
Microexon ID | Cr_16:2454970-2454983:- |
Species | Chlamydomonas reinhardtii | Coordinates | 16:2454970..2454983 |
Microexon Cluster ID | Unclassified |
Size | 14 |
Cr_16:2454970-2454983:- does not have available information here.
Transcript ID | PNW71592 |
Protein ID | PNW71592 |
Gene ID | CHLRE_16g660601v5 |
Gene Name | NA |
Pfam domain motif | Unknown |
Motif E-value | NA |
Motif start | NA |
Motif end | NA |
Protein seq | >PNW71592 MVPSSRRSCVTLVLLLVAFTTTSAQQSAEGSNGQACKKRGEASFPSPPSPEPPSPPPPSPRPPSPAPGVPPPSPAPPSPA PGVPPPSPEPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAP PSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPP SPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGMPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPG VPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPS PAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPVPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGDPPPSP VPPSPSPGSPPPSPAPPSPTPGVPPPSPAPPSPAPGMPPPSPVPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVP PPSPVPPSPAPESPPPSPVPPSPSPESPPPSPVPPSPAPGVPPPSPAPPSPAPGVPPPSPGPPSPAPGVPPPSPAPPSPS PGSPPPSPVPPSPTPGAPPPSPAPPSPAPASPPPSPAPPSPSPGSPPPSPAPPSPSPGSPPPSPAPPSPSPGSPPPSPAP PSPSPGSPPPSPAPPSPFPGSPPPSPAPPSPAPPSPAPPSPAPGSPPPSPAPPSPAPPSPSPGSPPPSPAPPSPTPRSPP PSPAPPSPSPGSPPPSPAPPSPSPGSPPPSPAPPSPSPGSPPPSPAPPSPSPGSPPPSPAPPSPSPGSPPPSPAPPSPAP PSPAPPSPAPGSPPPSPAPPSPAPPSPAPPSPSPGSPPPSPAPPSPAPRSPPPSPAPPSPSPGSPPPSPAPPSPSPGSPP PSPAPPSPAPRSPPPSPAPPSPRPPSPRPPVPTPPSPIPPSPAPPAPGLNLLASEEYQYNCLSIALPVASPSFVANSIYT ENCATVPEDKYMQLQPVGVDNLYVLRQDSDTSRCMAATNTTPTTFTPQVLPCDPASDGQKFFINRTTGGAWTLSPRARGS YVLAAADYSRASNTTLSALDTFTSIGFRWAFKLPFTPTNSPVCARPEAWCSSTSATMYGPIDCDGDGILDWACRRLRTDG TEQRWALRSAEDCNFQGILASGAAFLNGGSGVADSVCPAAFSTTPPQPPSPRPPSPRPPSPAPPSPKPPSPSPPSPRPPA PKPPSPAPPSPVPPSPAPPSPVPPAPPAPLPPSPAPPTPQPPSPQPPSPVPPSPSPPSPAASPPSPPTGFQVIGIPANNK CVRFGTTAFQADCSFIFATMYALLQPVGANNLHVIRTNVDTTQCVTAVEVATDVFRPQIQACVAGADNQQFFVNQTQNGL