Cluster ID: MEP39

Size 14
Phase 1
Pfam domain ID Unknown
Exon block sizes in the Microexon-tag 24,22,14,48
Microexon location in the Microexon-tag 3
Microexon-tag DNA Seq GRWGMWGGAGRYATGTAYKSYBTYCAASSTTCTGGAGCYMGKGCAGKTGGATTTCCWCAGATGGSMAATGCTGCAGCMATTGCAGCTGCCTTTGSKGGWGGTTTGCCT
Logo of Microexon-tag DNA Seq Logo
Alignment of exons MSA

MEP39 Microexon Entries

MicroExon IDCluster IDSpeciesChrStartEndStrandSize
At_1:16276430-16276443:-MEP39A. thaliana11627643016276443-14
Gm_10:45433085-45433098:-MEP39G. max104543308545433098-14
Gm_16:32424002-32424015:-MEP39G. max163242400232424015-14
Gm_2:6941544-6941557:-MEP39G. max269415446941557-14
Gm_20:40614918-40614931:+MEP39G. max204061491840614931+14
Ha_5:121912575-121912588:-MEP39H. annuus5121912575121912588-14
Ps_NC_039358.1:38926747-38926760:-MEP39P. somniferumNC_039358.13892674738926760-14
Ps_NC_039363.1:19419868-19419881:-MEP39P. somniferumNC_039363.11941986819419881-14
Vv_7:18175972-18175985:-MEP39V. vinifera71817597218175985-14
Pt_5:20185574-20185587:+MEP39P. trichocarpa52018557420185587+14
Sl_10:62057648-62057661:-MEP39S. lycopersicum106205764862057661-14
Sl_12:11308424-11308437:-MEP39S. lycopersicum121130842411308437-14
Nicotiana_tabacum_NW_015803402.1:20543-20556:-MEP39Nicotiana tabacumNW_015803402.12054320556-14
Nicotiana_tabacum_NW_015892102.1:32256-32269:-MEP39Nicotiana tabacumNW_015892102.13225632269-14
Nicotiana_tabacum_NW_015931866.1:48332-48345:-MEP39Nicotiana tabacumNW_015931866.14833248345-14
Nicotiana_sylvestris_NW_009547739.1:7584-7597:+MEP39Nicotiana sylvestrisNW_009547739.175847597+14
Nicotiana_sylvestris_NW_009511575.1:2092-2105:-MEP39Nicotiana sylvestrisNW_009511575.120922105-14
Nicotiana_sylvestris_NW_009540234.1:35400-35413:-MEP39Nicotiana sylvestrisNW_009540234.13540035413-14
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008905832.1:36694-36707:+MEP39Nicotiana tomentosiformisNW_008905832.13669436707+14
Nicotiana_tomentosiformis_NW_008949941.1:77683-77696:-MEP39Nicotiana tomentosiformisNW_008949941.17768377696-14
Camellia_sinensis_NW_021025508.1:1268094-1268107:+MEP39Camellia sinensisNW_021025508.112680941268107+14
Nicotiana_attenuata_NC_031998.1:41882991-41883004:+MEP39Nicotiana attenuataNC_031998.14188299141883004+14
Nicotiana_attenuata_NC_031991.1:15113602-15113615:-MEP39Nicotiana attenuataNC_031991.11511360215113615-14
Capsicum_annuum_NC_029986.1:200171255-200171268:+MEP39Capsicum annuumNC_029986.1200171255200171268+14
Capsicum_annuum_NW_015960458.1:1609343-1609356:-MEP39Capsicum annuumNW_015960458.116093431609356-14
Colocasia_esculenta_CM024755.1:9709908-9709921:-MEP39Colocasia esculentaCM024755.197099089709921-14
Colocasia_esculenta_CM024766.1:115197558-115197571:-MEP39Colocasia esculentaCM024766.1115197558115197571-14
Lactuca_sativa_NW_019677815.1:957737-957750:+MEP39Lactuca sativaNW_019677815.1957737957750+14
Papaver_somniferum_NC_039358.1:38926747-38926760:-MEP39Papaver somniferumNC_039358.13892674738926760-14
