Cluster ID: MEP40

Size 14
Phase 1
Pfam domain ID SBP_bac_10
Exon block sizes in the Microexon-tag 46,14,48
Microexon location in the Microexon-tag 2
Microexon-tag DNA Seq GTYATCCCMYTRKCMAACTWYTCHRTBGAYRCCRMTTATTTTCCAGTKTCMTTCTTYGAGCTTYTAGGWYTRCTRGVRARCWTGAARGGCATMACATCAGAMWMRGTR
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP40 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
Gm_11:30538431-30538444:+MEP40G. max113053843130538444+14
Gm_18:3757877-3757890:-MEP40G. max1837578773757890-14
Ha_12:39551665-39551678:-MEP40H. annuus123955166539551678-14
Ha_14:114560011-114560024:-MEP40H. annuus14114560011114560024-14
Os_3:1100238-1100251:+MEP40O. sativa311002381100251+14
Ps_NC_039364.1:123153596-123153609:-MEP40P. somniferumNC_039364.1123153596123153609-14
Vv_4:10612113-10612126:+MEP40V. vinifera41061211310612126+14
Zm_1:4418654-4418667:+MEP40Z. mays144186544418667+14
Hv_4H:596045847-596045860:-MEP40H. vulgare4H596045847596045860-14
Pt_17:14039788-14039801:-MEP40P. trichocarpa171403978814039801-14
Sb_1:79289518-79289531:-MEP40S. bicolor17928951879289531-14
Ta_4B:643287105-643287118:-MEP40T. aestivum4B643287105643287118-14
Ta_4D:500019039-500019052:-MEP40T. aestivum4D500019039500019052-14
Ta_7B:24711963-24711976:+MEP40T. aestivum7B2471196324711976+14
Triticum_dicoccoides_NC_041387.1:653609286-653609299:-MEP40Triticum dicoccoidesNC_041387.1653609286653609299-14
Triticum_dicoccoides_NC_041389.1:580410241-580410254:-MEP40Triticum dicoccoidesNC_041389.1580410241580410254-14
Aegilops_tauschii_subsp._tauschii_NW_017920373.1:35174-35187:+MEP40Aegilops tauschii subsp.  tauschiiNW_017920373.13517435187+14
Gnetum_montanum_scaffold1008199:306667-306680:+MEP40Gnetum montanumscaffold1008199306667306680+14
Helianthus_annuus_NC_035439.2:85414011-85414024:+MEP40Helianthus annuusNC_035439.28541401185414024+14
Helianthus_annuus_NC_035446.2:118434187-118434200:+MEP40Helianthus annuusNC_035446.2118434187118434200+14
Lactuca_sativa_NW_019677037.1:2526983-2526996:-MEP40Lactuca sativaNW_019677037.125269832526996-14
Papaver_somniferum_NC_039364.1:123153596-123153609:-MEP40Papaver somniferumNC_039364.1123153596123153609-14
Arachis_hypogaea_NC_037620.1:131291233-131291246:-MEP40Arachis hypogaeaNC_037620.1131291233131291246-14
Arachis_hypogaea_NC_037630.1:133799995-133800008:-MEP40Arachis hypogaeaNC_037630.1133799995133800008-14
Elaeis_guineensis_NW_011551682.1:133153-133166:+MEP40Elaeis guineensisNW_011551682.1133153133166+14
Hevea_brasiliensis_NW_018746475.1:446166-446179:+MEP40Hevea brasiliensisNW_018746475.1446166446179+14
Liriodendron_chinense_PVNU02001726.1:1610997-1611010:-MEP40Liriodendron chinensePVNU02001726.116109971611010-14
Persea_americana_SDSS01000085.1:767489-767502:-MEP40Persea americanaSDSS01000085.1767489767502-14
Zea_mays_NC_050096.1:4371591-4371604:+MEP40Zea maysNC_050096.143715914371604+14
Chenopodium_quinoa_NW_018743574.1:230576-230589:+MEP40Chenopodium quinoaNW_018743574.1230576230589+14
Prosopis_alba_NW_021636873.1:110249-110262:+MEP40Prosopis albaNW_021636873.1110249110262+14
Quercus_suber_NW_019816392.1:377670-377683:+MEP40Quercus suberNW_019816392.1377670377683+14
