Cluster ID: MEP12

Size 6
Phase 1
Pfam domain ID Unknown
Exon block sizes in the Microexon-tag 52,6,50
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq GAAGAMCRTGTKCGKGAGGATKTKCARAAGTWYYCWAGRGGWTCYCCACAAGCWAGAGCTTATSGKAATGATGGMRCWMRRRGYCGWTCAASMCATTCAAAATCTCCM
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP12 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_3:23064414-23064419:-MEP12A. thaliana32306441423064419-6
Gm_19:47071981-47071986:+MEP12G. max194707198147071986+6
Gm_3:42420938-42420943:+MEP12G. max34242093842420943+6
Ha_10:36803874-36803879:-MEP12H. annuus103680387436803879-6
Os_1:8359119-8359124:-MEP12O. sativa183591198359124-6
Ps_NC_039359.1:13489640-13489645:+MEP12P. somniferumNC_039359.11348964013489645+6
Ps_NW_020622381.1:11907329-11907334:-MEP12P. somniferumNW_020622381.11190732911907334-6
Vv_7:4221812-4221817:+MEP12V. vinifera742218124221817+6
Bn_scaffoldA09:57527993-57527998:-MEP12B. napusscaffoldA095752799357527998-6
Hv_3H:167210528-167210533:-MEP12H. vulgare3H167210528167210533-6
Pt_14:7960083-7960088:-MEP12P. trichocarpa1479600837960088-6
Pt_2:15561162-15561167:-MEP12P. trichocarpa21556116215561167-6
Sl_8:62502722-62502727:-MEP12S. lycopersicum86250272262502727-6
Ta_3A:185179663-185179668:-MEP12T. aestivum3A185179663185179668-6
Ta_3B:236359150-236359155:-MEP12T. aestivum3B236359150236359155-6
Ta_3D:159621919-159621924:-MEP12T. aestivum3D159621919159621924-6
Nicotiana_tabacum_NW_015788879.1:8868-8873:+MEP12Nicotiana tabacumNW_015788879.188688873+6
Nicotiana_tabacum_NW_015885264.1:91125-91130:-MEP12Nicotiana tabacumNW_015885264.19112591130-6
Triticum_dicoccoides_NC_041384.1:193706406-193706411:-MEP12Triticum dicoccoidesNC_041384.1193706406193706411-6
Triticum_dicoccoides_NC_041385.1:240784929-240784934:-MEP12Triticum dicoccoidesNC_041385.1240784929240784934-6
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017938612.1:23886-23891:+MEP12Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017938612.12388623891+6
Nicotiana_sylvestris_NW_009586264.1:15061-15066:-MEP12Nicotiana sylvestrisNW_009586264.11506115066-6
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008897019.1:11211-11216:+MEP12Nicotiana tomentosiformisNW_008897019.11121111216+6
Camellia_sinensis_NW_021025080.1:457167-457172:+MEP12Camellia sinensisNW_021025080.1457167457172+6
Camellia_sinensis_NW_021030660.1:105048-105053:-MEP12Camellia sinensisNW_021030660.1105048105053-6
Nicotiana_attenuata_NC_031996.1:35678850-35678855:+MEP12Nicotiana attenuataNC_031996.13567885035678855+6
Colocasia_esculenta_CM024757.1:172605516-172605521:-MEP12Colocasia esculentaCM024757.1172605516172605521-6
Helianthus_annuus_NC_035442.2:27601388-27601393:-MEP12Helianthus annuusNC_035442.22760138827601393-6
Arachis_hypogaea_NC_037633.1:13402252-13402257:+MEP12Arachis hypogaeaNC_037633.11340225213402257+6
Arachis_hypogaea_NC_037623.1:7414362-7414367:-MEP12Arachis hypogaeaNC_037623.174143627414367-6
Gossypium_hirsutum_NC_030082.1:54229781-54229786:-MEP12Gossypium hirsutumNC_030082.15422978154229786-6
Gossypium_hirsutum_NC_030093.1:33307265-33307270:-MEP12Gossypium hirsutumNC_030093.13330726533307270-6
Hevea_brasiliensis_NW_018746528.1:93771-93776:-MEP12Hevea brasiliensisNW_018746528.19377193776-6
Hevea_brasiliensis_NW_018746977.1:77119-77124:-MEP12Hevea brasiliensisNW_018746977.17711977124-6
Liriodendron_chinense_PVNU02004051.1:2715773-2715778:-MEP12Liriodendron chinensePVNU02004051.127157732715778-6
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036249.1:8785717-8785722:-MEP12Olea europaea var.  sylvestrisNC_036249.187857178785722-6
Olea_europaea_var._sylvestris_NC_036255.1:9932762-9932767:-MEP12Olea europaea var.  sylvestrisNC_036255.199327629932767-6
