Cluster ID: MEP03

Size 3
Phase 0
Pfam domain ID CHORD
Exon block sizes in the Microexon-tag 54,3,51
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq GCYAYSTTCACCGARGAYGAYAAYCCYGAMGRYTCCTGYMVWTAYCAYGMYTCKGGACCTWTATTTCATGATGGWATGAAAGARTGGAGYTGYTGCAARMAAAGAAGY
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP03 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_5:21002322-21002324:-MEP03A. thaliana52100232221002324-3
Gm_10:47066312-47066314:+MEP03G. max104706631247066314+3
Gm_20:39080152-39080154:-MEP03G. max203908015239080154-3
Os_2:19728511-19728513:-MEP03O. sativa21972851119728513-3
Pp_14:6673647-6673649:-MEP03P. patens1466736476673649-3
Ps_NC_039361.1:31232636-31232638:+MEP03P. somniferumNC_039361.13123263631232638+3
Ps_NC_039361.1:31233131-31233133:+MEP03P. somniferumNC_039361.13123313131233133+3
Ps_NC_039365.1:28146976-28146978:+MEP03P. somniferumNC_039365.12814697628146978+3
Sm_GL377586:1110547-1110549:-MEP03S. moellendorffiiGL37758611105471110549-3
Vv_16:14381338-14381340:-MEP03V. vinifera161438133814381340-3
Zm_4:112430660-112430662:-MEP03Z. mays4112430660112430662-3
Zm_5:173629170-173629172:-MEP03Z. mays5173629170173629172-3
Bn_scaffoldA02:8410341-8410343:+MEP03B. napusscaffoldA0284103418410343+3
Bn_scaffoldA10:13848736-13848738:-MEP03B. napusscaffoldA101384873613848738-3
Bn_scaffoldC02:15742353-15742355:+MEP03B. napusscaffoldC021574235315742355+3
Hv_2H:596186741-596186743:+MEP03H. vulgare2H596186741596186743+3
Pt_15:14200569-14200571:-MEP03P. trichocarpa151420056914200571-3
Sb_4:51722604-51722606:-MEP03S. bicolor45172260451722606-3
Sl_11:55779989-55779991:-MEP03S. lycopersicum115577998955779991-3
Ta_2A:671339490-671339492:+MEP03T. aestivum2A671339490671339492+3
Ta_2B:622701864-622701866:+MEP03T. aestivum2B622701864622701866+3
Ta_2D:526374970-526374972:+MEP03T. aestivum2D526374970526374972+3
Nicotiana_tabacum_NW_015911352.1:12007-12009:+MEP03Nicotiana tabacumNW_015911352.11200712009+3
Nicotiana_tabacum_NW_015794651.1:28062-28064:-MEP03Nicotiana tabacumNW_015794651.12806228064-3
Triticum_dicoccoides_NC_041382.1:674578249-674578251:+MEP03Triticum dicoccoidesNC_041382.1674578249674578251+3
Triticum_dicoccoides_NC_041383.1:636363666-636363668:+MEP03Triticum dicoccoidesNC_041383.1636363666636363668+3
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017951841.1:1373510-1373512:-MEP03Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017951841.113735101373512-3
Nicotiana_sylvestris_NW_009357970.1:25984-25986:+MEP03Nicotiana sylvestrisNW_009357970.12598425986+3
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008910198.1:16759-16761:+MEP03Nicotiana tomentosiformisNW_008910198.11675916761+3
Capsicum_annuum_NC_029987.1:19367061-19367063:+MEP03Capsicum annuumNC_029987.11936706119367063+3
Colocasia_esculenta_CM024753.1:10038647-10038649:+MEP03Colocasia esculentaCM024753.11003864710038649+3
Helianthus_annuus_NC_035446.2:170623306-170623308:-MEP03Helianthus annuusNC_035446.2170623306170623308-3
Lactuca_sativa_NW_019673993.1:1952654-1952656:+MEP03Lactuca sativaNW_019673993.119526541952656+3
Arachis_hypogaea_NC_037626.1:110275487-110275489:+MEP03Arachis hypogaeaNC_037626.1110275487110275489+3
Arachis_hypogaea_NC_037636.1:157692517-157692519:-MEP03Arachis hypogaeaNC_037636.1157692517157692519-3
Elaeis_guineensis_NC_025994.1:22576642-22576644:-MEP03Elaeis guineensisNC_025994.12257664222576644-3
Elaeis_guineensis_NC_026001.1:37023611-37023613:-MEP03Elaeis guineensisNC_026001.13702361137023613-3
Gossypium_hirsutum_NC_030087.1:6034740-6034742:-MEP03Gossypium hirsutumNC_030087.160347406034742-3
