Cluster ID: MEP13

Size 7
Phase 0
Pfam domain ID DNA_ligase_A_M
Exon block sizes in the Microexon-tag 13,38,7,50
Microexon location in the Microexon-tag 3
Microexon-tag DNA Seq AAYCAGGAAATWGCMAAGGCWGCAARRGAKGGRYTKGMSASTGATMGACAGTTRTGYTATGTTGCWTTTGAYRTTCTKTATGYTGGAGAYACYAGYGTYATYCAYCAR
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP13 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_5:23159719-23159725:-MEP13A. thaliana52315971923159725-7
Gm_15:14530687-14530693:+MEP13G. max151453068714530693+7
Gm_9:5558522-5558528:+MEP13G. max955585225558528+7
Ha_5:91565508-91565514:-MEP13H. annuus59156550891565514-7
Os_4:30635450-30635456:-MEP13O. sativa43063545030635456-7
Pp_14:4075744-4075750:+MEP13P. patens1440757444075750+7
Ps_NC_039360.1:217303442-217303448:-MEP13P. somniferumNC_039360.1217303442217303448-7
Ps_NC_039364.1:158575500-158575506:-MEP13P. somniferumNC_039364.1158575500158575506-7
Vv_11:16988484-16988490:+MEP13V. vinifera111698848416988490+7
Zm_2:11680893-11680899:-MEP13Z. mays21168089311680899-7
Bn_scaffoldA10:17505820-17505826:-MEP13B. napusscaffoldA101750582017505826-7
Bn_scaffoldC09:51514622-51514628:-MEP13B. napusscaffoldC095151462251514628-7
Hv_2H:605241430-605241436:+MEP13H. vulgare2H605241430605241436+7
Pt_18:14738944-14738950:-MEP13P. trichocarpa181473894414738950-7
Sb_6:55706766-55706772:-MEP13S. bicolor65570676655706772-7
Sl_7:8742799-8742805:+MEP13S. lycopersicum787427998742805+7
Ta_2A:685031088-685031094:+MEP13T. aestivum2A685031088685031094+7
Ta_2B:647102615-647102621:+MEP13T. aestivum2B647102615647102621+7
Ta_2D:542144707-542144713:+MEP13T. aestivum2D542144707542144713+7
Nicotiana_tabacum_NW_015846656.1:89834-89840:-MEP13Nicotiana tabacumNW_015846656.18983489840-7
Nicotiana_tabacum_NW_015869384.1:142576-142582:-MEP13Nicotiana tabacumNW_015869384.1142576142582-7
Triticum_dicoccoides_NC_041382.1:688344439-688344445:+MEP13Triticum dicoccoidesNC_041382.1688344439688344445+7
Triticum_dicoccoides_NC_041383.1:660407050-660407056:+MEP13Triticum dicoccoidesNC_041383.1660407050660407056+7
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017913286.1:407340-407346:+MEP13Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017913286.1407340407346+7
Nicotiana_sylvestris_NW_009540416.1:155575-155581:-MEP13Nicotiana sylvestrisNW_009540416.1155575155581-7
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008897968.1:188300-188306:+MEP13Nicotiana tomentosiformisNW_008897968.1188300188306+7
Nicotiana_attenuata_NW_017670319.1:867179-867185:+MEP13Nicotiana attenuataNW_017670319.1867179867185+7
Capsicum_annuum_NC_029977.1:278967715-278967721:-MEP13Capsicum annuumNC_029977.1278967715278967721-7
Colocasia_esculenta_CM024755.1:19060674-19060680:-MEP13Colocasia esculentaCM024755.11906067419060680-7
Helianthus_annuus_NC_035437.2:30690315-30690321:-MEP13Helianthus annuusNC_035437.23069031530690321-7
Lactuca_sativa_NW_019672882.1:86721-86727:-MEP13Lactuca sativaNW_019672882.18672186727-7
Papaver_somniferum_NC_039360.1:217303442-217303448:-MEP13Papaver somniferumNC_039360.1217303442217303448-7
Papaver_somniferum_NC_039364.1:158575500-158575506:-MEP13Papaver somniferumNC_039364.1158575500158575506-7
Arachis_hypogaea_NC_037621.1:32646861-32646867:+MEP13Arachis hypogaeaNC_037621.13264686132646867+7