Arachis_duranensis_NC_029774.2:122749150-122749163:-MEP40Arachis duranensisNC_029774.2122749150122749163-14
Arachis_ipaensis_NC_029787.2:123428363-123428376:-MEP40Arachis ipaensisNC_029787.2123428363123428376-14
Asparagus_officinalis_NC_033797.1:34309273-34309286:+MEP40Asparagus officinalisNC_033797.13430927334309286+14
Coffea_arabica_NC_039910.1:9070871-9070884:-MEP40Coffea arabicaNC_039910.190708719070884-14
Coffea_arabica_NC_039911.1:6250479-6250492:-MEP40Coffea arabicaNC_039911.162504796250492-14
Coffea_eugenioides_NC_040041.1:4870500-4870513:-MEP40Coffea eugenioidesNC_040041.148705004870513-14
Cynara_cardunculus_var._scolymus_NC_037528.1:18045613-18045626:-MEP40Cynara cardunculus var.  scolymusNC_037528.11804561318045626-14
Dendrobium_catenatum_NW_021319099.1:1557373-1557386:-MEP40Dendrobium catenatumNW_021319099.115573731557386-14
Glycine_soja_NC_041014.1:27324340-27324353:+MEP40Glycine sojaNC_041014.12732434027324353+14
Glycine_soja_NC_041019.1:3830203-3830216:-MEP40Glycine sojaNC_041019.138302033830216-14
Spinacia_oleracea_NW_018933443.1:82528-82541:+MEP40Spinacia oleraceaNW_018933443.18252882541+14
Actinidia_rufa_BJWL01000226.1:291021-291034:+MEP40Actinidia rufaBJWL01000226.1291021291034+14
Actinidia_rufa_BJWL01000021.1:2335848-2335861:-MEP40Actinidia rufaBJWL01000021.123358482335861-14
Amborella_trichopoda_NW_006500031.1:566176-566189:-MEP40Amborella trichopodaNW_006500031.1566176566189-14
Benincasa_hispida_NC_052359.1:34721330-34721343:-MEP40Benincasa hispidaNC_052359.13472133034721343-14
Cajanus_cajan_NC_033804.1:4790764-4790777:-MEP40Cajanus cajanNC_033804.147907644790777-14
Cicer_arietinum_NC_021165.1:339176-339189:+MEP40Cicer arietinumNC_021165.1339176339189+14
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000008.1:11080414-11080427:-MEP40Cinnamomum micranthumQPKB01000008.11108041411080427-14
Coffea_canephora_HG974434.1:9465342-9465355:-MEP40Coffea canephoraHG974434.194653429465355-14
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NW_024088403.1:51583-51596:-MEP40Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNW_024088403.15158351596-14
Durio_zibethinus_NW_019167893.1:21821405-21821418:+MEP40Durio zibethinusNW_019167893.12182140521821418+14
Durio_zibethinus_NW_019167893.1:21840244-21840257:+MEP40Durio zibethinusNW_019167893.12184024421840257+14
Eucalyptus_grandis_NC_052617.1:40787709-40787722:+MEP40Eucalyptus grandisNC_052617.14078770940787722+14
Glycine_max_NC_038247.1:30538431-30538444:+MEP40Glycine maxNC_038247.13053843130538444+14
Glycine_max_NC_038254.1:3757877-3757890:-MEP40Glycine maxNC_038254.137578773757890-14
Lupinus_angustifolius_NC_032012.1:3754430-3754443:-MEP40Lupinus angustifoliusNC_032012.137544303754443-14
Nelumbo_nucifera_NW_010729138.1:69068-69081:+MEP40Nelumbo nuciferaNW_010729138.16906869081+14
Phoenix_dactylifera_NC_052402.1:22085139-22085152:-MEP40Phoenix dactyliferaNC_052402.12208513922085152-14
Phoenix_dactylifera_NW_024067891.1:341188-341201:-MEP40Phoenix dactyliferaNW_024067891.1341188341201-14
Phoenix_dactylifera_NW_024068694.1:10759-10772:-MEP40Phoenix dactyliferaNW_024068694.11075910772-14
