Cluster ID: MEP43

Size 15
Phase 0
Pfam domain ID Unknown
Exon block sizes in the Microexon-tag 48,15,45
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq GARCTTCTYAGWCTAGCWTCAACMGAARTACARMGACARTTYTWTCAGGARGCRAGGATTAAGACTGCTGTWTTCATGGGGTGYAACARWGGWGAAATTGARMTYGGT
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP43 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_5:23040680-23040694:-MEP43A. thaliana52304068023040694-15
Gm_13:21988733-21988747:+MEP43G. max132198873321988747+15
Gm_15:15478971-15478985:+MEP43G. max151547897115478985+15
Gm_17:4111606-4111620:-MEP43G. max1741116064111620-15
Gm_9:6212909-6212923:+MEP43G. max962129096212923+15
Ha_3:1917914-1917928:-MEP43H. annuus319179141917928-15
Ha_9:5050467-5050481:+MEP43H. annuus950504675050481+15
Ps_NC_039359.1:218972900-218972914:+MEP43P. somniferumNC_039359.1218972900218972914+15
Ps_NC_039359.1:62173815-62173829:-MEP43P. somniferumNC_039359.16217381562173829-15
Vv_11:1660184-1660198:-MEP43V. vinifera1116601841660198-15
Bn_scaffoldA02:6487556-6487570:+MEP43B. napusscaffoldA0264875566487570+15
Bn_scaffoldC02:11083504-11083518:+MEP43B. napusscaffoldC021108350411083518+15
Pt_6:12867505-12867519:-MEP43P. trichocarpa61286750512867519-15
Camellia_sinensis_NW_021026335.1:594702-594716:-MEP43Camellia sinensisNW_021026335.1594702594716-15
Camellia_sinensis_NW_021027653.1:597265-597279:-MEP43Camellia sinensisNW_021027653.1597265597279-15
Helianthus_annuus_NC_035435.2:1744400-1744414:-MEP43Helianthus annuusNC_035435.217444001744414-15
Helianthus_annuus_NC_035441.2:3511482-3511496:-MEP43Helianthus annuusNC_035441.235114823511496-15
Lactuca_sativa_NW_019672135.1:2382494-2382508:-MEP43Lactuca sativaNW_019672135.123824942382508-15
Papaver_somniferum_NC_039359.1:218972900-218972914:+MEP43Papaver somniferumNC_039359.1218972900218972914+15
Papaver_somniferum_NC_039359.1:62173815-62173829:-MEP43Papaver somniferumNC_039359.16217381562173829-15
Arachis_hypogaea_NC_037620.1:41880235-41880249:+MEP43Arachis hypogaeaNC_037620.14188023541880249+15
Arachis_hypogaea_NC_037628.1:148891552-148891566:+MEP43Arachis hypogaeaNC_037628.1148891552148891566+15
Arachis_hypogaea_NC_037618.1:94849850-94849864:-MEP43Arachis hypogaeaNC_037618.19484985094849864-15
Gossypium_hirsutum_NC_030092.1:66777836-66777850:-MEP43Gossypium hirsutumNC_030092.16677783666777850-15
Gossypium_hirsutum_NW_015962084.1:387436-387450:-MEP43Gossypium hirsutumNW_015962084.1387436387450-15
Gossypium_hirsutum_NW_015962249.1:242357-242371:-MEP43Gossypium hirsutumNW_015962249.1242357242371-15
Hevea_brasiliensis_NW_018745693.1:4816854-4816868:+MEP43Hevea brasiliensisNW_018745693.148168544816868+15
Hevea_brasiliensis_NW_018745793.1:2238777-2238791:+MEP43Hevea brasiliensisNW_018745793.122387772238791+15
Hevea_brasiliensis_NW_018746737.1:305064-305078:-MEP43Hevea brasiliensisNW_018746737.1305064305078-15
Liriodendron_chinense_ML058383.1:1165220-1165234:+MEP43Liriodendron chinenseML058383.111652201165234+15