Arachis_hypogaea_NC_037631.1:30370473-30370479:+MEP13Arachis hypogaeaNC_037631.13037047330370479+7
Elaeis_guineensis_NC_025994.1:48280692-48280698:-MEP13Elaeis guineensisNC_025994.14828069248280698-7
Gossypium_hirsutum_NW_015962428.1:17684-17690:-MEP13Gossypium hirsutumNW_015962428.11768417690-7
Hevea_brasiliensis_NW_018746603.1:197849-197855:-MEP13Hevea brasiliensisNW_018746603.1197849197855-7
Liriodendron_chinense_PVNU02003949.1:3651346-3651352:+MEP13Liriodendron chinensePVNU02003949.136513463651352+7
Olea_europaea_var._sylvestris_NW_019236064.1:85858-85864:+MEP13Olea europaea var.  sylvestrisNW_019236064.18585885864+7
Persea_americana_SDSS01005656.1:16789-16795:+MEP13Persea americanaSDSS01005656.11678916795+7
Persea_americana_SDSS01000163.1:18097-18103:-MEP13Persea americanaSDSS01000163.11809718103-7
Persea_americana_SDSS01004319.1:28264-28270:-MEP13Persea americanaSDSS01004319.12826428270-7
Phalaenopsis_equestris_NW_018165751.1:48733-48739:+MEP13Phalaenopsis equestrisNW_018165751.14873348739+7
Zea_mays_NC_050097.1:11928601-11928607:-MEP13Zea maysNC_050097.11192860111928607-7
Chenopodium_quinoa_NW_018745666.1:76613-76619:+MEP13Chenopodium quinoaNW_018745666.17661376619+7
Chenopodium_quinoa_NW_018743292.1:1899489-1899495:-MEP13Chenopodium quinoaNW_018743292.118994891899495-7
Gossypium_arboreum_NC_030664.1:126804811-126804817:-MEP13Gossypium arboreumNC_030664.1126804811126804817-7
Hibiscus_syriacus_NW_024062680.1:257041-257047:+MEP13Hibiscus syriacusNW_024062680.1257041257047+7
Hibiscus_syriacus_NW_024063126.1:1170164-1170170:+MEP13Hibiscus syriacusNW_024063126.111701641170170+7
Prosopis_alba_NW_021635992.1:368257-368263:-MEP13Prosopis albaNW_021635992.1368257368263-7
Quercus_suber_NW_019810771.1:142525-142531:-MEP13Quercus suberNW_019810771.1142525142531-7
Arachis_duranensis_NC_029775.2:29976538-29976544:+MEP13Arachis duranensisNC_029775.22997653829976544+7
Arachis_ipaensis_NC_029788.2:28139763-28139769:+MEP13Arachis ipaensisNC_029788.22813976328139769+7
Asparagus_officinalis_NC_033794.1:671595-671601:+MEP13Asparagus officinalisNC_033794.1671595671601+7
Brassica_napus_NC_027766.2:9015622-9015628:-MEP13Brassica napusNC_027766.290156229015628-7
Brassica_napus_NC_027775.2:37440894-37440900:-MEP13Brassica napusNC_027775.23744089437440900-7
Coffea_arabica_NC_039908.1:32883460-32883466:-MEP13Coffea arabicaNC_039908.13288346032883466-7
Coffea_arabica_NC_039909.1:42368033-42368039:-MEP13Coffea arabicaNC_039909.14236803342368039-7
Coffea_eugenioides_NC_040040.1:45241545-45241551:-MEP13Coffea eugenioidesNC_040040.14524154545241551-7
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037529.1:9372126-9372132:-MEP13Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037529.193721269372132-7
Dendrobium_catenatum_NW_021319682.1:4463966-4463972:+MEP13Dendrobium catenatumNW_021319682.144639664463972+7
Glycine_soja_NC_041010.1:5491877-5491883:+MEP13Glycine sojaNC_041010.154918775491883+7
Glycine_soja_NC_041016.1:14575102-14575108:+MEP13Glycine sojaNC_041016.11457510214575108+7
Actinidia_rufa_BJWL01000029.1:13265926-13265932:+MEP13Actinidia rufaBJWL01000029.11326592613265932+7
Amborella_trichopoda_NW_006499801.1:2245367-2245373:-MEP13Amborella trichopodaNW_006499801.122453672245373-7
Benincasa_hispida_NC_052354.1:35327909-35327915:-MEP13Benincasa hispidaNC_052354.13532790935327915-7