Persea_americana_SDSS01000785.1:208659-208664:+MEP12Persea americanaSDSS01000785.1208659208664+6
Phalaenopsis_equestris_NW_018164444.1:15541232-15541237:+MEP12Phalaenopsis equestrisNW_018164444.11554123215541237+6
Chenopodium_quinoa_NW_018744367.1:59842-59847:-MEP12Chenopodium quinoaNW_018744367.15984259847-6
Chenopodium_quinoa_NW_018745000.1:7754516-7754521:-MEP12Chenopodium quinoaNW_018745000.177545167754521-6
Gossypium_arboreum_NC_030664.1:22217427-22217432:-MEP12Gossypium arboreumNC_030664.12221742722217432-6
Hibiscus_syriacus_NW_024063456.1:82476-82481:+MEP12Hibiscus syriacusNW_024063456.18247682481+6
Hibiscus_syriacus_NW_024062689.1:488645-488650:-MEP12Hibiscus syriacusNW_024062689.1488645488650-6
Hibiscus_syriacus_NW_024062924.1:1260400-1260405:-MEP12Hibiscus syriacusNW_024062924.112604001260405-6
Hibiscus_syriacus_NW_024063482.1:2694981-2694986:-MEP12Hibiscus syriacusNW_024063482.126949812694986-6
Prosopis_alba_NW_021636998.1:31026-31031:-MEP12Prosopis albaNW_021636998.13102631031-6
Quercus_suber_NW_019824910.1:150591-150596:+MEP12Quercus suberNW_019824910.1150591150596+6
Quercus_suber_NW_019815013.1:688187-688192:-MEP12Quercus suberNW_019815013.1688187688192-6
Arachis_duranensis_NC_029777.2:7106556-7106561:-MEP12Arachis duranensisNC_029777.271065567106561-6
Arachis_ipaensis_NC_029790.2:9503837-9503842:+MEP12Arachis ipaensisNC_029790.295038379503842+6
Asparagus_officinalis_NC_033801.1:123742398-123742403:-MEP12Asparagus officinalisNC_033801.1123742398123742403-6
Brassica_napus_NC_027765.2:36902870-36902875:-MEP12Brassica napusNC_027765.23690287036902875-6
Coffea_arabica_NC_039912.1:41079327-41079332:-MEP12Coffea arabicaNC_039912.14107932741079332-6
Coffea_arabica_NC_039913.1:35815615-35815620:-MEP12Coffea arabicaNC_039913.13581561535815620-6
Coffea_arabica_NC_039913.1:35983552-35983557:-MEP12Coffea arabicaNC_039913.13598355235983557-6
Coffea_eugenioides_NC_040042.1:43373915-43373920:-MEP12Coffea eugenioidesNC_040042.14337391543373920-6
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037529.1:118021-118026:+MEP12Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037529.1118021118026+6
Dendrobium_catenatum_NW_021319083.1:3337789-3337794:-MEP12Dendrobium catenatumNW_021319083.133377893337794-6
Glycine_soja_NC_041004.1:44286541-44286546:+MEP12Glycine sojaNC_041004.14428654144286546+6
Glycine_soja_NC_041020.1:47074437-47074442:+MEP12Glycine sojaNC_041020.14707443747074442+6
Spinacia_oleracea_NW_018931536.1:444406-444411:-MEP12Spinacia oleraceaNW_018931536.1444406444411-6
Actinidia_rufa_BJWL01000028.1:204581-204586:+MEP12Actinidia rufaBJWL01000028.1204581204586+6
Actinidia_rufa_BJWL01000017.1:919614-919619:-MEP12Actinidia rufaBJWL01000017.1919614919619-6
Benincasa_hispida_NC_052359.1:37665876-37665881:+MEP12Benincasa hispidaNC_052359.13766587637665881+6
Cajanus_cajan_NW_017984172.1:405306-405311:+MEP12Cajanus cajanNW_017984172.1405306405311+6
Cannabis_sativa_NC_044370.1:9377798-9377803:-MEP12Cannabis sativaNC_044370.193777989377803-6
Cicer_arietinum_NC_021162.1:36945491-36945496:+MEP12Cicer arietinumNC_021162.13694549136945496+6
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000001.1:7978742-7978747:-MEP12Cinnamomum micranthumQPKB01000001.179787427978747-6
Coffea_canephora_HG974435.1:27729692-27729697:-MEP12Coffea canephoraHG974435.12772969227729697-6
Durio_zibethinus_NW_019167893.1:4562576-4562581:-MEP12Durio zibethinusNW_019167893.145625764562581-6
Durio_zibethinus_NW_019167938.1:3874426-3874431:-MEP12Durio zibethinusNW_019167938.138744263874431-6
Eucalyptus_grandis_NC_052622.1:49141414-49141419:+MEP12Eucalyptus grandisNC_052622.14914141449141419+6
Glycine_max_NC_016090.3:42420938-42420943:+MEP12Glycine maxNC_016090.34242093842420943+6