Liriodendron_chinense_ML058383.1:1202448-1202462:+MEP43Liriodendron chinenseML058383.112024481202462+15
Liriodendron_chinense_ML058383.1:1229656-1229670:+MEP43Liriodendron chinenseML058383.112296561229670+15
Liriodendron_chinense_ML058461.1:6122262-6122276:+MEP43Liriodendron chinenseML058461.161222626122276+15
Olea_europaea_var._sylvestris_NW_019235059.1:99046-99060:+MEP43Olea europaea var.  sylvestrisNW_019235059.19904699060+15
Gossypium_arboreum_NC_030664.1:1818716-1818730:+MEP43Gossypium arboreumNC_030664.118187161818730+15
Gossypium_arboreum_NC_030671.1:32806248-32806262:+MEP43Gossypium arboreumNC_030671.13280624832806262+15
Gossypium_arboreum_NC_030671.1:59345706-59345720:-MEP43Gossypium arboreumNC_030671.15934570659345720-15
Hibiscus_syriacus_NW_024062780.1:1230195-1230209:+MEP43Hibiscus syriacusNW_024062780.112301951230209+15
Hibiscus_syriacus_NW_024062953.1:756169-756183:+MEP43Hibiscus syriacusNW_024062953.1756169756183+15
Hibiscus_syriacus_NW_024063342.1:899684-899698:-MEP43Hibiscus syriacusNW_024063342.1899684899698-15
Hibiscus_syriacus_NW_024063498.1:451535-451549:-MEP43Hibiscus syriacusNW_024063498.1451535451549-15
Prosopis_alba_NW_021633526.1:11638-11652:+MEP43Prosopis albaNW_021633526.11163811652+15
Prosopis_alba_NW_021637205.1:121501-121515:+MEP43Prosopis albaNW_021637205.1121501121515+15
Prosopis_alba_NW_021635998.1:68058-68072:-MEP43Prosopis albaNW_021635998.16805868072-15
Quercus_suber_NW_019810515.1:67447-67461:+MEP43Quercus suberNW_019810515.16744767461+15
Arachis_duranensis_NC_029774.2:38985012-38985026:+MEP43Arachis duranensisNC_029774.23898501238985026+15
Arachis_duranensis_NC_029772.2:90149889-90149903:-MEP43Arachis duranensisNC_029772.29014988990149903-15
Arachis_ipaensis_NC_029785.2:137029572-137029586:+MEP43Arachis ipaensisNC_029785.2137029572137029586+15
Arachis_ipaensis_NC_029787.2:41339739-41339753:+MEP43Arachis ipaensisNC_029787.24133973941339753+15
Brassica_napus_NC_027758.2:9968598-9968612:+MEP43Brassica napusNC_027758.299685989968612+15
Brassica_napus_NC_027768.2:11451366-11451380:+MEP43Brassica napusNC_027768.21145136611451380+15
Brassica_napus_NW_019168959.1:7845-7859:+MEP43Brassica napusNW_019168959.178457859+15
Coffea_arabica_NC_039908.1:7282953-7282967:+MEP43Coffea arabicaNC_039908.172829537282967+15
Coffea_arabica_NC_039909.1:8522511-8522525:+MEP43Coffea arabicaNC_039909.185225118522525+15
Coffea_eugenioides_NC_040040.1:10776896-10776910:+MEP43Coffea eugenioidesNC_040040.11077689610776910+15
Glycine_soja_NC_041010.1:6120133-6120147:+MEP43Glycine sojaNC_041010.161201336120147+15
Glycine_soja_NC_041014.1:21929888-21929902:+MEP43Glycine sojaNC_041014.12192988821929902+15
Glycine_soja_NC_041016.1:15512586-15512600:+MEP43Glycine sojaNC_041016.11551258615512600+15
Glycine_soja_NC_041018.1:4112257-4112271:-MEP43Glycine sojaNC_041018.141122574112271-15
Spinacia_oleracea_NW_018933013.1:39252-39266:-MEP43Spinacia oleraceaNW_018933013.13925239266-15
Actinidia_rufa_BJWL01000009.1:5430552-5430566:-MEP43Actinidia rufaBJWL01000009.154305525430566-15