Piper_nigrum_Pn3:33331246-33331259:+MEP40Piper nigrumPn33333124633331259+14
Piper_nigrum_Pn1:363656-363669:-MEP40Piper nigrumPn1363656363669-14
Piper_nigrum_Pn3:32003915-32003928:-MEP40Piper nigrumPn33200391532003928-14
Piper_nigrum_Pn15:2783839-2783852:-MEP40Piper nigrumPn1527838392783852-14
Pistacia_vera_NW_022196188.1:352571-352584:+MEP40Pistacia veraNW_022196188.1352571352584+14
Pistacia_vera_NW_022196854.1:212345-212358:+MEP40Pistacia veraNW_022196854.1212345212358+14
Populus_euphratica_NW_011499922.1:503558-503571:-MEP40Populus euphraticaNW_011499922.1503558503571-14
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988222.1:416850-416863:+MEP40Pyrus x bretschneideriNW_008988222.1416850416863+14
Quercus_lobata_NC_044905.1:64227812-64227825:-MEP40Quercus lobataNC_044905.16422781264227825-14
Syzygium_oleosum_NW_022076777.1:377865-377878:-MEP40Syzygium oleosumNW_022076777.1377865377878-14
Abrus_precatorius_NW_020874439.1:32602271-32602284:+MEP40Abrus precatoriusNW_020874439.13260227132602284+14
Ananas_comosus_NC_033628.1:10829393-10829406:-MEP40Ananas comosusNC_033628.11082939310829406-14
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NW_017567401.1:274035-274048:+MEP40Beta vulgaris subsp.  vulgarisNW_017567401.1274035274048+14
Ceratophyllum_demersum_3:62622348-62622361:-MEP40Ceratophyllum demersum36262234862622361-14
Citrus_sinensis_NC_023051.1:16907867-16907880:-MEP40Citrus sinensisNC_023051.11690786716907880-14
Cucumis_melo_NW_007546298.1:3493082-3493095:+MEP40Cucumis meloNW_007546298.134930823493095+14
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030386.1:31366222-31366235:-MEP40Daucus carota subsp.  sativusNC_030386.13136622231366235-14
Erythranthe_guttata_NW_012193127.1:243609-243622:+MEP40Erythranthe guttataNW_012193127.1243609243622+14
Euryale_ferox_22:4765173-4765186:+MEP40Euryale ferox2247651734765186+14
Euryale_ferox_29:1828223-1828236:-MEP40Euryale ferox2918282231828236-14
Jatropha_curcas_NW_023590789.1:21343699-21343712:+MEP40Jatropha curcasNW_023590789.12134369921343712+14
Juglans_regia_NC_049901.1:6336271-6336284:+MEP40Juglans regiaNC_049901.163362716336284+14
Macleaya_cordata_MVGT01001058.1:301129-301142:-MEP40Macleaya cordataMVGT01001058.1301129301142-14
Malus_domestica_NC_041805.1:34704916-34704929:+MEP40Malus domesticaNC_041805.13470491634704929+14
Manihot_esculenta_NC_035162.1:6072738-6072751:+MEP40Manihot esculentaNC_035162.160727386072751+14
Medicago_truncatula_NC_053044.1:32619902-32619915:+MEP40Medicago truncatulaNC_053044.13261990232619915+14
Morus_notabilis_NW_010362736.1:59905-59918:-MEP40Morus notabilisNW_010362736.15990559918-14
Musa_acuminata_subsp._malaccensis_NC_025205.1:25204148-25204161:-MEP40Musa acuminata subsp.  malaccensisNC_025205.12520414825204161-14
Nymphaea_colorata_NC_045146.1:11734932-11734945:-MEP40Nymphaea colorataNC_045146.11173493211734945-14
Panicum_hallii_NC_038050.1:72835306-72835319:-MEP40Panicum halliiNC_038050.17283530672835319-14
Phaseolus_vulgaris_NC_023754.1:20601892-20601905:+MEP40Phaseolus vulgarisNC_023754.12060189220601905+14
Populus_alba_NW_023271948.1:72774-72787:+MEP40Populus albaNW_023271948.17277472787+14