Gossypium_hirsutum_NW_015962058.1:135006-135008:-MEP03Gossypium hirsutumNW_015962058.1135006135008-3
Hevea_brasiliensis_NW_018746115.1:145801-145803:+MEP03Hevea brasiliensisNW_018746115.1145801145803+3
Hevea_brasiliensis_NW_018746130.1:215300-215302:-MEP03Hevea brasiliensisNW_018746130.1215300215302-3
Liriodendron_chinense_PVNU02001198.1:2284981-2284983:+MEP03Liriodendron chinensePVNU02001198.122849812284983+3
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036248.1:21812467-21812469:-MEP03Olea europaea var.  sylvestrisNC_036248.12181246721812469-3
Zea_mays_NC_050099.1:113632531-113632533:-MEP03Zea maysNC_050099.1113632531113632533-3
Zea_mays_NC_050100.1:172989426-172989428:-MEP03Zea maysNC_050100.1172989426172989428-3
Chenopodium_quinoa_NW_018742334.1:72857-72859:+MEP03Chenopodium quinoaNW_018742334.17285772859+3
Chenopodium_quinoa_NW_018744460.1:1599156-1599158:+MEP03Chenopodium quinoaNW_018744460.115991561599158+3
Gossypium_arboreum_NC_030676.1:4680027-4680029:+MEP03Gossypium arboreumNC_030676.146800274680029+3
Hibiscus_syriacus_NW_024062653.1:1006361-1006363:+MEP03Hibiscus syriacusNW_024062653.110063611006363+3
Hibiscus_syriacus_NW_024062795.1:3767025-3767027:+MEP03Hibiscus syriacusNW_024062795.137670253767027+3
Hibiscus_syriacus_NW_024062798.1:2163337-2163339:+MEP03Hibiscus syriacusNW_024062798.121633372163339+3
Hibiscus_syriacus_NW_024063495.1:6390943-6390945:+MEP03Hibiscus syriacusNW_024063495.163909436390945+3
Hibiscus_syriacus_NW_024062242.1:1238448-1238450:-MEP03Hibiscus syriacusNW_024062242.112384481238450-3
Hibiscus_syriacus_NW_024062941.1:1928280-1928282:-MEP03Hibiscus syriacusNW_024062941.119282801928282-3
Prosopis_alba_NW_021636261.1:20581-20583:+MEP03Prosopis albaNW_021636261.12058120583+3
Quercus_suber_NW_019819786.1:189294-189296:-MEP03Quercus suberNW_019819786.1189294189296-3
Arachis_duranensis_NC_029780.2:110822517-110822519:+MEP03Arachis duranensisNC_029780.2110822517110822519+3
Arachis_ipaensis_NC_029793.2:146130496-146130498:-MEP03Arachis ipaensisNC_029793.2146130496146130498-3
Asparagus_officinalis_NC_033802.1:1142924-1142926:-MEP03Asparagus officinalisNC_033802.111429241142926-3
Brassica_napus_NC_027757.2:25129488-25129490:+MEP03Brassica napusNC_027757.22512948825129490+3
Brassica_napus_NC_027758.2:12312379-12312381:+MEP03Brassica napusNC_027758.21231237912312381+3
Brassica_napus_NC_027768.2:16540285-16540287:+MEP03Brassica napusNC_027768.21654028516540287+3
Coffea_arabica_NC_039900.1:3022180-3022182:+MEP03Coffea arabicaNC_039900.130221803022182+3
Coffea_arabica_NC_039901.1:3174279-3174281:+MEP03Coffea arabicaNC_039901.131742793174281+3
Coffea_eugenioides_NC_040036.1:3356801-3356803:+MEP03Coffea eugenioidesNC_040036.133568013356803+3
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037528.1:1258551-1258553:+MEP03Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037528.112585511258553+3
Glycine_soja_NC_041011.1:48651175-48651177:+MEP03Glycine sojaNC_041011.14865117548651177+3
Glycine_soja_NC_041021.1:42141554-42141556:-MEP03Glycine sojaNC_041021.14214155442141556-3
Spinacia_oleracea_NW_018931419.1:1246495-1246497:-MEP03Spinacia oleraceaNW_018931419.112464951246497-3
Actinidia_rufa_BJWL01000003.1:277141-277143:+MEP03Actinidia rufaBJWL01000003.1277141277143+3
Amborella_trichopoda_NW_006497735.1:320008-320010:-MEP03Amborella trichopodaNW_006497735.1320008320010-3
Benincasa_hispida_NC_052354.1:22367310-22367312:-MEP03Benincasa hispidaNC_052354.12236731022367312-3