Papaver_somniferum_NC_039363.1:19419868-19419881:-MEP39Papaver somniferumNC_039363.11941986819419881-14
Hevea_brasiliensis_NW_018745908.1:885250-885263:+MEP39Hevea brasiliensisNW_018745908.1885250885263+14
Liriodendron_chinense_PVNU02000034.1:69398-69411:+MEP39Liriodendron chinensePVNU02000034.16939869411+14
Liriodendron_chinense_ML058394.1:3542771-3542784:+MEP39Liriodendron chinenseML058394.135427713542784+14
Liriodendron_chinense_PVNU02000828.1:861207-861220:+MEP39Liriodendron chinensePVNU02000828.1861207861220+14
Liriodendron_chinense_PVNU02000939.1:32989-33002:-MEP39Liriodendron chinensePVNU02000939.13298933002-14
Persea_americana_SDSS01000713.1:298514-298527:+MEP39Persea americanaSDSS01000713.1298514298527+14
Persea_americana_SDSS01001111.1:140875-140888:-MEP39Persea americanaSDSS01001111.1140875140888-14
Persea_americana_SDSS01001278.1:84730-84743:-MEP39Persea americanaSDSS01001278.18473084743-14
Prosopis_alba_NW_021636640.1:1169239-1169252:+MEP39Prosopis albaNW_021636640.111692391169252+14
Quercus_suber_NW_019811223.1:158629-158642:-MEP39Quercus suberNW_019811223.1158629158642-14
Glycine_soja_NC_041021.1:43674223-43674236:+MEP39Glycine sojaNC_041021.14367422343674236+14
Glycine_soja_NC_041011.1:46977651-46977664:-MEP39Glycine sojaNC_041011.14697765146977664-14
Actinidia_rufa_BJWL01000471.1:143604-143617:+MEP39Actinidia rufaBJWL01000471.1143604143617+14
Actinidia_rufa_BJWL01000004.1:5985852-5985865:-MEP39Actinidia rufaBJWL01000004.159858525985865-14
Actinidia_rufa_BJWL01000004.1:6177603-6177616:-MEP39Actinidia rufaBJWL01000004.161776036177616-14
Amborella_trichopoda_NW_006498233.1:866132-866145:+MEP39Amborella trichopodaNW_006498233.1866132866145+14
Amborella_trichopoda_NW_006499922.1:626207-626220:-MEP39Amborella trichopodaNW_006499922.1626207626220-14
Benincasa_hispida_NC_052352.1:59838278-59838291:-MEP39Benincasa hispidaNC_052352.15983827859838291-14
Cajanus_cajan_NW_017984101.1:444279-444292:+MEP39Cajanus cajanNW_017984101.1444279444292+14
Cannabis_sativa_NC_044370.1:26470518-26470531:-MEP39Cannabis sativaNC_044370.12647051826470531-14
Cicer_arietinum_NC_021161.1:7030579-7030592:+MEP39Cicer arietinumNC_021161.170305797030592+14
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000004.1:19822850-19822863:+MEP39Cinnamomum micranthumQPKB01000004.11982285019822863+14
Cinnamomum_micranthum_QPKB01000002.1:75628692-75628705:-MEP39Cinnamomum micranthumQPKB01000002.17562869275628705-14
Dioscorea_cayenensis_subsp._rotundata_NC_052495.1:479250-479263:-MEP39Dioscorea cayenensis subsp.  rotundataNC_052495.1479250479263-14
Durio_zibethinus_NW_019167949.1:7518637-7518650:+MEP39Durio zibethinusNW_019167949.175186377518650+14
Eucalyptus_grandis_NC_052617.1:37894890-37894903:-MEP39Eucalyptus grandisNC_052617.13789489037894903-14
Eucalyptus_grandis_NC_052617.1:54495094-54495107:-MEP39Eucalyptus grandisNC_052617.15449509454495107-14
