
Microexon ID | Gm_13:31591358-31591372:+ |
Species | Glycine max | Coordinates | 13:31591358..31591372 |
Microexon Cluster ID | MEP45 |
Size | 15 |
Phase | 2 |
Pfam Domain Motif | RPE65 |
Structure of Microexon-tag (flanking exon, microexon, flanking exon sizes) | 47,15,46 |
Microexon location in the Microexon-tag | 2 |
Microexon-tag DNA Seq | AGRGTTGGKCCTAAYCCMAAGTTTGYYCCWGTKGCTGGATAYCAYTGGTTTGATGGAGATGGMATGATTCATGSYWTGCGYATYAAAGATGGAAAAGCWACWTATGTY |
Logo of Microexon-tag DNA Seq | ![]() |
Alignment of exons | ![]() |
Microexon DNA seq | GTTTGATGGAGATGG |
Microexon Amino Acid seq | WFDGDG |
Microexon-tag DNA Seq | AGAGTTGGGCCTAATCCGAAGTTTGCTCCTGTAGCTGGATATCACTGGTTTGATGGAGATGGAATGATTCATGGCTTGCGCATCAAAGATGGAAAAGCTACATATGTT |
Microexon-tag Amino Acid Seq | RVGPNPKFAPVAGYHWFDGDGMIHGLRIKDGKATYV |
Microexon-tag spanning region | 31591067-31592243 |
Microexon-tag prediction score | 0.9899 |
Overlapped with the annotated transcript (%) | 100 |
New Transcript ID | KRH20813x |
Reference Transcript ID | KRH20813 |
Gene ID | GLYMA_13G202200 |
Gene Name | NA |
Transcript ID | KRH20813 |
Protein ID | KRH20813 |
Gene ID | GLYMA_13G202200 |
Gene Name | NA |
Pfam domain motif | RPE65 |
Motif E-value | 1.1e-131 |
Motif start | 55 |
Motif end | 537 |
Protein seq | >KRH20813 MGDDGKKISGEGGLVKVEPKPSNGFTSKVVDLLEKLVVKFLYDSSLPHHYLTGNFAPVSETPPTKDLPVKGYLPDCLNGE FVRVGPNPKFAPVAGYHWFDGDGMIHGLRIKDGKATYVSRFVRTSRLKQEEYFGGSKFMKIGDLKGLFGLLMVNIHMLRT KWKVLDASYGTGTESALHANTALVYHHGKLLALSEADKPYAIKVFEDGDLQTLGMLDYDKRLGHSFTAHPKVDPFTGEMF TFGYAHTPPYITYRVISKDGYMHDPVPITVSDPIMMHDFAITENYAIFLDLPLIFRPKEMVKNKTLIFSFDSTKKARFGV LPRYAKDEKLIRWFELPNCFIFHNANAWEEEDEVVLITCRLQNPNLDLVGGTAKEKLENFSNELYEMRFNMKTGEASQKK LSASAVDFPRVNESYTGRKQRYVYGTTLDSIAKVTGIIKFDLHAEPDNGKTKLEVGGNVQGLYDLGPGKYGSEAVYVPRV PGTDSEEDDGYLICFVHDENTGKSFVHVINAKTMSADPVAVVELPHRVPYGFHAFFVTEEQLQEQGKL* |