WTLSPKIRKTRCWQGSTINSDIYLDDCTGTNAAEQIGLTLPFVPPQARVCSLPARWCALASQQLIGPLDCNGDGVLDWAC VSYSTGQRWLLQSTADPTTTCSATSATALGAATINDFSTPTGGTGLPVSACPVAFNSPPPSPPLPPSPAPKPFPPPSPAP PKPPSPAPPSPFDGYSPVCYDNMDAVGLEMANLTASSESTCRELCKQDSRCEYYVYCATTSRCRLRQDIASPGGSASVIP AGMYFNGYISYGDIYTRGCRTCLLRTTNFGFSCSLESTVWSDATNSSGRVLSRVPGVSTYAACLALCDENPACMFAVYDA PPAAGTTCTLATAWLDGNARYGGSDPSISCFKANYGPAPPRPPPPSPPVPPSPSPRPPSPQPPSPRPPSPSPPLPPRPPS PPPPPVGNACLQDADLRGYQLDFAIRTADTCRTACIANAGCTYYVTKPDGYCSLRYRFLEPSGSPEAGTVAVGNTQPFQT NVTSCFVRSTVGRYLCSIPGTSNAVPLNTVTSLTGYTYNNCVTVCEGDPQGCRAFTWDEQVVGSGLGECSPARSWDYSSL YLSVASGGDDTTCVKVYN* |
CDS seq | >PNW71592 ATGGTTCCGTCGTCCCGAAGGTCATGCGTAACGCTGGTGCTGCTGCTAGTCGCGTTCACCACTACTTCTGCGCAGCAGTC AGCGGAGGGCAGCAACGGACAAGCCTGCAAAAAACGAGGGGAGGCATCATTTCCGAGCCCACCATCCCCGGAGCCACCTA GTCCCCCGCCGCCATCTCCTAGGCCGCCAAGCCCTGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCGCCTGCTCCTCCCAGCCCAGCA CCTGGCGTGCCTCCTCCCTCGCCTGAGCCTCCCAGCCCCGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCGCCTGCTCCTCCCAGCCC CGCACCTGGCGTTCCCCCTCCCTCGCCTGCGCCTCCCAGCCCCGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCGCCTGCTCCTCCCA GCCCAGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCGCCTGCGCCTCCCAGCCCCGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCGCCTGCGCCT CCCAGCCCCGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCGCCTGCTCCTCCCAGCCCCGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCGCCTGC TCCTCCCAGCCCCGCACCTGGCGTGCCACCTCCCTCGCCTGCTCCTCCCAGCCCAGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCGC CTGCTCCTCCCAGCCCCGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCTCCTGCGCCTCCCAGCCCAGCACCTGGCGTGCCTCCTCCC TCGCCTGCGCCTCCCAGCCCCGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCTCCTGCTCCTCCCAGCCCCGCACCTGGCATGCCACC TCCCTCGCCTGCTCCTCCCAGCCCAGCACCTGGCGTGCCTCCTCCCTCGCCTGCTCCTCCCAGCCCCGCACCTGGCGTGC CTCCTCCCTCTCCTGCGCCTCCCAGCCCAGCACCTGGCGTTCCCCCTCCCTCGCCTGCGCCTCCCAGCCCCGCACCTGGC 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CCCAAGCCGCCCTCACCGGCGCCGCCATCTCCAGTCCCGCCAAGCCCTGCGCCTCCCTCGCCGGTGCCCCCCGCGCCCCC