Glycine_max_NC_038256.1:40614918-40614931:+MEP39Glycine maxNC_038256.14061491840614931+14
Glycine_max_NC_038246.1:45433085-45433098:-MEP39Glycine maxNC_038246.14543308545433098-14
Ipomoea_nil_NW_017619254.1:3742613-3742626:+MEP39Ipomoea nilNW_017619254.137426133742626+14
Lupinus_angustifolius_NW_017719934.1:10888-10901:+MEP39Lupinus angustifoliusNW_017719934.11088810901+14
Populus_euphratica_NW_011499975.1:376730-376743:+MEP39Populus euphraticaNW_011499975.1376730376743+14
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988479.1:363314-363327:+MEP39Pyrus x bretschneideriNW_008988479.1363314363327+14
Pyrus_x_bretschneideri_NW_008988629.1:220513-220526:-MEP39Pyrus x bretschneideriNW_008988629.1220513220526-14
Quercus_lobata_NC_044909.1:31238684-31238697:+MEP39Quercus lobataNC_044909.13123868431238697+14
Solanum_lycopersicum_NC_015447.3:62057648-62057661:-MEP39Solanum lycopersicumNC_015447.36205764862057661-14
Solanum_lycopersicum_NC_015449.3:11308424-11308437:-MEP39Solanum lycopersicumNC_015449.31130842411308437-14
Solanum_pennellii_NC_028648.1:12520853-12520866:+MEP39Solanum pennelliiNC_028648.11252085312520866+14
Solanum_pennellii_NC_028646.1:78812214-78812227:-MEP39Solanum pennelliiNC_028646.17881221478812227-14
Solanum_tuberosum_NW_006239022.1:554229-554242:-MEP39Solanum tuberosumNW_006239022.1554229554242-14
Solanum_tuberosum_NW_006239057.1:1424257-1424270:-MEP39Solanum tuberosumNW_006239057.114242571424270-14
Syzygium_oleosum_NW_022076632.1:165007-165020:+MEP39Syzygium oleosumNW_022076632.1165007165020+14
Syzygium_oleosum_NW_022076657.1:755573-755586:+MEP39Syzygium oleosumNW_022076657.1755573755586+14
Abrus_precatorius_NW_020874417.1:31539568-31539581:-MEP39Abrus precatoriusNW_020874417.13153956831539581-14
Beta_vulgaris_subsp._vulgaris_NC_025817.2:7163492-7163505:+MEP39Beta vulgaris subsp.  vulgarisNC_025817.271634927163505+14
Cucumis_melo_NW_007546340.1:488226-488239:+MEP39Cucumis meloNW_007546340.1488226488239+14
Daucus_carota_subsp._sativus_NC_030384.1:21821061-21821074:-MEP39Daucus carota subsp.  sativusNC_030384.12182106121821074-14
Ipomoea_triloba_NC_044924.1:7101951-7101964:+MEP39Ipomoea trilobaNC_044924.171019517101964+14
Juglans_regia_NC_049910.1:8355327-8355340:+MEP39Juglans regiaNC_049910.183553278355340+14
Macleaya_cordata_MVGT01004081.1:224065-224078:-MEP39Macleaya cordataMVGT01004081.1224065224078-14
Malus_domestica_NC_041792.1:5222828-5222841:+MEP39Malus domesticaNC_041792.152228285222841+14
Malus_domestica_NW_021639180.1:43010-43023:-MEP39Malus domesticaNW_021639180.14301043023-14
Medicago_truncatula_NC_053042.1:48004496-48004509:-MEP39Medicago truncatulaNC_053042.14800449648004509-14
Morus_notabilis_NW_010365770.1:117112-117125:+MEP39Morus notabilisNW_010365770.1117112117125+14
Phaseolus_vulgaris_NC_023753.1:8044237-8044250:+MEP39Phaseolus vulgarisNC_023753.180442378044250+14
Populus_alba_NW_023271789.1:4555643-4555656:-MEP39Populus albaNW_023271789.145556434555656-14