Cajanus_cajan_NC_033805.1:31255513-31255515:+MEP03Cajanus cajanNC_033805.13125551331255515+3
Cajanus_cajan_NW_017984644.1:54524-54526:+MEP03Cajanus cajanNW_017984644.15452454526+3
Cannabis_sativa_NC_044374.1:37207541-37207543:+MEP03Cannabis sativaNC_044374.13720754137207543+3
Cicer_arietinum_NC_021163.1:13144968-13144970:+MEP03Cicer arietinumNC_021163.11314496813144970+3
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000006.1:23076258-23076260:+MEP03Cinnamomum micranthumQPKB01000006.12307625823076260+3
Coffea_canephora_HG974429.1:2993283-2993285:+MEP03Coffea canephoraHG974429.129932832993285+3
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NW_024087370.1:4007-4009:-MEP03Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNW_024087370.140074009-3
Eucalyptus_grandis_NC_052612.1:51821783-51821785:+MEP03Eucalyptus grandisNC_052612.15182178351821785+3
Glycine_max_NC_038246.1:47066312-47066314:+MEP03Glycine maxNC_038246.14706631247066314+3
Glycine_max_NC_038256.1:39080152-39080154:-MEP03Glycine maxNC_038256.13908015239080154-3
Gossypium_raimondii_NC_026934.1:45308660-45308662:-MEP03Gossypium raimondiiNC_026934.14530866045308662-3
Ipomoea_nil_NW_017618711.1:1912390-1912392:+MEP03Ipomoea nilNW_017618711.119123901912392+3
Lupinus_angustifolius_NC_032028.1:152033-152035:-MEP03Lupinus angustifoliusNC_032028.1152033152035-3
Nelumbo_nucifera_NW_010729189.1:1390992-1390994:-MEP03Nelumbo nuciferaNW_010729189.113909921390994-3
Phoenix_dactylifera_NC_052401.1:2067539-2067541:+MEP03Phoenix dactyliferaNC_052401.120675392067541+3
Phoenix_dactylifera_NC_052405.1:2393683-2393685:+MEP03Phoenix dactyliferaNC_052405.123936832393685+3
Piper_nigrum_Pn2:25242911-25242913:+MEP03Piper nigrumPn22524291125242913+3
Piper_nigrum_Pn8:7448767-7448769:+MEP03Piper nigrumPn874487677448769+3
Pistacia_vera_NW_022196634.1:1088400-1088402:-MEP03Pistacia veraNW_022196634.110884001088402-3
Populus_euphratica_NW_011499946.1:544460-544462:+MEP03Populus euphraticaNW_011499946.1544460544462+3
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988747.1:211638-211640:+MEP03Pyrus x bretschneideriNW_008988747.1211638211640+3
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988991.1:28222-28224:+MEP03Pyrus x bretschneideriNW_008988991.12822228224+3
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988844.1:103403-103405:-MEP03Pyrus x bretschneideriNW_008988844.1103403103405-3
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008989288.1:14472-14474:-MEP03Pyrus x bretschneideriNW_008989288.11447214474-3
Quercus_lobata_NC_044915.1:39356138-39356140:+MEP03Quercus lobataNC_044915.13935613839356140+3
Solanum_lycopersicum_NC_015448.3:55779989-55779991:-MEP03Solanum lycopersicumNC_015448.35577998955779991-3
Solanum_pennellii_NC_028647.1:65344902-65344904:-MEP03Solanum pennelliiNC_028647.16534490265344904-3
Solanum_tuberosum_NW_006238943.1:2934022-2934024:-MEP03Solanum tuberosumNW_006238943.129340222934024-3
Syzygium_oleosum_NW_022076748.1:223424-223426:-MEP03Syzygium oleosumNW_022076748.1223424223426-3
Abrus_precatorius_NW_020874417.1:33079713-33079715:+MEP03Abrus precatoriusNW_020874417.13307971333079715+3
Ananas_comosus_NC_033641.1:10297162-10297164:+MEP03Ananas comosusNC_033641.11029716210297164+3
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NW_017567367.1:448177-448179:+MEP03Beta vulgaris subsp.  vulgarisNW_017567367.1448177448179+3
Brassica_oleracea_var._oleracea_NC_027749.1:13845971-13845973:+MEP03Brassica oleracea var.  oleraceaNC_027749.11384597113845973+3