Actinidia_rufa_BJWL01000430.1:281231-281245:-MEP43Actinidia rufaBJWL01000430.1281231281245-15
Benincasa_hispida_NC_052350.1:50376264-50376278:-MEP43Benincasa hispidaNC_052350.15037626450376278-15
Cajanus_cajan_NC_033811.1:10793763-10793777:-MEP43Cajanus cajanNC_033811.11079376310793777-15
Cannabis_sativa_NC_044371.1:47249528-47249542:-MEP43Cannabis sativaNC_044371.14724952847249542-15
Cicer_arietinum_NC_021160.1:22685978-22685992:+MEP43Cicer arietinumNC_021160.12268597822685992+15
Coffea_canephora_HG974433.1:9291716-9291730:+MEP43Coffea canephoraHG974433.192917169291730+15
Durio_zibethinus_NW_019167860.1:7001621-7001635:+MEP43Durio zibethinusNW_019167860.170016217001635+15
Durio_zibethinus_NW_019168159.1:31574229-31574243:-MEP43Durio zibethinusNW_019168159.13157422931574243-15
Glycine_max_NC_038245.1:6212909-6212923:+MEP43Glycine maxNC_038245.162129096212923+15
Glycine_max_NC_038249.1:21988733-21988747:+MEP43Glycine maxNC_038249.12198873321988747+15
Glycine_max_NC_038251.1:15478971-15478985:+MEP43Glycine maxNC_038251.11547897115478985+15
Glycine_max_NC_038253.1:4111606-4111620:-MEP43Glycine maxNC_038253.141116064111620-15
Gossypium_raimondii_NC_026929.1:1192633-1192647:+MEP43Gossypium raimondiiNC_026929.111926331192647+15
Gossypium_raimondii_NC_026937.1:2396647-2396661:+MEP43Gossypium raimondiiNC_026937.123966472396661+15
Ipomoea_nil_NW_017617835.1:2960848-2960862:+MEP43Ipomoea nilNW_017617835.129608482960862+15
Lupinus_angustifolius_NC_032009.1:22492189-22492203:+MEP43Lupinus angustifoliusNC_032009.12249218922492203+15
Lupinus_angustifolius_NC_032023.1:1657646-1657660:+MEP43Lupinus angustifoliusNC_032023.116576461657660+15
Nelumbo_nucifera_NW_010729236.1:695436-695450:+MEP43Nelumbo nuciferaNW_010729236.1695436695450+15
Nelumbo_nucifera_NW_010729102.1:4585793-4585807:-MEP43Nelumbo nuciferaNW_010729102.145857934585807-15
Pistacia_vera_NW_022196109.1:114436-114450:+MEP43Pistacia veraNW_022196109.1114436114450+15
Pistacia_vera_NW_022196087.1:120337-120351:-MEP43Pistacia veraNW_022196087.1120337120351-15
Populus_euphratica_NW_011500158.1:186168-186182:+MEP43Populus euphraticaNW_011500158.1186168186182+15
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988062.1:1388338-1388352:+MEP43Pyrus x bretschneideriNW_008988062.113883381388352+15
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988125.1:423796-423810:+MEP43Pyrus x bretschneideriNW_008988125.1423796423810+15
Quercus_lobata_NC_044905.1:62365834-62365848:-MEP43Quercus lobataNC_044905.16236583462365848-15
Abrus_precatorius_NW_020874292.1:33316346-33316360:+MEP43Abrus precatoriusNW_020874292.13331634633316360+15
Abrus_precatorius_NW_020874428.1:32334229-32334243:-MEP43Abrus precatoriusNW_020874428.13233422932334243-15
Ananas_comosus_NC_033630.1:1317541-1317555:-MEP43Ananas comosusNC_033630.113175411317555-15
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NW_017567487.1:280126-280140:+MEP43Beta vulgaris subsp.  vulgarisNW_017567487.1280126280140+15