Cajanus_cajan_NW_017984197.1:47272-47278:+MEP13Cajanus cajanNW_017984197.14727247278+7
Cannabis_sativa_NC_044377.1:53001558-53001564:-MEP13Cannabis sativaNC_044377.15300155853001564-7
Cicer_arietinum_NC_021160.1:20086449-20086455:+MEP13Cicer arietinumNC_021160.12008644920086455+7
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000002.1:733068-733074:+MEP13Cinnamomum micranthumQPKB01000002.1733068733074+7
Coffea_canephora_HG974433.1:25562353-25562359:-MEP13Coffea canephoraHG974433.12556235325562359-7
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052479.1:30676053-30676059:-MEP13Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052479.13067605330676059-7
Durio_zibethinus_NW_019167882.1:16824091-16824097:+MEP13Durio zibethinusNW_019167882.11682409116824097+7
Eucalyptus_grandis_NC_052614.1:437455-437461:-MEP13Eucalyptus grandisNC_052614.1437455437461-7
Glycine_max_NC_038245.1:5558522-5558528:+MEP13Glycine maxNC_038245.155585225558528+7
Glycine_max_NC_038251.1:14530687-14530693:+MEP13Glycine maxNC_038251.11453068714530693+7
Gossypium_raimondii_NC_026941.1:56260723-56260729:-MEP13Gossypium raimondiiNC_026941.15626072356260729-7
Ipomoea_nil_NW_017618147.1:335942-335948:+MEP13Ipomoea nilNW_017618147.1335942335948+7
Lupinus_angustifolius_NC_032023.1:929424-929430:+MEP13Lupinus angustifoliusNC_032023.1929424929430+7
Nelumbo_nucifera_NW_010729155.1:2016175-2016181:+MEP13Nelumbo nuciferaNW_010729155.120161752016181+7
Phoenix_dactylifera_NW_024068355.1:101167-101173:+MEP13Phoenix dactyliferaNW_024068355.1101167101173+7
Phoenix_dactylifera_NC_052392.1:18680542-18680548:-MEP13Phoenix dactyliferaNC_052392.11868054218680548-7
Piper_nigrum_Pn4:10339970-10339976:+MEP13Piper nigrumPn41033997010339976+7
Pistacia_vera_NW_022196017.1:183433-183439:-MEP13Pistacia veraNW_022196017.1183433183439-7
Populus_euphratica_NW_011499850.1:828173-828179:+MEP13Populus euphraticaNW_011499850.1828173828179+7
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988112.1:276328-276334:+MEP13Pyrus x bretschneideriNW_008988112.1276328276334+7
Quercus_lobata_NC_044905.1:46765011-46765017:-MEP13Quercus lobataNC_044905.14676501146765017-7
Solanum_lycopersicum_NC_015444.3:8742799-8742805:+MEP13Solanum lycopersicumNC_015444.387427998742805+7
Solanum_pennellii_NC_028643.1:9031956-9031962:+MEP13Solanum pennelliiNC_028643.190319569031962+7
Solanum_tuberosum_NW_006238982.1:392841-392847:-MEP13Solanum tuberosumNW_006238982.1392841392847-7
Syzygium_oleosum_NW_022076608.1:1939814-1939820:+MEP13Syzygium oleosumNW_022076608.119398141939820+7
Abrus_precatorius_NW_020874292.1:32883049-32883055:+MEP13Abrus precatoriusNW_020874292.13288304932883055+7
Ananas_comosus_NC_033634.1:1451545-1451551:+MEP13Ananas comosusNC_033634.114515451451551+7
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025815.2:2568334-2568340:-MEP13Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025815.225683342568340-7
Brassica_oleracea_var._oleracea_NC_027756.1:40396178-40396184:-MEP13Brassica oleracea var.  oleraceaNC_027756.14039617840396184-7
Brassica_rapa_NC_024804.2:12030413-12030419:-MEP13Brassica rapaNC_024804.21203041312030419-7
Camelina_sativa_NC_025686.1:23500257-23500263:-MEP13Camelina sativaNC_025686.12350025723500263-7