Glycine_max_NC_038255.1:47071981-47071986:+MEP12Glycine maxNC_038255.14707198147071986+6
Gossypium_raimondii_NC_026929.1:19693790-19693795:-MEP12Gossypium raimondiiNC_026929.11969379019693795-6
Ipomoea_nil_NW_017618788.1:156880-156885:+MEP12Ipomoea nilNW_017618788.1156880156885+6
Lupinus_angustifolius_NC_032024.1:16430276-16430281:+MEP12Lupinus angustifoliusNC_032024.11643027616430281+6
Nelumbo_nucifera_NW_010729124.1:664311-664316:-MEP12Nelumbo nuciferaNW_010729124.1664311664316-6
Phoenix_dactylifera_NC_052394.1:14908554-14908559:+MEP12Phoenix dactyliferaNC_052394.11490855414908559+6
Pistacia_vera_NW_022196064.1:105461-105466:+MEP12Pistacia veraNW_022196064.1105461105466+6
Populus_euphratica_NW_011499951.1:805924-805929:+MEP12Populus euphraticaNW_011499951.1805924805929+6
Populus_euphratica_NW_011499846.1:7376840-7376845:-MEP12Populus euphraticaNW_011499846.173768407376845-6
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988138.1:809024-809029:-MEP12Pyrus x bretschneideriNW_008988138.1809024809029-6
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988184.1:286625-286630:-MEP12Pyrus x bretschneideriNW_008988184.1286625286630-6
Quercus_lobata_NC_044915.1:19002948-19002953:-MEP12Quercus lobataNC_044915.11900294819002953-6
Solanum_lycopersicum_NC_015445.3:62502722-62502727:-MEP12Solanum lycopersicumNC_015445.36250272262502727-6
Solanum_pennellii_NC_028644.1:66822724-66822729:-MEP12Solanum pennelliiNC_028644.16682272466822729-6
Solanum_tuberosum_NW_006239126.1:478590-478595:-MEP12Solanum tuberosumNW_006239126.1478590478595-6
Syzygium_oleosum_NW_022076593.1:495056-495061:-MEP12Syzygium oleosumNW_022076593.1495056495061-6
Abrus_precatorius_NW_020874373.1:4623310-4623315:+MEP12Abrus precatoriusNW_020874373.146233104623315+6
Ananas_comosus_NC_033634.1:2830691-2830696:-MEP12Ananas comosusNC_033634.128306912830696-6
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025813.2:16314114-16314119:-MEP12Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025813.21631411416314119-6
Brassica_rapa_NC_024803.2:37973824-37973829:-MEP12Brassica rapaNC_024803.23797382437973829-6
Citrus_sinensis_NW_006257087.1:453163-453168:+MEP12Citrus sinensisNW_006257087.1453163453168+6
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030381.1:33695384-33695389:-MEP12Daucus carota subsp.  sativusNC_030381.13369538433695389-6
Erythranthe_guttata_NW_012193411.1:284805-284810:+MEP12Erythranthe guttataNW_012193411.1284805284810+6
Ipomoea_triloba_NC_044928.1:9574319-9574324:+MEP12Ipomoea trilobaNC_044928.195743199574324+6
Jatropha_curcas_NW_023591416.1:1925480-1925485:+MEP12Jatropha curcasNW_023591416.119254801925485+6
Juglans_regia_NC_049908.1:9984218-9984223:+MEP12Juglans regiaNC_049908.199842189984223+6
Juglans_regia_NC_049911.1:25912027-25912032:+MEP12Juglans regiaNC_049911.12591202725912032+6
Macleaya_cordata_MVGT01000481.1:1598413-1598418:-MEP12Macleaya cordataMVGT01000481.115984131598418-6
Malus_domestica_NC_041797.1:36460000-36460005:+MEP12Malus domesticaNC_041797.13646000036460005+6
Malus_domestica_NC_041805.1:33885600-33885605:+MEP12Malus domesticaNC_041805.13388560033885605+6
Manihot_esculenta_NC_035161.1:31415246-31415251:+MEP12Manihot esculentaNC_035161.13141524631415251+6
Medicago_truncatula_NC_053048.1:52006484-52006489:+MEP12Medicago truncatulaNC_053048.15200648452006489+6
Morus_notabilis_NW_010360247.1:19850-19855:+MEP12Morus notabilisNW_010360247.11985019855+6
Nymphaea_colorata_NC_045150.1:5149500-5149505:+MEP12Nymphaea colorataNC_045150.151495005149505+6
Phaseolus_vulgaris_NC_023759.1:47789742-47789747:+MEP12Phaseolus vulgarisNC_023759.14778974247789747+6
