa_NC_044377.1:62086320-62086333:-MEP36Cannabis sativaNC_044377.16208632062086333-14
Cicer_arietinum_NC_021164.1:39997197-39997210:+MEP36Cicer arietinumNC_021164.13999719739997210+14
Cicer_arietinum_NC_021164.1:41864109-41864122:+MEP36Cicer arietinumNC_021164.14186410941864122+14
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000001.1:59623858-59623871:-MEP36Cinnamomum micranthumQPKB01000001.15962385859623871-14
Coffea_canephora_HG974428.1:10744-10757:-MEP36Coffea canephoraHG974428.11074410757-14
Coffea_canephora_HG974428.1:7077852-7077865:-MEP36Coffea canephoraHG974428.170778527077865-14
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NW_024087612.1:83410-83423:-MEP36Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNW_024087612.18341083423-14
Durio_zibethinus_NW_019168015.1:8404882-8404895:+MEP36Durio zibethinusNW_019168015.184048828404895+14
Eucalyptus_grandis_NC_052621.1:22606283-22606296:+MEP36Eucalyptus grandisNC_052621.12260628322606296+14
Glycine_max_NC_016091.3:15772746-15772759:-MEP36Glycine maxNC_016091.31577274615772759-14
Glycine_max_NC_016091.3:44236327-44236340:-MEP36Glycine maxNC_016091.34423632744236340-14
Glycine_max_NC_016091.3:44252406-44252419:-MEP36Glycine maxNC_016091.34425240644252419-14
Gossypium_raimondii_NC_026937.1:8410121-8410134:-MEP36Gossypium raimondiiNC_026937.184101218410134-14
Ipomoea_nil_NW_017619273.1:4539560-4539573:-MEP36Ipomoea nilNW_017619273.145395604539573-14
Lupinus_angustifolius_NC_032022.1:2672544-2672557:+MEP36Lupinus angustifoliusNC_032022.126725442672557+14
Nelumbo_nucifera_NW_010729092.1:5633080-5633093:-MEP36Nelumbo nuciferaNW_010729092.156330805633093-14
Phoenix_dactylifera_NW_024067675.1:527466-527479:+MEP36Phoenix dactyliferaNW_024067675.1527466527479+14
Piper_nigrum_Pn4:447881-447894:+MEP36Piper nigrumPn4447881447894+14
Piper_nigrum_Pn26:10314184-10314197:+MEP36Piper nigrumPn261031418410314197+14
Pistacia_vera_NW_022196791.1:614611-614624:+MEP36Pistacia veraNW_022196791.1614611614624+14
Pistacia_vera_NW_022195160.1:290439-290452:-MEP36Pistacia veraNW_022195160.1290439290452-14
Populus_euphratica_NW_011500028.1:309396-309409:+MEP36Populus euphraticaNW_011500028.1309396309409+14
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988047.1:1401051-1401064:-MEP36Pyrus x bretschneideriNW_008988047.114010511401064-14
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988549.1:28719-28732:-MEP36Pyrus x bretschneideriNW_008988549.12871928732-14
Quercus_lobata_NC_044904.1:9003928-9003941:-MEP36Quercus lobataNC_044904.190039289003941-14
Solanum_lycopersicum_NC_015438.3:44025380-44025393:+MEP36Solanum lycopersicumNC_015438.34402538044025393+14
Solanum_pennellii_NC_028637.1:53793809-53793822:+MEP36Solanum pennelliiNC_028637.15379380953793822+14
Solanum_tuberosum_NW_006238941.1:2404854-2404867:-MEP36Solanum tuberosumNW_006238941.124048542404867-14
Syzygium_oleosum_NW_022076585.1:814606-814619:-MEP36Syzygium oleosumNW_022076585.1814606814619-14
Abrus_precatorius_NW_020874439.1:35572521-35572534:+MEP36Abrus precatoriusNW_020874439.13557252135572534+14
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025815.2:175898-175911:+MEP36Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025815.2175898175911+14
Brassica_oleracea_var._oleracea_NC_027752.1:39107722-39107735:-MEP36Brassica oleracea var.  oleraceaNC_027752.13910772239107735-14
Brassica_rapa_NC_024799.2:22951758-22951771:-MEP36Brassica rapaNC_024799.22295175822951771-14