Camelina_sativa_NC_025695.1:44117043-44117049:-MEP13Camelina sativaNC_025695.14411704344117049-7
Camelina_sativa_NC_025702.1:15429952-15429958:-MEP13Camelina sativaNC_025702.11542995215429958-7
Carica_papaya_NW_019014597.1:185643-185649:+MEP13Carica papayaNW_019014597.1185643185649+7
Ceratophyllum_demersum_5:23606790-23606796:-MEP13Ceratophyllum demersum52360679023606796-7
Citrus_sinensis_NC_023049.1:2341516-2341522:+MEP13Citrus sinensisNC_023049.123415162341522+7
Cucumis_melo_NW_007546270.1:1528043-1528049:-MEP13Cucumis meloNW_007546270.115280431528049-7
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030386.1:33779079-33779085:+MEP13Daucus carota subsp.  sativusNC_030386.13377907933779085+7
Erythranthe_guttata_NW_012194995.1:950504-950510:-MEP13Erythranthe guttataNW_012194995.1950504950510-7
Ipomoea_triloba_NC_044927.1:140229-140235:-MEP13Ipomoea trilobaNC_044927.1140229140235-7
Jatropha_curcas_NW_023591615.1:160259-160265:+MEP13Jatropha curcasNW_023591615.1160259160265+7
Juglans_regia_NC_049908.1:3326000-3326006:-MEP13Juglans regiaNC_049908.133260003326006-7
Macleaya_cordata_MVGT01004527.1:69771-69777:-MEP13Macleaya cordataMVGT01004527.16977169777-7
Malus_domestica_NC_041804.1:27719044-27719050:-MEP13Malus domesticaNC_041804.12771904427719050-7
Manihot_esculenta_NC_035174.1:18950729-18950735:-MEP13Manihot esculentaNC_035174.11895072918950735-7
Medicago_truncatula_NC_053043.1:16654680-16654686:+MEP13Medicago truncatulaNC_053043.11665468016654686+7
Morus_notabilis_NW_010367729.1:40832-40838:-MEP13Morus notabilisNW_010367729.14083240838-7
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025202.1:18026130-18026136:+MEP13Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025202.11802613018026136+7
Nymphaea_colorata_NC_045148.1:11403957-11403963:-MEP13Nymphaea colorataNC_045148.11140395711403963-7
Panicum_hallii_NC_038048.1:43716740-43716746:-MEP13Panicum halliiNC_038048.14371674043716746-7
Phaseolus_vulgaris_NC_023751.1:34769131-34769137:-MEP13Phaseolus vulgarisNC_023751.13476913134769137-7
Populus_alba_NW_023272289.1:248829-248835:+MEP13Populus albaNW_023272289.1248829248835+7
Populus_trichocarpa_NC_037302.1:16204316-16204322:-MEP13Populus trichocarpaNC_037302.11620431616204322-7
Prunus_avium_NW_018921751.1:727615-727621:-MEP13Prunus aviumNW_018921751.1727615727621-7
Raphanus_sativus_NW_017353147.1:7858712-7858718:+MEP13Raphanus sativusNW_017353147.178587127858718+7
Rhodamnia_argentea_NW_022060849.1:1088378-1088384:+MEP13Rhodamnia argenteaNW_022060849.110883781088384+7
Rhododendron_simsii_CM024955.1:38945714-38945720:+MEP13Rhododendron simsiiCM024955.13894571438945720+7
Ricinus_communis_NW_002994559.1:162416-162422:-MEP13Ricinus communisNW_002994559.1162416162422-7
Rosa_chinensis_NC_037091.1:16483225-16483231:-MEP13Rosa chinensisNC_037091.11648322516483231-7
Setaria_italica_NC_028456.1:29301121-29301127:-MEP13Setaria italicaNC_028456.12930112129301127-7
Setaria_viridis_NC_048269.1:28458111-28458117:-MEP13Setaria viridisNC_048269.12845811128458117-7
Sorghum_bicolor_NC_012875.2:55706766-55706772:-MEP13Sorghum bicolorNC_012875.25570676655706772-7
Tripterygium_wilfordii_NC_052240.1:11449103-11449109:-MEP13Tripterygium wilfordiiNC_052240.11144910311449109-7
Vigna_angularis_NC_030640.1:626970-626976:+MEP13Vigna angularisNC_030640.1626970626976+7