CDS seq | >KRH20813 ATGGGGGATGATGGAAAGAAGATTAGTGGAGAGGGGGGGTTAGTGAAGGTTGAGCCAAAACCCAGCAATGGTTTCACCTC AAAAGTGGTTGATTTGTTGGAGAAATTGGTGGTGAAGTTCTTGTATGATTCTTCACTGCCCCATCACTACCTCACTGGTA ATTTTGCTCCCGTGAGTGAGACCCCTCCAACCAAGGACCTTCCTGTCAAAGGGTACCTTCCGGATTGCTTGAATGGGGAG TTTGTCAGAGTTGGGCCTAATCCGAAGTTTGCTCCTGTAGCTGGATATCACTGGTTTGATGGAGATGGAATGATTCATGG CTTGCGCATCAAAGATGGAAAAGCTACATATGTTTCCCGTTTTGTGAGAACTTCTCGCCTTAAACAAGAAGAATACTTTG GAGGCTCCAAATTTATGAAGATTGGAGATCTCAAAGGTCTATTCGGACTTTTAATGGTTAACATACATATGCTGAGAACT AAATGGAAAGTGCTGGATGCTTCTTATGGAACTGGAACAGAGAGTGCATTACATGCTAATACTGCTCTCGTATATCACCA TGGGAAACTTCTAGCACTCTCAGAAGCAGATAAACCCTATGCTATTAAAGTTTTTGAAGATGGTGATTTGCAGACACTTG GCATGCTAGATTATGACAAGAGATTGGGCCACTCCTTCACTGCTCATCCAAAAGTTGACCCATTTACTGGGGAGATGTTT ACATTTGGCTATGCGCATACACCACCATATATCACATACAGAGTAATTTCAAAGGATGGTTATATGCATGATCCTGTACC CATAACAGTATCAGATCCCATCATGATGCACGACTTTGCCATCACAGAGAATTATGCAATATTTTTGGATCTTCCTTTGA TTTTTAGGCCAAAGGAAATGGTGAAGAATAAGACACTGATATTCTCATTTGATTCAACCAAGAAAGCTCGTTTTGGTGTG CTACCTCGGTATGCTAAGGATGAAAAGCTTATTAGATGGTTTGAGTTACCCAACTGCTTCATATTCCACAATGCCAATGC TTGGGAGGAGGAAGATGAAGTTGTTCTGATCACATGCCGCCTTCAGAATCCAAATTTGGATTTGGTCGGTGGGACTGCCA AGGAAAAGCTTGAAAATTTCTCAAATGAGCTGTATGAAATGAGATTTAACATGAAAACGGGTGAAGCTTCTCAAAAGAAA CTATCAGCATCTGCTGTAGATTTTCCTAGGGTGAATGAGAGCTACACTGGAAGGAAGCAGCGATATGTATACGGAACCAC ATTAGACAGCATTGCAAAAGTTACTGGCATTATTAAATTTGATTTGCATGCTGAACCGGATAATGGAAAAACAAAACTTG AAGTAGGAGGAAATGTTCAGGGTCTCTATGACTTGGGACCAGGGAAGTATGGCTCGGAAGCTGTTTATGTCCCTCGTGTC CCTGGTACCGATTCTGAAGAAGATGATGGATACTTGATTTGTTTTGTACACGATGAAAATACCGGAAAATCATTTGTGCA TGTCATCAATGCAAAAACAATGTCAGCAGATCCTGTTGCAGTTGTCGAATTGCCGCATAGAGTTCCATATGGTTTCCATG CCTTCTTTGTGACAGAGGAACAACTGCAAGAGCAGGGTAAACTGTGA |
Microexon DNA seq | GTTTGATGGAGATGG |
Microexon Amino Acid seq | WFDGDG |
Microexon-tag DNA Seq | AGAGTTGGGCCTAATCCGAAGTTTGCTCCTGTAGCTGGATATCACTGGTTTGATGGAGATGGAATGATTCATGGCTTGCGCATCAAAGATGGAAAAGCTACATATGTT |
Microexon-tag Amino Acid seq | RVGPNPKFAPVAGYHWFDGDGMIHGLRIKDGKATYV |
Transcript ID | KRH20814 |
Gene ID | Gm.12466 |
Gene Name | NA |
Pfam domain motif | RPE65 |
Motif E-value | 1.9e-132 |
Motif start | 55 |
Motif end | 532 |