Populus_trichocarpa_NC_037289.1:21162208-21162221:+MEP39Populus trichocarpaNC_037289.12116220821162221+14
Prunus_avium_NW_018921414.1:227254-227267:-MEP39Prunus aviumNW_018921414.1227254227267-14
Rhodamnia_argentea_NW_022060796.1:3931687-3931700:+MEP39Rhodamnia argenteaNW_022060796.139316873931700+14
Rhodamnia_argentea_NW_022060903.1:181611-181624:-MEP39Rhodamnia argenteaNW_022060903.1181611181624-14
Rhododendron_simsii_CM024963.1:19673597-19673610:+MEP39Rhododendron simsiiCM024963.11967359719673610+14
Ricinus_communis_NW_002994439.1:144708-144721:+MEP39Ricinus communisNW_002994439.1144708144721+14
Rosa_chinensis_NC_037093.1:36249275-36249288:+MEP39Rosa chinensisNC_037093.13624927536249288+14
Vigna_angularis_NC_030638.1:28103959-28103972:-MEP39Vigna angularisNC_030638.12810395928103972-14
Vigna_radiata_var._radiata_NC_028358.1:38977897-38977910:-MEP39Vigna radiata var.  radiataNC_028358.13897789738977910-14
Vigna_unguiculata_NC_040285.1:33608837-33608850:-MEP39Vigna unguiculataNC_040285.13360883733608850-14
Vitis_riparia_NC_048437.1:2738897-2738910:+MEP39Vitis ripariaNC_048437.127388972738910+14
Vitis_vinifera_NC_012013.3:18175972-18175985:-MEP39Vitis viniferaNC_012013.31817597218175985-14
Cucumis_sativus_NC_026660.2:1984929-1984942:+MEP39Cucumis sativusNC_026660.219849291984942+14
Cucurbita_maxima_NW_019272079.1:362815-362828:+MEP39Cucurbita maximaNW_019272079.1362815362828+14
Cucurbita_maxima_NW_019272068.1:474290-474303:-MEP39Cucurbita maximaNW_019272068.1474290474303-14
Cucurbita_moschata_NW_019268556.1:1505109-1505122:-MEP39Cucurbita moschataNW_019268556.115051091505122-14
Cucurbita_moschata_NW_019268590.1:764740-764753:-MEP39Cucurbita moschataNW_019268590.1764740764753-14
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036643.1:9136761-9136774:+MEP39Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036643.191367619136774+14
Cucurbita_pepo_subsp._pepo_NC_036639.1:7675113-7675126:-MEP39Cucurbita pepo subsp.  pepoNC_036639.176751137675126-14
Fragaria_vesca_subsp._vesca_NC_020492.1:13876718-13876731:+MEP39Fragaria vesca subsp.  vescaNC_020492.11387671813876731+14
Herrania_umbratica_NW_018397260.1:1664141-1664154:-MEP39Herrania umbraticaNW_018397260.116641411664154-14
Momordica_charantia_NW_019104569.1:540001-540014:+MEP39Momordica charantiaNW_019104569.1540001540014+14
Momordica_charantia_NW_019104569.1:639332-639345:-MEP39Momordica charantiaNW_019104569.1639332639345-14
Prunus_dulcis_NC_047657.1:3170770-3170783:+MEP39Prunus dulcisNC_047657.131707703170783+14
Prunus_mume_NC_024131.1:18411533-18411546:-MEP39Prunus mumeNC_024131.11841153318411546-14
Prunus_persica_NC_034016.1:3359601-3359614:+MEP39Prunus persicaNC_034016.133596013359614+14
Punica_granatum_NC_045130.1:6656576-6656589:-MEP39Punica granatumNC_045130.166565766656589-14
Theobroma_cacao_NC_030857.1:15910840-15910853:+MEP39Theobroma cacaoNC_030857.11591084015910853+14