CGCGCCCCTGCCACCCTCGCCGGCACCCCCAACGCCCCAGCCTCCCTCGCCGCAGCCACCTTCCCCCGTGCCGCCTTCGC CCTCGCCGCCCTCACCAGCGGCATCTCCGCCATCGCCTCCAACAGGCTTTCAAGTCATCGGCATTCCCGCAAACAACAAA TGTGTGCGCTTCGGCACCACAGCTTTCCAGGCAGACTGCTCCTTCATCTTCGCGACTATGTACGCGCTGCTGCAGCCCGT GGGCGCCAACAACCTCCACGTCATTCGCACCAATGTGGACACAACCCAGTGCGTCACTGCGGTGGAGGTCGCGACGGACG TTTTCAGGCCGCAGATTCAGGCCTGTGTGGCGGGAGCCGACAACCAGCAGTTCTTCGTGAACCAGACGCAGAACGGGTTG TGGACTCTGAGCCCCAAGATCCGCAAGACGCGTTGTTGGCAGGGGTCAACCATCAACAGTGACATTTACTTGGACGACTG CACGGGCACAAACGCCGCCGAGCAGATTGGGCTGACGCTGCCCTTCGTGCCGCCTCAGGCCCGGGTGTGCTCGCTGCCGG CGCGGTGGTGCGCACTGGCCTCGCAACAACTCATCGGACCCCTGGATTGCAACGGAGATGGCGTGCTGGACTGGGCTTGT GTGTCGTACAGCACGGGTCAGCGCTGGCTGCTGCAGTCCACAGCGGACCCCACCACCACCTGCAGCGCCACCTCAGCCAC CGCCCTGGGCGCCGCTACCATTAACGACTTCTCCACGCCCACCGGAGGCACCGGTCTGCCCGTGTCAGCCTGCCCCGTGG CCTTCAACTCCCCGCCGCCCTCACCACCTTTACCGCCCTCGCCAGCGCCCAAGCCCTTCCCGCCACCCAGCCCAGCGCCA 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AATGTCACTTCCTGCTTCGTTCGTAGCACTGTTGGTCGCTACCTGTGCTCCATTCCCGGCACCAGCAACGCCGTGCCCCT GAACACGGTCACGTCCCTCACGGGCTACACGTACAACAATTGTGTCACCGTCTGCGAAGGTGATCCGCAGGGATGCAGGG CCTTCACGTGGGATGAGCAGGTGGTCGGCAGCGGCCTGGGCGAGTGCTCACCGGCGCGGTCGTGGGACTACTCAAGTCTG TACTTGTCGGTGGCGTCAGGCGGCGATGACACCACATGCGTCAAGGTTTACAACTAA |
Microexon DNA seq | GCGACGGCATTTTG |
Microexon Amino Acid seq | GDGIL |
Microexon-tag DNA Seq | TGCAGCAGTACGTCTGCAACCATGTACGGCCCCATCGACTGCGATGGCGACGGCATTTTGGACTGGGCCTGCCGGCGGCTGCGTACGGACGGCACCGAGCAGCGCTGG |
Microexon-tag Amino Acid seq | CSSTSATMYGPIDCDGDGILDWACRRLRTDGTEQRW |
Transcript ID | Cr.5579.1 |
Gene ID | Cr.5579 |
Gene Name | NA |
Pfam domain motif | Unknown |
Motif E-value | NA |
Motif start | NA |
Motif end | NA |