Protein seq | >KRH20814 MGDDGKKISGEGGLVKVEPKPSNGFTSKVVDLLEKLVVKFLYDSSLPHHYLTGNFAPVSETPPTKDLPVKGYLPDCLNGE FVRVGPNPKFAPVAGYHWFDGDGMIHGLRIKDGKATYVSRFVRTSRLKQEEYFGGSKFMKIGDLKGLFGLLMVNIHMLRT KWKVLDASYGTGTANTALVYHHGKLLALSEADKPYAIKVFEDGDLQTLGMLDYDKRLGHSFTAHPKVDPFTGEMFTFGYA HTPPYITYRVISKDGYMHDPVPITVSDPIMMHDFAITENYAIFLDLPLIFRPKEMVKNKTLIFSFDSTKKARFGVLPRYA KDEKLIRWFELPNCFIFHNANAWEEEDEVVLITCRLQNPNLDLVGGTAKEKLENFSNELYEMRFNMKTGEASQKKLSASA VDFPRVNESYTGRKQRYVYGTTLDSIAKVTGIIKFDLHAEPDNGKTKLEVGGNVQGLYDLGPGKYGSEAVYVPRVPGTDS EEDDGYLICFVHDENTGKSFVHVINAKTMSADPVAVVELPHRVPYGFHAFFVTEEQLQEQGKL* |
CDS seq | >KRH20814 ATGGGGGATGATGGAAAGAAGATTAGTGGAGAGGGGGGGTTAGTGAAGGTTGAGCCAAAACCCAGCAATGGTTTCACCTC AAAAGTGGTTGATTTGTTGGAGAAATTGGTGGTGAAGTTCTTGTATGATTCTTCACTGCCCCATCACTACCTCACTGGTA ATTTTGCTCCCGTGAGTGAGACCCCTCCAACCAAGGACCTTCCTGTCAAAGGGTACCTTCCGGATTGCTTGAATGGGGAG TTTGTCAGAGTTGGGCCTAATCCGAAGTTTGCTCCTGTAGCTGGATATCACTGGTTTGATGGAGATGGAATGATTCATGG CTTGCGCATCAAAGATGGAAAAGCTACATATGTTTCCCGTTTTGTGAGAACTTCTCGCCTTAAACAAGAAGAATACTTTG GAGGCTCCAAATTTATGAAGATTGGAGATCTCAAAGGTCTATTCGGACTTTTAATGGTTAACATACATATGCTGAGAACT AAATGGAAAGTGCTGGATGCTTCTTATGGAACTGGAACAGCTAATACTGCTCTCGTATATCACCATGGGAAACTTCTAGC ACTCTCAGAAGCAGATAAACCCTATGCTATTAAAGTTTTTGAAGATGGTGATTTGCAGACACTTGGCATGCTAGATTATG ACAAGAGATTGGGCCACTCCTTCACTGCTCATCCAAAAGTTGACCCATTTACTGGGGAGATGTTTACATTTGGCTATGCG CATACACCACCATATATCACATACAGAGTAATTTCAAAGGATGGTTATATGCATGATCCTGTACCCATAACAGTATCAGA TCCCATCATGATGCACGACTTTGCCATCACAGAGAATTATGCAATATTTTTGGATCTTCCTTTGATTTTTAGGCCAAAGG AAATGGTGAAGAATAAGACACTGATATTCTCATTTGATTCAACCAAGAAAGCTCGTTTTGGTGTGCTACCTCGGTATGCT AAGGATGAAAAGCTTATTAGATGGTTTGAGTTACCCAACTGCTTCATATTCCACAATGCCAATGCTTGGGAGGAGGAAGA TGAAGTTGTTCTGATCACATGCCGCCTTCAGAATCCAAATTTGGATTTGGTCGGTGGGACTGCCAAGGAAAAGCTTGAAA ATTTCTCAAATGAGCTGTATGAAATGAGATTTAACATGAAAACGGGTGAAGCTTCTCAAAAGAAACTATCAGCATCTGCT GTAGATTTTCCTAGGGTGAATGAGAGCTACACTGGAAGGAAGCAGCGATATGTATACGGAACCACATTAGACAGCATTGC AAAAGTTACTGGCATTATTAAATTTGATTTGCATGCTGAACCGGATAATGGAAAAACAAAACTTGAAGTAGGAGGAAATG TTCAGGGTCTCTATGACTTGGGACCAGGGAAGTATGGCTCGGAAGCTGTTTATGTCCCTCGTGTCCCTGGTACCGATTCT GAAGAAGATGATGGATACTTGATTTGTTTTGTACACGATGAAAATACCGGAAAATCATTTGTGCATGTCATCAATGCAAA AACAATGTCAGCAGATCCTGTTGCAGTTGTCGAATTGCCGCATAGAGTTCCATATGGTTTCCATGCCTTCTTTGTGACAG AGGAACAACTGCAAGAGCAGGGTAAACTGTGA |