Brassica_oleracea_var._oleracea_NC_027749.1:9739647-9739661:+MEP43Brassica oleracea var.  oleraceaNC_027749.197396479739661+15
Brassica_rapa_NC_024796.2:6300703-6300717:+MEP43Brassica rapaNC_024796.263007036300717+15
Camelina_sativa_NC_025686.1:23301998-23302012:-MEP43Camelina sativaNC_025686.12330199823302012-15
Camelina_sativa_NC_025695.1:43926508-43926522:-MEP43Camelina sativaNC_025695.14392650843926522-15
Camelina_sativa_NC_025702.1:15221011-15221025:-MEP43Camelina sativaNC_025702.11522101115221025-15
Citrus_sinensis_NC_023049.1:12669594-12669608:+MEP43Citrus sinensisNC_023049.11266959412669608+15
Cucumis_melo_NW_007546292.1:2221110-2221124:+MEP43Cucumis meloNW_007546292.122211102221124+15
Daucus_carota_subsp._sativus_NW_016089447.1:1309394-1309408:+MEP43Daucus carota subsp.  sativusNW_016089447.113093941309408+15
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030383.1:42501503-42501517:-MEP43Daucus carota subsp.  sativusNC_030383.14250150342501517-15
Juglans_regia_NC_049901.1:36295157-36295171:-MEP43Juglans regiaNC_049901.13629515736295171-15
Juglans_regia_NC_049910.1:26657774-26657788:-MEP43Juglans regiaNC_049910.12665777426657788-15
Macleaya_cordata_MVGT01002357.1:206299-206313:+MEP43Macleaya cordataMVGT01002357.1206299206313+15
Malus_domestica_NC_041790.1:6411150-6411164:+MEP43Malus domesticaNC_041790.164111506411164+15
Malus_domestica_NC_041803.1:16767696-16767710:+MEP43Malus domesticaNC_041803.11676769616767710+15
Manihot_esculenta_NC_035163.1:2765434-2765448:+MEP43Manihot esculentaNC_035163.127654342765448+15
Manihot_esculenta_NC_035176.1:25676040-25676054:-MEP43Manihot esculentaNC_035176.12567604025676054-15
Medicago_truncatula_NC_053043.1:17391543-17391557:+MEP43Medicago truncatulaNC_053043.11739154317391557+15
Morus_notabilis_NW_010358084.1:681504-681518:+MEP43Morus notabilisNW_010358084.1681504681518+15
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025207.1:618455-618469:-MEP43Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025207.1618455618469-15
Phaseolus_vulgaris_NC_023757.1:32727029-32727043:-MEP43Phaseolus vulgarisNC_023757.13272702932727043-15
Phaseolus_vulgaris_NC_023751.1:34156614-34156628:-MEP43Phaseolus vulgarisNC_023751.13415661434156628-15
Populus_alba_NW_023271382.1:1460609-1460623:+MEP43Populus albaNW_023271382.114606091460623+15
Populus_trichocarpa_NC_037290.1:12900228-12900242:-MEP43Populus trichocarpaNC_037290.11290022812900242-15
Prunus_avium_NW_018921354.1:71695-71709:+MEP43Prunus aviumNW_018921354.17169571709+15
Raphanus_sativus_NW_017353140.1:24218233-24218247:+MEP43Raphanus sativusNW_017353140.12421823324218247+15
Rhododendron_simsii_CM024955.1:35333981-35333995:-MEP43Rhododendron simsiiCM024955.13533398135333995-15
Rhododendron_simsii_CM024957.1:2379207-2379221:-MEP43Rhododendron simsiiCM024957.123792072379221-15
Ricinus_communis_NW_002994288.1:420684-420698:+MEP43Ricinus communisNW_002994288.1420684420698+15
Rosa_chinensis_NC_037089.1:6834322-6834336:+MEP43Rosa chinensisNC_037089.168343226834336+15