Populus_alba_NW_023271198.1:2619332-2619337:+MEP12Populus albaNW_023271198.126193322619337+6
Populus_alba_NW_023271357.1:1485817-1485822:+MEP12Populus albaNW_023271357.114858171485822+6
Populus_trichocarpa_NC_037286.1:15387928-15387933:-MEP12Populus trichocarpaNC_037286.11538792815387933-6
Populus_trichocarpa_NC_037298.1:9181819-9181824:-MEP12Populus trichocarpaNC_037298.191818199181824-6
Prunus_avium_NW_018921645.1:189512-189517:+MEP12Prunus aviumNW_018921645.1189512189517+6
Rhodamnia_argentea_NW_022060837.1:801974-801979:-MEP12Rhodamnia argenteaNW_022060837.1801974801979-6
Rhododendron_simsii_CM024965.1:283296-283301:-MEP12Rhododendron simsiiCM024965.1283296283301-6
Ricinus_communis_NW_002994294.1:1227031-1227036:-MEP12Ricinus communisNW_002994294.112270311227036-6
Rosa_chinensis_NC_037090.1:34348654-34348659:-MEP12Rosa chinensisNC_037090.13434865434348659-6
Setaria_italica_NC_028454.1:5294368-5294373:+MEP12Setaria italicaNC_028454.152943685294373+6
Setaria_viridis_NC_048267.1:4671265-4671270:+MEP12Setaria viridisNC_048267.146712654671270+6
Tripterygium_wilfordii_NC_052237.1:663895-663900:+MEP12Tripterygium wilfordiiNC_052237.1663895663900+6
Tripterygium_wilfordii_NC_052253.1:303095-303100:+MEP12Tripterygium wilfordiiNC_052253.1303095303100+6
Vigna_angularis_NC_030639.1:37604402-37604407:-MEP12Vigna angularisNC_030639.13760440237604407-6
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028353.1:8064497-8064502:+MEP12Vigna radiata var.  radiataNC_028353.180644978064502+6
Vigna_unguiculata_NC_040279.1:37551966-37551971:+MEP12Vigna unguiculataNC_040279.13755196637551971+6
Vitis_riparia_NC_048437.1:26178649-26178654:-MEP12Vitis ripariaNC_048437.12617864926178654-6
Vitis_vinifera_NC_012013.3:4221812-4221817:+MEP12Vitis viniferaNC_012013.342218124221817+6
Ziziphus_jujuba_NC_029682.1:24902466-24902471:+MEP12Ziziphus jujubaNC_029682.12490246624902471+6
Aquilegia_coerulea_KZ305046.1:2717910-2717915:-MEP12Aquilegia coeruleaKZ305046.127179102717915-6
Arabidopsis_thaliana_NC_003074.8:23064414-23064419:-MEP12Arabidopsis thalianaNC_003074.82306441423064419-6
Brachypodium_distachyon_NC_016132.3:7242443-7242448:-MEP12Brachypodium distachyonNC_016132.372424437242448-6
Citrus_clementina_NW_006262339.1:46703093-46703098:+MEP12Citrus clementinaNW_006262339.14670309346703098+6
Cucumis_sativus_NC_026657.2:22707390-22707395:-MEP12Cucumis sativusNC_026657.22270739022707395-6
Cucurbita_maxima_NW_019272023.1:4890405-4890410:+MEP12Cucurbita maximaNW_019272023.148904054890410+6
Cucurbita_moschata_NW_019268520.1:2032243-2032248:-MEP12Cucurbita moschataNW_019268520.120322432032248-6
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036640.1:5049643-5049648:+MEP12Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036640.150496435049648+6
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020491.1:20498715-20498720:+MEP12Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020491.12049871520498720+6
Herrania_umbratica_NW_018397258.1:4593483-4593488:-MEP12Herrania umbraticaNW_018397258.145934834593488-6
Momordica_charantia_NW_019104684.1:77882-77887:+MEP12Momordica charantiaNW_019104684.17788277887+6
Oryza_brachyantha_NC_023163.1:6647496-6647501:-MEP12Oryza brachyanthaNC_023163.166474966647501-6
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029256.1:8359119-8359124:-MEP12Oryza sativa Japonica GroupNC_029256.183591198359124-6
Prunus_mume_NC_024129.1:545115-545120:-MEP12Prunus mumeNC_024129.1545115545120-6
Prunus_persica_NC_034011.1:505288-505293:-MEP12Prunus persicaNC_034011.1505288505293-6
Sesamum_indicum_NC_026150.1:10856736-10856741:+MEP12Sesamum indicumNC_026150.11085673610856741+6
Theobroma_cacao_NC_030850.1:32133411-32133416:+MEP12Theobroma cacaoNC_030850.13213341132133416+6