Camelina_sativa_NC_025694.1:6916404-6916417:+MEP36Camelina sativaNC_025694.169164046916417+14
Camelina_sativa_NC_025695.1:8053588-8053601:+MEP36Camelina sativaNC_025695.180535888053601+14
Camelina_sativa_NC_025696.1:7785703-7785716:+MEP36Camelina sativaNC_025696.177857037785716+14
Ceratophyllum_demersum_1:128423412-128423425:+MEP36Ceratophyllum demersum1128423412128423425+14
Citrus_sinensis_NC_023054.1:1482550-1482563:-MEP36Citrus sinensisNC_023054.114825501482563-14
Cucumis_melo_NW_007546292.1:3071141-3071154:-MEP36Cucumis meloNW_007546292.130711413071154-14
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030387.1:26489959-26489972:+MEP36Daucus carota subsp.  sativusNC_030387.12648995926489972+14
Erythranthe_guttata_NW_012193112.1:573285-573298:-MEP36Erythranthe guttataNW_012193112.1573285573298-14
Euryale_ferox_8:3769619-3769632:+MEP36Euryale ferox837696193769632+14
Ipomoea_triloba_NC_044929.1:6819427-6819440:+MEP36Ipomoea trilobaNC_044929.168194276819440+14
Jatropha_curcas_NW_023590593.1:262284-262297:+MEP36Jatropha curcasNW_023590593.1262284262297+14
Juglans_regia_NC_049914.1:28230948-28230961:-MEP36Juglans regiaNC_049914.12823094828230961-14
Juglans_regia_NC_049914.1:28287195-28287208:-MEP36Juglans regiaNC_049914.12828719528287208-14
Macleaya_cordata_MVGT01004415.1:26476-26489:-MEP36Macleaya cordataMVGT01004415.12647626489-14
Malus_domestica_NC_041791.1:333923-333936:+MEP36Malus domesticaNC_041791.1333923333936+14
Malus_domestica_NC_041799.1:323549-323562:+MEP36Malus domesticaNC_041799.1323549323562+14
Manihot_esculenta_NC_035165.1:27621364-27621377:+MEP36Manihot esculentaNC_035165.12762136427621377+14
Medicago_truncatula_NC_053044.1:38907514-38907527:+MEP36Medicago truncatulaNC_053044.13890751438907527+14
Medicago_truncatula_NC_053044.1:41145980-41145993:+MEP36Medicago truncatulaNC_053044.14114598041145993+14
Morus_notabilis_NW_010362182.1:9668-9681:+MEP36Morus notabilisNW_010362182.196689681+14
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025208.1:5656804-5656817:+MEP36Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025208.156568045656817+14
Nymphaea_colorata_NC_045138.1:10609908-10609921:+MEP36Nymphaea colorataNC_045138.11060990810609921+14
Panicum_hallii_NC_038050.1:2409428-2409441:+MEP36Panicum halliiNC_038050.124094282409441+14
Phaseolus_vulgaris_NC_023759.1:52185362-52185375:-MEP36Phaseolus vulgarisNC_023759.15218536252185375-14
Physcomitrella_patens_NC_037253.1:21038827-21038840:+MEP36Physcomitrella patensNC_037253.12103882721038840+14
Populus_alba_NW_023271989.1:79721-79734:-MEP36Populus albaNW_023271989.17972179734-14
Populus_trichocarpa_NC_037285.1:276142-276155:+MEP36Populus trichocarpaNC_037285.1276142276155+14
Prunus_avium_NW_018921781.1:121112-121125:-MEP36Prunus aviumNW_018921781.1121112121125-14
Raphanus_sativus_NW_017353143.1:7396776-7396789:+MEP36Raphanus sativusNW_017353143.173967767396789+14
Rhodamnia_argentea_NW_022060809.1:2181083-2181096:-MEP36Rhodamnia argenteaNW_022060809.121810832181096-14
Rhododendron_simsii_CM024965.1:30339871-30339884:-MEP36Rhododendron simsiiCM024965.13033987130339884-14
Rosa_chinensis_NC_037092.1:89424078-89424091:-MEP36Rosa chinensisNC_037092.18942407889424091-14
Setaria_italica_NC_028458.1:2682368-2682381:+MEP36Setaria italicaNC_028458.126823682682381+14
Setaria_viridis_NC_048271.1:2710546-2710559:+MEP36Setaria viridisNC_048271.127105462710559+14
Sorghum_bicolor_NC_012870.2:3536960-3536973:+MEP36Sorghum bicolorNC_012870.235369603536973+14