Tripterygium_wilfordii_NC_052235.1:2841397-2841411:-MEP43Tripterygium wilfordiiNC_052235.128413972841411-15
Vigna_angularis_NC_030640.1:1145445-1145459:+MEP43Vigna angularisNC_030640.111454451145459+15
Vigna_angularis_NW_016115145.1:562282-562296:+MEP43Vigna angularisNW_016115145.1562282562296+15
Vigna_angularis_NW_016115145.1:573057-573071:+MEP43Vigna angularisNW_016115145.1573057573071+15
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028357.1:46041343-46041357:+MEP43Vigna radiata var.  radiataNC_028357.14604134346041357+15
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028355.1:2856670-2856684:-MEP43Vigna radiata var.  radiataNC_028355.128566702856684-15
Vigna_unguiculata_NC_040281.1:59913633-59913647:+MEP43Vigna unguiculataNC_040281.15991363359913647+15
Vigna_unguiculata_NC_040287.1:2953538-2953552:+MEP43Vigna unguiculataNC_040287.129535382953552+15
Vitis_riparia_NC_048441.1:18142333-18142347:+MEP43Vitis ripariaNC_048441.11814233318142347+15
Vitis_vinifera_NC_012017.3:1660184-1660198:-MEP43Vitis viniferaNC_012017.316601841660198-15
Ziziphus_jujuba_NC_029686.1:3833985-3833999:-MEP43Ziziphus jujubaNC_029686.138339853833999-15
Aquilegia_coerulea_KZ305037.1:3062021-3062035:-MEP43Aquilegia coeruleaKZ305037.130620213062035-15
Arabidopsis_lyrata_subsp._lyrata_NW_003302548.1:17808773-17808787:-MEP43Arabidopsis lyrata subsp.  lyrataNW_003302548.11780877317808787-15
Arabidopsis_lyrata_subsp._lyrata_NW_003302345.1:360-374:-MEP43Arabidopsis lyrata subsp.  lyrataNW_003302345.1360374-15
Arabidopsis_thaliana_NC_003076.8:23040680-23040694:-MEP43Arabidopsis thalianaNC_003076.82304068023040694-15
Capsella_rubella_NW_006238916.1:9157196-9157210:-MEP43Capsella rubellaNW_006238916.191571969157210-15
Citrus_clementina_NW_006263303.1:10399215-10399229:+MEP43Citrus clementinaNW_006263303.11039921510399229+15
Cucumis_sativus_NC_026655.2:25826761-25826775:+MEP43Cucumis sativusNC_026655.22582676125826775+15
Cucurbita_maxima_NW_019272026.1:3025853-3025867:-MEP43Cucurbita maximaNW_019272026.130258533025867-15
Cucurbita_moschata_NW_019268541.1:1063347-1063361:+MEP43Cucurbita moschataNW_019268541.110633471063361+15
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036655.1:4915565-4915579:-MEP43Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036655.149155654915579-15
Eutrema_salsugineum_NW_006256829.1:9586389-9586403:+MEP43Eutrema salsugineumNW_006256829.195863899586403+15
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020491.1:6271588-6271602:+MEP43Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020491.162715886271602+15
Momordica_charantia_NW_019104534.1:981966-981980:-MEP43Momordica charantiaNW_019104534.1981966981980-15
Prunus_dulcis_NC_047656.1:17963475-17963489:-MEP43Prunus dulcisNC_047656.11796347517963489-15
Prunus_mume_NC_024133.1:13983380-13983394:+MEP43Prunus mumeNC_024133.11398338013983394+15
Prunus_persica_NC_034015.1:19083576-19083590:-MEP43Prunus persicaNC_034015.11908357619083590-15
Sesamum_indicum_NC_026155.1:8760022-8760036:+MEP43Sesamum indicumNC_026155.187600228760036+15