Populus_trichocarpa_NC_037301.1:14744274-14744287:-MEP40Populus trichocarpaNC_037301.11474427414744287-14
Rhodamnia_argentea_NW_022060796.1:5447447-5447460:-MEP40Rhodamnia argenteaNW_022060796.154474475447460-14
Rhododendron_simsii_CM024962.1:30394164-30394177:+MEP40Rhododendron simsiiCM024962.13039416430394177+14
Setaria_italica_NC_028458.1:57763627-57763640:-MEP40Setaria italicaNC_028458.15776362757763640-14
Setaria_viridis_NC_048271.1:55284854-55284867:-MEP40Setaria viridisNC_048271.15528485455284867-14
Sorghum_bicolor_NC_012870.2:79289518-79289531:-MEP40Sorghum bicolorNC_012870.27928951879289531-14
Tripterygium_wilfordii_NC_052244.1:4589380-4589393:+MEP40Tripterygium wilfordiiNC_052244.145893804589393+14
Vigna_angularis_NC_030645.1:19601132-19601145:+MEP40Vigna angularisNC_030645.11960113219601145+14
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028360.1:11036296-11036309:+MEP40Vigna radiata var.  radiataNC_028360.11103629611036309+14
Vigna_unguiculata_NC_040284.1:22812256-22812269:+MEP40Vigna unguiculataNC_040284.12281225622812269+14
Vitis_riparia_NC_048434.1:11006839-11006852:+MEP40Vitis ripariaNC_048434.11100683911006852+14
Vitis_vinifera_NC_012010.3:10612113-10612126:+MEP40Vitis viniferaNC_012010.31061211310612126+14
Ziziphus_jujuba_NC_029682.1:11295000-11295013:+MEP40Ziziphus jujubaNC_029682.11129500011295013+14
Aquilegia_coerulea_KZ305019.1:9761963-9761976:-MEP40Aquilegia coeruleaKZ305019.197619639761976-14
Brachypodium_distachyon_NC_016131.3:73826254-73826267:-MEP40Brachypodium distachyonNC_016131.37382625473826267-14
Citrus_clementina_NW_006262139.1:21417876-21417889:-MEP40Citrus clementinaNW_006262139.12141787621417889-14
Cucumis_sativus_NC_026658.2:356269-356282:-MEP40Cucumis sativusNC_026658.2356269356282-14
Cucurbita_maxima_NW_019272023.1:4618288-4618301:-MEP40Cucurbita maximaNW_019272023.146182884618301-14
Cucurbita_moschata_NW_019268520.1:2308078-2308091:+MEP40Cucurbita moschataNW_019268520.123080782308091+14
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036640.1:4777556-4777569:-MEP40Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036640.147775564777569-14
Eutrema_salsugineum_NW_006256342.1:7593753-7593766:-MEP40Eutrema salsugineumNW_006256342.175937537593766-14
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020491.1:20903674-20903687:-MEP40Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020491.12090367420903687-14
Herrania_umbratica_NW_018397273.1:1692065-1692078:+MEP40Herrania umbraticaNW_018397273.116920651692078+14
Momordica_charantia_NW_019104512.1:1562208-1562221:-MEP40Momordica charantiaNW_019104512.115622081562221-14
Oryza_brachyantha_NC_023165.1:846467-846480:+MEP40Oryza brachyanthaNC_023165.1846467846480+14
Oryza_sativa_Japonica_Group_NC_029258.1:1100238-1100251:+MEP40Oryza sativa Japonica GroupNC_029258.111002381100251+14
Punica_granatum_NC_045131.1:139508-139521:+MEP40Punica granatumNC_045131.1139508139521+14
Sesamum_indicum_NC_026157.1:296343-296356:-MEP40Sesamum indicumNC_026157.1296343296356-14
Theobroma_cacao_NC_030853.1:6128918-6128931:+MEP40Theobroma cacaoNC_030853.161289186128931+14