Protein seq | >Cr.5579.1 MLSGLNLLASEEYQYNCLSIALPVASPSFVANSIYTENCATVPEDKYMQLQPVGVDNLYVLRQDSDTSRCMAATNTTPTT FTPQVLPCDPASDGQKFFINRTTGGAWTLSPRARGSYVLAAADYSRASNTTLSALDTFTSIGFRWAFKLPFTPTNSPVCA RPEAWCSSTSATMYGPIDCDGDGILDWACRRLRTDGTEQRWALRSAEDCNFQGILASGAAFLNGGSGVADSVCPAAFSTT PPQPPSPRPPSPRPPSPAPPSPKPPSPSPPSPRPPAPKPPSPAPPSPVPPSPAPPSPVPPAPPAPLPPSPAPPTPQPPSP QPPSPVPPSPSPPSPAASPPSPPTGFQVIGIPANNKCVRFGTTAFQADCSFIFATMYALLQPVGANNLHVIRTNVDTTQC VTAVEVATDVFRPQIQACVAGADNQQFFVNQTQNGLWTLSPKIRKTRCWQGSTINSDIYLDDCTGTNAAEQIGLTLPFVP PQARVCSLPARWCALASQQLIGPLDCNGDGVLDWACVSYSTGQRWLLQSTADPTTTCSATSATALGAATINDFSTPTGGT GLPVSACPVAFNSPPPSPPLPPSPAPKPFPPPSPAPPKPPSPAPPSPFDGYSPVCYDNMDAVGLEMANLTASSESTCREL CKQDSRCEYYVYCATTSRCRLRQDIASPGGSASVIPAGMYFNGYISYGDIYTRGCRTCLLRTTNFGFSCSLESTVWSDAT NSSGRVLSRVPGVSTYAACLALCDENPACMFAVYDAPPAAGTTCTLATAWLDGNARYGGSDPSISCFKANYGPAPPRPPP PSPPVPPSPSPRPPSPQPPSPRPPSPSPPLPPRPPSPPPPPVGNACLQDADLRGYQLDFAIRTADTCRTACIANAGCTYY VTKPDGYCSLRYRFLEPSGSPEAGTVAVGNTQPFQTNVTSCFVRSTVGRYLCSIPGTSNAVPLNTVTSLTGYTYNNCVTV CEGDPQGCRAFTWDEQVVGSGLGECSPARSWDYSSLYLSVASGGDDTTCVKVYN* |
CDS seq | >Cr.5579.1 ATGCTTTCAGGGCTGAACCTTTTGGCCTCCGAAGAGTACCAATACAACTGTTTGTCGATAGCGCTCCCGGTGGCATCGCC CAGCTTCGTTGCGAACAGCATCTACACTGAGAACTGCGCTACTGTTCCGGAGGACAAGTACATGCAGCTGCAGCCGGTCG GCGTGGACAACCTTTACGTGCTACGGCAGGACAGCGACACGAGCCGATGCATGGCGGCGACCAACACCACGCCAACCACC TTCACGCCCCAGGTGCTCCCCTGTGACCCCGCCTCCGATGGCCAGAAGTTCTTCATCAACCGTACGACCGGAGGGGCCTG GACGCTGAGCCCCCGTGCACGGGGCTCCTATGTGCTGGCGGCTGCAGATTACAGCCGCGCCAGCAATACTACGTTGTCGG CCCTAGACACGTTCACTTCCATAGGCTTTCGTTGGGCCTTCAAGCTGCCGTTCACGCCAACCAACTCTCCAGTGTGCGCG CGACCCGAGGCGTGGTGCAGCAGTACGTCTGCAACCATGTACGGCCCCATCGACTGCGATGGCGACGGCATTTTGGACTG GGCCTGCCGGCGGCTGCGTACGGACGGCACCGAGCAGCGCTGGGCGTTGCGGTCTGCAGAGGACTGTAACTTCCAGGGCA TTCTCGCCTCAGGTGCCGCTTTCTTGAATGGCGGAAGTGGTGTCGCGGACAGCGTATGCCCGGCCGCGTTCTCCACCACG CCGCCGCAACCGCCGTCCCCGCGGCCTCCGTCTCCGCGACCTCCGTCCCCCGCACCTCCCTCGCCCAAGCCGCCCTCGCC ATCCCCGCCCTCACCACGGCCGCCCGCGCCCAAGCCGCCCTCACCGGCGCCGCCATCTCCAGTCCCGCCAAGCCCTGCGC CTCCCTCGCCGGTGCCCCCCGCGCCCCCCGCGCCCCTGCCACCCTCGCCGGCACCCCCAACGCCCCAGCCTCCCTCGCCG CAGCCACCTTCCCCCGTGCCGCCTTCGCCCTCGCCGCCCTCACCAGCGGCATCTCCGCCATCGCCTCCAACAGGCTTTCA AGTCATCGGCATTCCCGCAAACAACAAATGTGTGCGCTTCGGCACCACAGCTTTCCAGGCAGACTGCTCCTTCATCTTCG