Brassica_rapa_NC_024796.2:8266370-8266372:+MEP03Brassica rapaNC_024796.282663708266372+3
Brassica_rapa_NC_024804.2:8457276-8457278:-MEP03Brassica rapaNC_024804.284572768457278-3
Camelina_sativa_NC_025686.1:16201232-16201234:-MEP03Camelina sativaNC_025686.11620123216201234-3
Camelina_sativa_NC_025695.1:40034990-40034992:-MEP03Camelina sativaNC_025695.14003499040034992-3
Camelina_sativa_NC_025702.1:11637936-11637938:-MEP03Camelina sativaNC_025702.11163793611637938-3
Carica_papaya_NW_019014689.1:1825174-1825176:+MEP03Carica papayaNW_019014689.118251741825176+3
Citrus_sinensis_NC_023054.1:15566157-15566159:-MEP03Citrus sinensisNC_023054.11556615715566159-3
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030386.1:33251908-33251910:-MEP03Daucus carota subsp.  sativusNC_030386.13325190833251910-3
Erythranthe_guttata_NW_012194756.1:417393-417395:-MEP03Erythranthe guttataNW_012194756.1417393417395-3
Euryale_ferox_25:4642867-4642869:+MEP03Euryale ferox2546428674642869+3
Euryale_ferox_26:17744062-17744064:+MEP03Euryale ferox261774406217744064+3
Euryale_ferox_7:17345123-17345125:-MEP03Euryale ferox71734512317345125-3
Ipomoea_triloba_NC_044920.1:22017696-22017698:-MEP03Ipomoea trilobaNC_044920.12201769622017698-3
Jatropha_curcas_NW_023590789.1:9618229-9618231:-MEP03Jatropha curcasNW_023590789.196182299618231-3
Juglans_regia_NC_049901.1:8556292-8556294:-MEP03Juglans regiaNC_049901.185562928556294-3
Macleaya_cordata_MVGT01002446.1:925487-925489:+MEP03Macleaya cordataMVGT01002446.1925487925489+3
Malus_domestica_NC_041789.1:28664176-28664178:-MEP03Malus domesticaNC_041789.12866417628664178-3
Malus_domestica_NC_041795.1:32630835-32630837:-MEP03Malus domesticaNC_041795.13263083532630837-3
Manihot_esculenta_NC_035166.1:24393264-24393266:-MEP03Manihot esculentaNC_035166.12439326424393266-3
Manihot_esculenta_NC_035166.1:25312649-25312651:-MEP03Manihot esculentaNC_035166.12531264925312651-3
Medicago_truncatula_NC_053042.1:49922621-49922623:+MEP03Medicago truncatulaNC_053042.14992262149922623+3
Morus_notabilis_NW_010366583.1:276509-276511:+MEP03Morus notabilisNW_010366583.1276509276511+3
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NW_008993464.1:5693-5695:+MEP03Musa acuminata subsp.  malaccensisNW_008993464.156935695+3
Panicum_hallii_NC_038042.1:45989140-45989142:-MEP03Panicum halliiNC_038042.14598914045989142-3
Phaseolus_vulgaris_NC_023753.1:5564151-5564153:-MEP03Phaseolus vulgarisNC_023753.155641515564153-3
Populus_alba_NW_023271598.1:601580-601582:-MEP03Populus albaNW_023271598.1601580601582-3
Populus_trichocarpa_NC_037299.1:14269240-14269242:-MEP03Populus trichocarpaNC_037299.11426924014269242-3
Prunus_avium_NW_018922341.1:12338-12340:-MEP03Prunus aviumNW_018922341.11233812340-3
Raphanus_sativus_NW_017353147.1:12777869-12777871:+MEP03Raphanus sativusNW_017353147.11277786912777871+3
Raphanus_sativus_NW_017353140.1:10418481-10418483:-MEP03Raphanus sativusNW_017353140.11041848110418483-3
Raphanus_sativus_NW_017353140.1:10429816-10429818:-MEP03Raphanus sativusNW_017353140.11042981610429818-3
Rhodamnia_argentea_NW_022060838.1:883774-883776:+MEP03Rhodamnia argenteaNW_022060838.1883774883776+3
Rhododendron_simsii_CM024955.1:29077930-29077932:-MEP03Rhododendron simsiiCM024955.12907793029077932-3
Ricinus_communis_NW_002994278.1:716737-716739:+MEP03Ricinus communisNW_002994278.1716737716739+3
Rosa_chinensis_NC_037088.1:62750323-62750325:-MEP03Rosa chinensisNC_037088.16275032362750325-3
Setaria_italica_NC_028450.1:26165320-26165322:-MEP03Setaria italicaNC_028450.12616532026165322-3