Tripterygium_wilfordii_NC_052246.1:12735732-12735745:+MEP36Tripterygium wilfordiiNC_052246.11273573212735745+14
Vigna_angularis_NC_030641.1:1167877-1167890:+MEP36Vigna angularisNC_030641.111678771167890+14
Vigna_angularis_NW_016114859.1:172093-172106:+MEP36Vigna angularisNW_016114859.1172093172106+14
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028352.1:24361014-24361027:+MEP36Vigna radiata var.  radiataNC_028352.12436101424361027+14
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028358.1:14914-14927:+MEP36Vigna radiata var.  radiataNC_028358.11491414927+14
Vigna_unguiculata_NW_021011352.1:24471-24484:+MEP36Vigna unguiculataNW_021011352.12447124484+14
Vigna_unguiculata_NC_040282.1:42693257-42693270:-MEP36Vigna unguiculataNC_040282.14269325742693270-14
Vitis_riparia_NC_048436.1:22393187-22393200:-MEP36Vitis ripariaNC_048436.12239318722393200-14
Vitis_vinifera_NC_012012.3:634354-634367:+MEP36Vitis viniferaNC_012012.3634354634367+14
Aquilegia_coerulea_KZ305026.1:2834666-2834679:-MEP36Aquilegia coeruleaKZ305026.128346662834679-14
Arabidopsis_thaliana_NC_003075.7:13315563-13315576:-MEP36Arabidopsis thalianaNC_003075.71331556313315576-14
Brachypodium_distachyon_NC_016131.3:3190109-3190122:+MEP36Brachypodium distachyonNC_016131.331901093190122+14
Capsella_rubella_NW_006238917.1:5461944-5461957:+MEP36Capsella rubellaNW_006238917.154619445461957+14
Citrus_clementina_NW_006262688.1:348770-348783:+MEP36Citrus clementinaNW_006262688.1348770348783+14
Cucumis_sativus_NC_026655.2:26624079-26624092:-MEP36Cucumis sativusNC_026655.22662407926624092-14
Cucurbita_maxima_NW_019272018.1:3411049-3411062:+MEP36Cucurbita maximaNW_019272018.134110493411062+14
Cucurbita_moschata_NW_019268519.1:3920914-3920927:-MEP36Cucurbita moschataNW_019268519.139209143920927-14
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036641.1:8810336-8810349:+MEP36Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036641.188103368810349+14
Eutrema_salsugineum_NW_006256885.1:4042963-4042976:-MEP36Eutrema salsugineumNW_006256885.140429634042976-14
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020493.1:24058177-24058190:-MEP36Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020493.12405817724058190-14
Herrania_umbratica_NW_018397274.1:881298-881311:-MEP36Herrania umbraticaNW_018397274.1881298881311-14
Momordica_charantia_NW_019104534.1:202469-202482:+MEP36Momordica charantiaNW_019104534.1202469202482+14
Oryza_brachyantha_NC_023165.1:27415764-27415777:-MEP36Oryza brachyanthaNC_023165.12741576427415777-14
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029258.1:33691337-33691350:-MEP36Oryza sativa Japonica GroupNC_029258.13369133733691350-14
Prunus_dulcis_NC_047655.1:339835-339848:+MEP36Prunus dulcisNC_047655.1339835339848+14
Prunus_mume_NC_024126.1:617386-617399:+MEP36Prunus mumeNC_024126.1617386617399+14
Prunus_persica_NC_034014.1:408653-408666:+MEP36Prunus persicaNC_034014.1408653408666+14
Punica_granatum_NC_045132.1:24408698-24408711:+MEP36Punica granatumNC_045132.12440869824408711+14
Selaginella_moellendorffii_NW_003314293.1:713662-713675:+MEP36Selaginella moellendorffiiNW_003314293.1713662713675+14
Selaginella_moellendorffii_NW_003314306.1:708189-708202:+MEP36Selaginella moellendorffiiNW_003314306.1708189708202+14
Sesamum_indicum_NC_026153.1:1702183-1702196:-MEP36Sesamum indicumNC_026153.117021831702196-14
Tarenaya_hassleriana_NW_010966021.1:442937-442950:+MEP36Tarenaya hasslerianaNW_010966021.1442937442950+14