CGACTATGTACGCGCTGCTGCAGCCCGTGGGCGCCAACAACCTCCACGTCATTCGCACCAATGTGGACACAACCCAGTGC GTCACTGCGGTGGAGGTCGCGACGGACGTTTTCAGGCCGCAGATTCAGGCCTGTGTGGCGGGAGCCGACAACCAGCAGTT CTTCGTGAACCAGACGCAGAACGGGTTGTGGACTCTGAGCCCCAAGATCCGCAAGACGCGTTGTTGGCAGGGGTCAACCA TCAACAGTGACATTTACTTGGACGACTGCACGGGCACAAACGCCGCCGAGCAGATTGGGCTGACGCTGCCCTTCGTGCCG CCTCAGGCCCGGGTGTGCTCGCTGCCGGCGCGGTGGTGCGCACTGGCCTCGCAACAACTCATCGGACCCCTGGATTGCAA CGGAGATGGCGTGCTGGACTGGGCTTGTGTGTCGTACAGCACGGGTCAGCGCTGGCTGCTGCAGTCCACAGCGGACCCCA CCACCACCTGCAGCGCCACCTCAGCCACCGCCCTGGGCGCCGCTACCATTAACGACTTCTCCACGCCCACCGGAGGCACC GGTCTGCCCGTGTCAGCCTGCCCCGTGGCCTTCAACTCCCCGCCGCCCTCACCACCTTTACCGCCCTCGCCAGCGCCCAA GCCCTTCCCGCCACCCAGCCCAGCGCCACCCAAGCCGCCGTCGCCTGCTCCTCCCTCGCCCTTCGACGGCTACAGTCCGG TGTGTTATGATAACATGGACGCGGTCGGGCTGGAGATGGCAAACCTGACCGCGTCATCCGAGTCCACGTGCCGCGAGCTG TGCAAGCAGGACTCGCGCTGCGAATACTACGTCTACTGCGCAACCACAAGCCGTTGCAGGCTTCGTCAGGACATTGCGTC GCCCGGCGGCAGTGCCTCGGTCATACCTGCCGGCATGTATTTCAATGGATACATATCGTATGGCGACATATACACCCGGG GATGTCGCACGTGCCTGCTGCGCACCACGAACTTTGGATTCTCATGCTCACTTGAAAGCACGGTCTGGAGCGATGCTACC AACTCCTCCGGCCGGGTTCTGTCTAGAGTGCCCGGCGTGTCCACCTACGCGGCCTGCCTGGCGCTATGTGACGAAAACCC CGCCTGCATGTTCGCGGTGTACGATGCGCCGCCCGCCGCCGGCACCACGTGCACACTGGCTACTGCCTGGCTGGACGGGA ACGCCCGATACGGCGGCAGCGACCCCAGTATCTCCTGCTTCAAGGCGAACTATGGCCCCGCGCCGCCCCGGCCGCCGCCA CCGTCTCCCCCCGTGCCTCCCTCGCCTAGTCCGAGGCCGCCGTCGCCACAGCCGCCGAGTCCTAGGCCACCGTCGCCGTC GCCACCACTGCCACCGCGTCCGCCATCGCCGCCGCCGCCTCCTGTTGGCAACGCCTGCCTGCAAGACGCCGACCTCCGCG GCTACCAACTGGACTTCGCCATCAGGACTGCGGACACCTGCAGGACGGCATGCATTGCCAATGCGGGCTGCACGTACTAC GTCACAAAACCGGATGGCTACTGCTCTCTCCGCTACCGCTTCCTCGAGCCCTCCGGCAGCCCTGAGGCGGGCACGGTGGC GGTGGGAAACACGCAGCCTTTCCAAACCAATGTCACTTCCTGCTTCGTTCGTAGCACTGTTGGTCGCTACCTGTGCTCCA TTCCCGGCACCAGCAACGCCGTGCCCCTGAACACGGTCACGTCCCTCACGGGCTACACGTACAACAATTGTGTCACCGTC TGCGAAGGTGATCCGCAGGGATGCAGGGCCTTCACGTGGGATGAGCAGGTGGTCGGCAGCGGCCTGGGCGAGTGCTCACC GGCGCGGTCGTGGGACTACTCAAGTCTGTACTTGTCGGTGGCGTCAGGCGGCGATGACACCACATGCGTCAAGGTTTACA ACTAA |