Setaria_viridis_NC_048263.1:26085611-26085613:-MEP03Setaria viridisNC_048263.12608561126085613-3
Sorghum_bicolor_NC_012873.2:51722604-51722606:-MEP03Sorghum bicolorNC_012873.25172260451722606-3
Tripterygium_wilfordii_NC_052250.1:13240921-13240923:-MEP03Tripterygium wilfordiiNC_052250.11324092113240923-3
Vigna_angularis_NC_030638.1:30041251-30041253:+MEP03Vigna angularisNC_030638.13004125130041253+3
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028358.1:41329522-41329524:+MEP03Vigna radiata var.  radiataNC_028358.14132952241329524+3
Vigna_unguiculata_NC_040285.1:35510194-35510196:+MEP03Vigna unguiculataNC_040285.13551019435510196+3
Vitis_riparia_NC_048446.1:15101375-15101377:-MEP03Vitis ripariaNC_048446.11510137515101377-3
Vitis_vinifera_NC_012022.3:14381338-14381340:-MEP03Vitis viniferaNC_012022.31438133814381340-3
Ziziphus_jujuba_NC_029683.1:17279880-17279882:+MEP03Ziziphus jujubaNC_029683.11727988017279882+3
Aquilegia_coerulea_KZ305030.1:3578084-3578086:+MEP03Aquilegia coeruleaKZ305030.135780843578086+3
Arabidopsis_lyrata_subsp._lyrata_NW_003302548.1:14661290-14661292:-MEP03Arabidopsis lyrata subsp.  lyrataNW_003302548.11466129014661292-3
Arabidopsis_thaliana_NC_003076.8:21002322-21002324:-MEP03Arabidopsis thalianaNC_003076.82100232221002324-3
Brachypodium_distachyon_NC_016133.3:46729002-46729004:-MEP03Brachypodium distachyonNC_016133.34672900246729004-3
Capsella_rubella_NW_006238916.1:6936495-6936497:-MEP03Capsella rubellaNW_006238916.169364956936497-3
Citrus_clementina_NW_006261964.1:28025466-28025468:-MEP03Citrus clementinaNW_006261964.12802546628025468-3
Cucumis_sativus_NC_026656.2:8028172-8028174:-MEP03Cucumis sativusNC_026656.280281728028174-3
Cucurbita_maxima_NW_019272032.1:1111670-1111672:-MEP03Cucurbita maximaNW_019272032.111116701111672-3
Cucurbita_moschata_NW_019268538.1:1117418-1117420:-MEP03Cucurbita moschataNW_019268538.111174181117420-3
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036642.1:4074228-4074230:+MEP03Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036642.140742284074230+3
Eutrema_salsugineum_NW_006256829.1:13241777-13241779:+MEP03Eutrema salsugineumNW_006256829.11324177713241779+3
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020497.1:23250634-23250636:+MEP03Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020497.12325063423250636+3
Herrania_umbratica_NW_018397261.1:5639299-5639301:-MEP03Herrania umbraticaNW_018397261.156392995639301-3
Momordica_charantia_NW_019104490.1:4349154-4349156:+MEP03Momordica charantiaNW_019104490.143491544349156+3
Oryza_brachyantha_NC_023164.1:14264029-14264031:-MEP03Oryza brachyanthaNC_023164.11426402914264031-3
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029257.1:19728511-19728513:-MEP03Oryza sativa Japonica GroupNC_029257.11972851119728513-3
Prunus_dulcis_NC_047651.1:23924693-23924695:-MEP03Prunus dulcisNC_047651.12392469323924695-3
Prunus_mume_NC_024130.1:23888591-23888593:+MEP03Prunus mumeNC_024130.12388859123888593+3
Prunus_persica_NC_034010.1:28147701-28147703:-MEP03Prunus persicaNC_034010.12814770128147703-3
Punica_granatum_NC_045130.1:39482328-39482330:+MEP03Punica granatumNC_045130.13948232839482330+3
Sesamum_indicum_NC_026148.1:10638510-10638512:-MEP03Sesamum indicumNC_026148.11063851010638512-3
Sesamum_indicum_NW_011628055.1:336153-336155:-MEP03Sesamum indicumNW_011628055.1336153336155-3
Tarenaya_hassleriana_NW_010966986.1:563406-563408:-MEP03Tarenaya hasslerianaNW_010966986.1563406563408-3
Theobroma_cacao_NC_030852.1:27896269-27896271:-MEP03Theobroma cacaoNC_030852.12789626927896271-3