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028355.1:3308191-3308197:-MEP13Vigna radiata var.  radiataNC_028355.133081913308197-7
Vigna_unguiculata_NC_040287.1:2487449-2487455:+MEP13Vigna unguiculataNC_040287.124874492487455+7
Vitis_riparia_NC_048441.1:2959448-2959454:-MEP13Vitis ripariaNC_048441.129594482959454-7
Vitis_vinifera_NC_012017.3:16988484-16988490:+MEP13Vitis viniferaNC_012017.31698848416988490+7
Ziziphus_jujuba_NC_029679.1:1436417-1436423:+MEP13Ziziphus jujubaNC_029679.114364171436423+7
Aquilegia_coerulea_KZ305035.1:931631-931637:-MEP13Aquilegia coeruleaKZ305035.1931631931637-7
Arabidopsis_lyrata_subsp._lyrata_NW_003302548.1:17951191-17951197:-MEP13Arabidopsis lyrata subsp.  lyrataNW_003302548.11795119117951197-7
Arabidopsis_thaliana_NC_003076.8:23159719-23159725:-MEP13Arabidopsis thalianaNC_003076.82315971923159725-7
Brachypodium_distachyon_NC_016135.3:23870128-23870134:-MEP13Brachypodium distachyonNC_016135.32387012823870134-7
Capsella_rubella_NW_006238916.1:9284514-9284520:-MEP13Capsella rubellaNW_006238916.192845149284520-7
Citrus_clementina_NW_006263303.1:26699889-26699895:-MEP13Citrus clementinaNW_006263303.12669988926699895-7
Cucumis_sativus_NC_026656.2:5148879-5148885:+MEP13Cucumis sativusNC_026656.251488795148885+7
Cucurbita_maxima_NW_019272033.1:875487-875493:-MEP13Cucurbita maximaNW_019272033.1875487875493-7
Cucurbita_moschata_NW_019268568.1:950814-950820:-MEP13Cucurbita moschataNW_019268568.1950814950820-7
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NW_019646592.1:10238-10244:+MEP13Cucurbita pepo subsp.  pepoNW_019646592.11023810244+7
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036648.1:3877720-3877726:-MEP13Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036648.138777203877726-7
Eutrema_salsugineum_NW_006256829.1:9409062-9409068:+MEP13Eutrema salsugineumNW_006256829.194090629409068+7
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020494.1:4058432-4058438:+MEP13Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020494.140584324058438+7
Herrania_umbratica_NW_018397256.1:2819673-2819679:-MEP13Herrania umbraticaNW_018397256.128196732819679-7
Momordica_charantia_NW_019104549.1:137846-137852:+MEP13Momordica charantiaNW_019104549.1137846137852+7
Oryza_brachyantha_NC_023166.1:17519870-17519876:-MEP13Oryza brachyanthaNC_023166.11751987017519876-7
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029259.1:30635450-30635456:-MEP13Oryza sativa Japonica GroupNC_029259.13063545030635456-7
Prunus_dulcis_NC_047650.1:5483885-5483891:-MEP13Prunus dulcisNC_047650.154838855483891-7
Prunus_mume_NC_024127.1:37018741-37018747:-MEP13Prunus mumeNC_024127.13701874137018747-7
Prunus_persica_NC_034009.1:5352435-5352441:-MEP13Prunus persicaNC_034009.153524355352441-7
Punica_granatum_NC_045128.1:7954439-7954445:+MEP13Punica granatumNC_045128.179544397954445+7
Punica_granatum_NC_045128.1:8345301-8345307:-MEP13Punica granatumNC_045128.183453018345307-7
Sesamum_indicum_NC_026155.1:10424050-10424056:+MEP13Sesamum indicumNC_026155.11042405010424056+7
Tarenaya_hassleriana_NW_010966021.1:624918-624924:-MEP13Tarenaya hasslerianaNW_010966021.1624918624924-7
Theobroma_cacao_NC_030858.1:16011508-16011514:+MEP13Theobroma cacaoNC_030858.11601150816011514+7